Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.333399 LOC380687similar to glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 4    380687 
 Mm.333399 Gapdglyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 6  6 56.0 cM  407972 
 Mm.333399 LOC14433similar to glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 2    14433 
 Human Homolog GAPD[glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 157 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGGTCCACCA (3)
CCATCACTGC
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
GTCTCCAAGG
TACGACGAGT
TTCCAGCTAC
TTCCAGTATG (3)
TTTGTGATGG (4)
114.20.1142
Cb medulloblastomaAGGTCCACCA (3)
CCATCACTGC
GAGAAGGCCG (3)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
GTGGTGAAGA (3)
TAGTTGAGGT (4)
TTCCAGCTAC
TTCCAGTATG (3)
TTTGTGATGG (4)
163.90.1639
P8 GC+1d cultureAGGTCCACCA (3)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTCCAGGG
GCCTTCCGTG (4)
GCTTCCAAGG (2)
TACGACGAGT
TTCCAGCTAC
TTCCAGTATG (3)
TTTGTGATGG (4)
117.40.1174
P8 GC+SHH+1d cultureACCTCCAAGG
AGGTCCACCA (3)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
GTCTCCAAGG
GTGGTGAAGA (3)
TACGACGAGT
TAGTTGAGGT (4)
TTCCAGCTAC
168.70.1687
3T3 fibroblastsACCTCCAAGG
GCCTCCAAGG (5)
GCCTCCAGGG
GCCTCCCAAG (2)
GCCTTCCGTG (4)
GCTCCAAGGA (3)
GTGGTGAAGA (3)
TTCCAGCTAC
490.60.4906
E15 cortexGAGAAGGCCG (3)
GCCTCCAAGG (5)
TACGACGAGT
TTCCAGTATG (3)
TTTGTGATGG (4)
158.20.1582
P1 cortexGCCTCCAAGG (5)
GCTCCAAGGA (3)
TACGACGAGT
131.70.1317
HypothalamusACCTTCCTGT
AGGTCCACCA (3)
CCAGTGAGCT (4)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
TAGTTGAGGT (4)
TTCCAGCTAC
TTCCAGTATG (3)
TTTGTGATGG (4)
104.90.1049
E12.5 retinaACCTTCCTGT
CCAGTGAGCT (4)
CCATCACTGC
GCCTCCAAGG (5)
TAGTTGAGGT (4)
TTCCAGCTAC
TTTGTGATGG (4)
264.70.2647
E14.5 retinaAGGTCCACCA (3)
CCATCACTGC
GCCTCCAAGG (5)
GTGGTGAAGA (3)
TTCCACTATG (3)
TTCCAGCTAC
TTCCAGTATG (3)
TTTGTGATGG (4)
78.20.0782
E16.5 retinaAGGTCCACCA (3)
CCAGTGAGCT (4)
CCATCACTGC
GAGAAGGCCG (3)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
TTCCAGCTAC
TTTGTGATGG (4)
117.60.1176
E18.5 retinaAGGTCCACCA (3)
CCATCACTGC
GCCTCCAAGG (5)
GTGGTGAAGA (3)
TAGTTGAGGT (4)
TTCCACTATG (3)
TTCCAGCTAC
TTTGTGATGG (4)
132.70.1327
P0.5 retinaACCTCCAAGG
CCAGTGAGCT (4)
CCATCACTGC
GCCTCCAAGG (5)
GCCTCCCAAG (2)
GCCTTCCGTG (4)
GTCTCCAAGG
GTGGTGAAGA (3)
TACGACGAGT
TTCCAGCTAC
263.20.2632
P2.5 retinaGAGAAGGCCG (3)
GCCTCCAAGG (5)
GTGGTGAAGA (3)
TTCCAGCTAC
188.40.1884
P4.5 retinaACCTCCAAGG
GCCTCCAAGG (5)
GTGGTGAAGA (3)
TAGTTGAGGT (4)
TTCCAGCTAC
TTCCAGTATG (3)
TTTGTGATGG (4)
120.90.1209
P6.5 retinaAGGTCCACCA (3)
CCATCACTGC
GCCTCCAAGG (5)
GCCTCCAGGG
GTGGTGAAGA (3)
TAGTTGAGGT (4)
TTCCAGCTAC
181.80.1818
P10.5 crx- retinaACCTTCCTGT
AGGTCCACCA (3)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
GCTTCCAAGG (2)
GTGGTGAAGA (3)
TACGACGAGT
TAGTTGAGGT (4)
TTCCAGCTAC
TTTGTGATGG (4)
377.30.3773
P10.5 crx+ retinaAGGTCCACCA (3)
CCATCACTGC
GCCTCCAAGG (5)
GTGGTGAAGA (3)
TACGACGAGT
TTCCAGCTAC
TTCCAGTATG (3)
290.20.2902
Adult retinalAGGTCCACCA (3)
CCAGTGAGCT (4)
CCATCACTGC
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
GCTTCCAAGG (2)
TACGACGAGT
TAGTTGAGGT (4)
TTCCAGCTAC
TTTGTGATGG (4)
368.60.3686
ONLAGGTCCACCA (3)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTCCCAAG (2)
GCCTTCCGTG (4)
GCTTCCAAGG (2)
GTGGTGAAGA (3)
TACGACGAGT
TTCCACTATG (3)
TTCCAGCTAC
379.10.3791