Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.301259 Tuba1tubulin, alpha 1 15  15 F1 (15 60.4 cM)  22142 
 Gene Ontology GTP binding | microtubule | microtubule-based movement | microtubule-based process | structural constituent of cytoskeleton | structural molecule activity
 Human Homolog TUBA3[tubulin, alpha 3]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 461 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACTTTTGGAA (4)
ATGTCTCAAA
CACGCTCCCG
CCCTCACCCA (2)
CTGAGCAACA (2)
CTTTGGCTGA
GAAAAAAAAA (2)
GAGGAGGGTG
GCATCCAGCC
GCGAGGGTCA
GCTGCCCTAA (2)
GCTGCCCTAC (2)
GCTGCCCTAG (2)
GCTGCCCTAT
GCTGCCTTAG (2)
GCTTGCTGCC
GGGGGAGGGA (2)
GTAGACAATG
GTAGGCTTTC
GTCACGATGT
TCCTCACGGG
TGCCCCGGGC
TGCTGCCATT (2)
TTGGAGCTGG
TTGGCCAGGC
923.40.9234
Cb medulloblastomaACTTTTGGAA (4)
AGAGGGTGAG
ATGTCTCAAA
CACGCTCCCG
CCCTCACCCA (2)
CTTTAAGTTT (2)
GAAAAAAAAA (2)
GAGGAGGGTG
GCATCCAGCC
GCGAGGGTCA
GCTGCCCTAG (2)
GTAGACAATG
GTCACGATGT
TCCTCACGGG
TGCCCCGGGC
TTGGAGCTGG
4460.446
P8 GC+1d cultureAAGGCACAAT
AGCAGCTTTC
AGCAGTTTCT
ATGTCTCAAA
CACGCTCCCG
CCCTCACCCA (2)
CTGAGCAACA (2)
CTTTGGCTGA
GAAAAAAAAA (2)
GAAAGAGAAA (3)
GAGGAGGGTG
GATGTTCTGA
GCATCCAGCC
GCGAGGGTCA
GCTGCCATTG
GCTGCCCTAA (2)
GCTGCCCTAC (2)
GCTGCCCTAG (2)
GCTGCCCTAT
GCTGTCCTAG (2)
GCTTGCTGCC
GGACATTTAA
GGGATGGGCC
GGGGGAGGGA (2)
GTAGACAATG
GTAGGCTTTC
GTCACGATGT
GTTGCCCTAG
TCCTCACGGG
TGCCCCGGGC
TGCTGCCATT (2)
TTGGAGCTGG
TTTGGTGTTT (7)
819.20.8192
P8 GC+SHH+1d cultureAAGGCACAAT
AGCAGTTTCT
ATGTCTCAAA
CACACAGCTC
CACGCTCCCG
CCCTCACACA (2)
CCCTCACCCA (2)
CTGAGCAACA (2)
CTTTGGCTGA
GAAAAAAAAA (2)
GAAAATGGTG
GAAAGAGAAA (3)
GAGGAGGGTG
GATGTTCTGA
GCATCCAGCC
GCTGCCATTG
GCTGCCCTAC (2)
GCTGCCCTAG (2)
GCTGCCCTAT
GCTTGCTGCC
GGGGGAGGGA (2)
GTAAGAAAAA (2)
GTAGACAATG
GTAGGCTTTC
GTCACGATGT
GTGCACACAG
TCCTCACGGG
TGCCCCGGGC
TGCTGCCATT (2)
TTGGAGCTGG
TTGGCCAGGC
856.30.8563
3T3 fibroblastsAAGGCACAAT
ATGTCTCAAA
CACGCTCCCG
CCCTCACACA (2)
CTGAGCAACA (2)
CTGCTGAGCA
GAGGAGGGTG
GCTGCCCTAG (2)
GGGGGAGGGA (2)
GTAGACAATG
TCCTCACGGG
TGCTGCCATT (2)
TTGGAGCTGG
567.80.5678
E15 cortexACTTTTGGAA (4)
AGAACTTAAA (3)
ATGTCTCAAA
CACGCTCCCG
CCCTCACCCA (2)
CTGAGCAACA (2)
GAAAAAAAAA (2)
GAGGAGGGTG
GCATCCAGCC
GCGAGGGTCA
GCTGCCATTG
GCTGCCCTAA (2)
GCTGCCCTAG (2)
GCTGCCTAGA
GCTGTCCTAG (2)
GCTTGCTGCC
GGCTGCCCTA
TGCCCCGGGC
TGCTGCCATT (2)
TTGGAGCTGG
2305.32.3053
P1 cortexAAGGCACAAT
ATGTCTCAAA
CACACAGCTC
CACGCTCCCG
CCCTCACCCA (2)
GAAAAAAAAA (2)
GATGTTCTGA
GCATCCAGCC
GCTGCCATTG
GCTGCCCTAA (2)
GCTGCCCTAC (2)
GCTGCCCTAG (2)
GCTGCCCTAT
GCTGCCTAGA
GCTGCCTTAG (2)
GCTGTCCTAG (2)
GCTTGCTGCC
GGCTGCCCTA
GTCACGATGT
GTTGCCCTAG
TGCCCCGGGC
TTGGAGCTGG
TTTATTGTGT
1522.11.5221
HypothalamusAAGGCACAAT
ACTTTTGGAA (4)
AGCAGTTTCT
AGGAGGTGAG
ATGTCTCAAA
CACGCTCCCG
CCCTCACCCA (2)
CTGAGCAACA (2)
CTTTAAGTTT (2)
CTTTGGCTGA
GAAAAAAAAA (2)
GAAAGGAGGG
GAGGAGGGTG
GCGAGGGTCA
GCTGCCCTAC (2)
GCTGCCCTAG (2)
GTAGACAATG
GTAGGCTTTC
TCCTCACGGG
TGCCCCGGGC
TTGGAGCTGG
432.60.4326
E12.5 retinaAAGGCACAAT
ACTTTTGGAA (4)
AGAGGGTGAG
ATGTCTCAAA
CACACAGACA (3)
CACGCTCCCG
CTGAGCAACA (2)
CTTTAAGTTT (2)
CTTTGGCTGA
GAAAAAAAAA (2)
GAAAGGAGGG
GAGGAGGGTG
GCGAGGGTCA
GCTGCCATTG
GCTGCCCTAA (2)
GCTGCCCTAG (2)
GCTGTCCTAG (2)
GTCACGATGT
GTGCACACAG
TCCTCACGGG
TGCCCCCGGG
TGCCCCGGGA (2)
TGCTGCCATT (2)
TTGGAGCTGG
1102.51.1025
E14.5 retinaAAGGCACAAT
AGAACTTAAA (3)
AGCAGTTTCT
AGGAGGTGAG
ATGAGCAACA
ATGTCTCAAA
CACACAGCTC
CACGCTCCCG
CCCTCACCCA (2)
CTGAGCAACA (2)
CTTTGGCTGA
GAAAAAAAAA (2)
GAAAATGGTG
GAGGAGGGTG
GCGAGGGTCA
GCTGCCCTAG (2)
GGGATGGGCC
GGGGGAGGGA (2)
GTAGACAATG
GTGATGCTTC
GTGCACACAG
TCCTCACGGG
TGCCCCGGGA (2)
TGCCCCGGGC
TGCTGCCATT (2)
TTGGAGCTGG
TTGGCCAGGC
955.9999999999990.955999999999999
E16.5 retinaAAGGCACAAT
AGAACTTAAA (3)
AGAGGGTGAG
AGCAGCTTTC
AGGAGGTGAG
ATGTCTCAAA
CACACAGACA (3)
CACACAGCTC
CACGCTCCCG
CCCTCACACA (2)
CCCTCACCCA (2)
CTGAGCAACA (2)
CTTTGGCTGA
GAAAAAAAAA (2)
GAGGAGGGTG
GCATCCAGCC
GCGAGGGTCA
GCTGCCATTG
GCTGCCCTAA (2)
GCTGCCCTAC (2)
GCTGCCCTAG (2)
GCTTGCTGCC
GGCTGCCCTA
GTAAGAAAAA (2)
GTAGACAATG
GTAGGCTTTC
TCCTCACGGG
TGCCCCCGGG
TGCCCCGGGC
TGCTGCCATT (2)
TTGGAGCTGG
TTGGCCAGGC
999.30.9993
E18.5 retinaAAGGCACAAT
ATGTCTCAAA
CACGCTCCCG
CCCTCACCCA (2)
CTTTGGCTGA
GAAAAAAAAA (2)
GAAAATGGTG
GAGGAGGGTG
GCATCCAGCC
GCGAGGGTCA
GCTGCCATTG
GCTGCCCTAA (2)
GCTGCCCTAC (2)
GCTGCCCTAG (2)
GGGATATTTA
GGGATGGGCC
GTAGACAATG
GTGCACACAG
TCCTCACGGG
TGCCCCCGGG
TGCCCCGGGC
TGCTGCCATT (2)
TTGGAGCTGG
TTGGCCAGGC
TTTATTGTGT
1076.41.0764
P0.5 retinaAGAGGGTGAG
AGCAGTTTCT
ATGTCTCAAA
CACACAGACA (3)
CACGCTCCCG
CCCTCACCCA (2)
CTGAGCAACA (2)
CTGCTGAGCA
CTTTGGCTGA
GAAAAAAAAA (2)
GAAAATGGTG
GAAAGAGAAA (3)
GAGCAGTTTC (2)
GAGGAGGGTG
GATGGAGATG (2)
GCGAGGGTCA
GCTGCCCTAA (2)
GCTGCCCTAC (2)
GCTGCCCTAG (2)
GCTGCCCTAT
GCTGCCTTAG (2)
GCTTGCTGCC
GGCTGCCCTA
GGGATATTTA
GGGATGGGCC
GTAGACAATG
GTAGGCTTTC
GTCACGATGT
TCCTCACGGG
TGCCCCGGGC
TGCTGCCATT (2)
TTGGAGCTGG
8760.876
P2.5 retinaAAGGCACAAT
ACTTTTGGAA (4)
AGCAGTTTCT
ATGTCTCAAA
CACACAGACA (3)
CACGCTCCCG
CTGAGCAACA (2)
CTTTGGCTGA
GAAAAAAAAA (2)
GAAAGAGAAA (3)
GCATCCAGCC
GCTGCCCTAA (2)
GCTGCCCTAG (2)
GCTGCCTTAG (2)
GGACATTTAA
GGCTGCCCTA
GTAGACAATG
GTCACGATGT
GTTGCCCTAG
TGCTGCCATT (2)
TTGGAGCTGG
827.70.8277
P4.5 retinaATGTCTCAAA
CACACAGCTC
CACGCTCCCG
CTGAGCAACA (2)
GAAAAAAAAA (2)
GATGGAGATG (2)
GCTGCCCTAA (2)
GCTGCCCTAC (2)
GCTGCCCTAG (2)
GGACATTTAA
GGGGGAGGGA (2)
GTCACGATGT
TCCTCACGGG
TGCTGCCATT (2)
TTGGAGCTGG
695.70.6957
P6.5 retinaAAGGCACAAT
ATGTCTCAAA
CACACAGACA (3)
CACGCTCCCG
CTGAGCAACA (2)
CTTTGGCTGA
GAAAAAAAAA (2)
GAAAGGAGGG
GATGGAGATG (2)
GCATCCAGCC
GCGAGGGTCA
GCTGCCCTAA (2)
GCTGCCCTAC (2)
GCTGCCCTAG (2)
GCTGCCCTAT
GCTGCCTAGA
GCTTGCTGCC
GGGGGAGGGA (2)
GTAGACAATG
GTCACGATGT
GTGCACACAG
TCCTCACGGG
TGCCCCGGGC
TGCTGCCATT (2)
TTGGAGCTGG
TTTGGTGTTT (7)
500.30.5003
P10.5 crx- retinaAAGGCACAAT
ACTTTTGGAA (4)
AGAGGGTGAG
AGCAGTTTCT
AGGAGGTGAG
ATGTCTCAAA
CTGAGCAACA (2)
CTTTGGCTGA
GAAAAAAAAA (2)
GAGGAGGGTG
GCATCCAGCC
GCTGCCCTAA (2)
GCTGCCCTAG (2)
GCTGCCTTAG (2)
GCTTGCTGCC
GGCTGCCCTA
GTAAGAAAAA (2)
GTAGACAATG
GTAGGCTTTC
TCCTCACGGG
TGCCCCCGGG
TGCCCCGGGC
TTGGCCAGGC
TTTGGTGTTT (7)
635.70.6357
P10.5 crx+ retinaAAGGCACAAT
AGAGGGTGAG
AGCAGCTTTC
AGCAGTTTCT
ATGTCTCAAA
CACACAGACA (3)
CTGCTGAGCA
CTTTAAGTTT (2)
CTTTGGCTGA
GAAAAAAAAA (2)
GAAAGAGAAA (3)
GCTGCCCTAA (2)
GCTGCCCTAG (2)
GCTTGCTGCC
GGGGGAGGGA (2)
GTCACGATGT
GTTGCCCTAG
TTGGAGCTGG
TTGGCCAGGC
526.40.5264
Adult retinalAAGGCACAAT
AGAGGGTGAG
AGCAGTTTCT
ATGAACACTG (9)
ATGAGCAACA
ATGTCTCAAA
CACACAGACA (3)
CACGCTCCCG
GAAAAAAAAA (2)
GAGGAGGGTG
GCTGCCCTAC (2)
GCTGCCCTAG (2)
GCTGCCCTAT
GGGATATTTA
GTAGACAATG
GTTGCCCTAG
TGCCCCGGGC
TTGGAGCTGG
TTTGGTGTTT (7)
2430.243
ONLAGAGGGTGAG
AGCAGTTTCT
ATGAACACTG (9)
ATGAGCAACA
ATGTCTCAAA
CACACAGACA (3)
CACGCTCCCG
GAAAAAAAAA (2)
GAAAGAGAAA (3)
GCTGCCCTAG (2)
GCTGCCTAGA
GCTGTCCTAG (2)
GTCACGATGT
TGCCCCGGGC
TTGGAGCTGG
258.30.2583