Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.301148 4921516M08RikRIKEN cDNA 4921516M08 gene 13    70889 
 Mm.301148 Taf9TAF9 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor 13    108143 
 Gene Ontology DNA binding | general RNA polymerase II transcription factor activity | nucleus | protein C-terminus binding | regulation of transcription, DNA-dependent | transcription coactivator activity | transcription factor TFIID complex | transcription from Pol II promoter | transcription initiation
 Human Homolog TAF9[TAF9 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 32kDa]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 63 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATGATGATGA (2)
GTTATTTTGG
TTAGATGTTT (2)
29.40.0294
Cb medulloblastomaATGATGATGA (2)
GTTATTTTGG
TTAGATGTTT (2)
11.50.0115
P8 GC+1d cultureATGATGATGA (2)
GTTATTTTGG
TCAGTTTACT (2)
TTAGATGTTT (2)
170.017
P8 GC+SHH+1d cultureATGATGATGA (2)
GTTATTTTGG
TTAGATGTTT (2)
31.60.0316
3T3 fibroblastsGTTATTTTGG
TACAGATTGC
140.014
E15 cortexGTTATTTTGG
9.90.0099
P1 cortexGTTATTTTGG
TTAGATGTTT (2)
18.20.0182
HypothalamusGTTATTTTGG
TTAGATGTTT (2)
12.70.0127
E12.5 retinaATGATGATGA (2)
CATCGTGGCT (2)
GTTATTTTGG
TCAGTTTACT (2)
TTAGATGTTT (2)
35.80.0358
E14.5 retinaATGATGATGA (2)
GTTATTTTGG
TTAGATGTTT (2)
29.10.0291
E16.5 retinaATGATGATGA (2)
CATCGTGGCT (2)
GTTATTTTGG
TCAGTTTACT (2)
TTAGATGTTT (2)
180.018
E18.5 retinaATGATGATGA (2)
GTTATTTTGG
TACAGATTGC
TCAGTTTACT (2)
TTAGATGTTT (2)
45.50.0455
P0.5 retinaATGATGATGA (2)
GTTATTTTGG
TCAGTTTACT (2)
TTAGATGTTT (2)
43.10.0431
P2.5 retinaATGATGATGA (2)
CATCGTGGCT (2)
GTTATTTTGG
TCAGTTTACT (2)
TTAGATGTTT (2)
54.50.0545
P4.5 retinaGTTATTTTGG
TCAGTTTACT (2)
TTAGATGTTT (2)
23.80.0238
P6.5 retinaATGATGATGA (2)
GTTATTTTGG
TTAGATGTTT (2)
100.01
P10.5 crx- retinaGTTATTTTGG
TTAGATGTTT (2)
20.50.0205
P10.5 crx+ retinaGTTATTTTGG
TTAGATGTTT (2)
9.60.0096
Adult retinalGTTATTTTGG
TACAGATTGC
TTAGATGTTT (2)
7.50.0075
ONLATGATGATGA (2)
GTTATTTTGG
TTAGATGTTT (2)
9.50.0095