Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.30929	9530001N24Rik	RIKEN cDNA 9530001N24 gene	4		77436
Mm.30929	Prdx1	peroxiredoxin 1	4	4 47.0 cM	18477
Gene Ontology	antioxidant activity | oxidoreductase activity | peroxidase activity | response to oxidative stress
Human Homolog	PRDX1[peroxiredoxin 1]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 144 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AACATTCCCT (2) ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GAGGTGGTGG (4) GATTAAAACA GTGGAAGCTG (2) GTTGGAACCT (3) TCTTTAGGTT (2) TGTACCATTA (3) TGTTTAAGCA (2) TTTGTCAGTG (2) 76.6 0.0766 Cb medulloblastoma ATGTGGTGTG (2) GATTAAAACA GATTACCATA (2) GGGGAGGTTG TGTACCATTA (3) TTTTTAAGCA (2) 62.3 0.0623 P8 GC+1d culture ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GATGTGGGTG (2) GATTAAAACA GTTGGAACCT (3) 45.6 0.0456 P8 GC+SHH+1d culture ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GATTAAAACA GTGAATGTTT GTTGGAACCT (3) TCCCTGAAAA (2) TGTACCATTA (3) 55.1 0.0551 3T3 fibroblasts ATGTGGTGTG (2) GAGGTGGTGG (4) GATGTGGGTG (2) GTTGGAACCT (3) 45.5 0.0455 E15 cortex GAGGTGGTGG (4) GGGGAGGTTG 14.8 0.0148 P1 cortex ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GATTAAAACA GGGGAGGTTG 54.5 0.0545 Hypothalamus ATGTGGTGTG (2) GATTAAAACA GGGGAGGTTG TGTTTAAGCA (2) TTTGTCAGTG (2) 38 0.038 E12.5 retina AACATTCCCT (2) ATGCGGTGTG (2) ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GATTAAAACA GATTACCATA (2) GGGGAGGTTG GTAACAAAAA GTGGAAGCTG (2) GTTGGAACCT (3) TCTTTAGGTT (2) TGTACCATTA (3) 73.4 0.0734 E14.5 retina ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GATTAAAACA GTGAAGTGTG GTTGGAACCT (3) TTTGTCAGTG (2) TTTTTAAGCA (2) 52.8 0.0528 E16.5 retina AACATTCCCT (2) ATGTGGGTGT (2) ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GATTAAAACA GATTACCATA (2) GTGAATGTTT GTGGAAGCTG (2) TCCCTGAAAA (2) TTTGTCAGTG (2) 59.6 0.0596 E18.5 retina ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GATTAAAACA GTTGGAACCT (3) TGTACCATTA (3) TGTTTAAGCA (2) TTTGTCAGTG (2) 61.9 0.0619 P0.5 retina AGGGGGGATC ATGCGGTGTG (2) ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GATTAAAACA GCCTTTTATG GGGGAGGTTG GTAACAAAAA GTTGGAACCT (3) TGTTTAAGCA (2) 57.1 0.0571 P2.5 retina ATGTGGGTGT (2) ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GATTAAAACA GGGGAGGTTG GTGGAAGCTG (2) TCTTTAGGTT (2) 59.9 0.0599 P4.5 retina AACATTCCCT (2) ATGTGGGTGT (2) ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GATGTGGGTG (2) GATTAAAACA GTTGGAACCT (3) 59.5 0.0595 P6.5 retina AACATTCCTT (2) ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GATTAAAACA GCCTTTTATG GGGGAGGTTG GTGGAAGCTG (2) GTTGGAACCT (3) TCCCTGAAAA (2) TCTTTAGGTT (2) 60.1 0.0601 P10.5 crx- retina AACATTCCTT (2) ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GATTAAAACA GCCTTTTATG GGGGAGGTTG GTGAATGTTT GTGGAAGCTG (2) TGTACCATTA (3) TTTTTAAGCA (2) 83.9 0.0839 P10.5 crx+ retina AGGGGGGATC ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GATTAAAACA GTAACAAAAA GTTGGAACCT (3) TCCCTGAAAA (2) TCTTTAGGTT (2) TGTACCATTA (3) 59.4 0.0594 Adult retinal AGGGGGGATC ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GATTAAAACA GGGGAGGTTG GTTGGAACCT (3) 33.5 0.0335 ONL ATGTGGTGTG (2) CCTTTATTCC (3) GATTAAAACA GTTGGAACCT (3) TTTTTAAGCA (2) 26.8 0.0268