Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.34977 2610012C04RikRIKEN cDNA 2610012C04 gene 1    70299 
 Mm.34977 Nav1neuron navigator 1 1    215690 
 Mm.34977 BC028801cDNA sequence BC028801     408054 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 135 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAATCT (2)
GAGAGAGCCC (3)
GCAAAGAGCA (5)
GCAAGGCTCA (3)
GTCTGGGGGG (2)
TCTCCATCCA (3)
TGGTTTAACA (3)
TGTTTGTTCT (2)
83.20.0832
Cb medulloblastomaAACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
CTACTGAACT
GCAAAAAACA (4)
GTCTGGGGGG (2)
TCTCCATCCA (3)
62.40.0624
P8 GC+1d cultureAACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAATCT (2)
GCAAAGAGCA (5)
GCAAGGCTCA (3)
GTCTGGGGGG (2)
TCTCCATCCA (3)
TGTTTGTTCT (2)
65.10.0651
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAGTCAAT (4)
AACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAATCT (2)
GAGAGAGCCC (3)
GCAAAGAGCA (5)
GCAAGGCTCA (3)
GCTTTAATCC
GTCTGGGGGG (2)
TCTCCATCCA (3)
51.50.0515
3T3 fibroblastsCCTTTAATCC (3)
CCTTTAATCT (2)
GCAAAGAGCA (5)
GCAAGGCTCA (3)
91.10.0911
E15 cortexCCTTTAATCC (3)
GCAAAGAGCA (5)
GCAAGGCTCA (3)
GTCTGGGGGG (2)
TGGTTTAACA (3)
790.079
P1 cortexAAAAGTCAAT (4)
AACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAATCT (2)
GCAAGGCTCA (3)
GCTTTAATCC
GGAGGTGTCT
GTCTGGGGGG (2)
TCTCCATCCA (3)
TGTTTGTTCT (2)
217.90.2179
HypothalamusAACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAATCT (2)
CTACTGAACT
GTCTGGGGGG (2)
TCTCCATCCA (3)
39.80.0398
E12.5 retinaAACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAATCT (2)
90.10.0901
E14.5 retinaCCTTTAATCC (3)
CCTTTAATCT (2)
GCTTTAATCC
TCTCCATCCA (3)
TGTTTGTTCT (2)
138.50.1385
E16.5 retinaAACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
GAGAGAGCCC (3)
GCAAAGAGCA (5)
GCAAGGCTCA (3)
TCTCCATCCA (3)
83.20.0832
E18.5 retinaAACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
GGAGGTGTCT
TCTCCATCCA (3)
TGTTTGTTCT (2)
30.80.0308
P0.5 retinaAACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAATCT (2)
GCAAAAAACA (4)
GCAAAGAGCA (5)
GCAAGGCTCA (3)
GCTTTAATCC
GGAGGTGTCT
TCTCCATCCA (3)
104.20.1042
P2.5 retinaAAAAGTCAAT (4)
AACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAATCT (2)
GCTTTAATCC
GTCTGGGGGG (2)
TCTCCATCCA (3)
89.80.0898
P4.5 retinaCCTTTAATCC (3)
CCTTTAATCT (2)
GAGAGAGCCC (3)
GCAAAAAACA (4)
GCTTTAATCC
GTCTGGGGGG (2)
TCTCCATCCA (3)
TGTTTGTTCT (2)
75.40.0754
P6.5 retinaAACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAATCT (2)
GCAAGGCTCA (3)
GCTTTAATCC
TCTCCATCCA (3)
TGTTTGTTCT (2)
93.40.0934
P10.5 crx- retinaAACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
GTCTGGGGGG (2)
TCTCCATCCA (3)
TGTTTGTTCT (2)
76.30.0763
P10.5 crx+ retinaAACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
GCAAAGAGCA (5)
GCTTTAATCC
GTCTGGGGGG (2)
TGTTTGTTCT (2)
55.60.0556
Adult retinalAACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAATCT (2)
CTACTGAACT
GCAAAGAGCA (5)
GCTTTAATCC
GTCTGGGGGG (2)
TCTCCATCCA (3)
TGGTTTAACA (3)
TGTTTGTTCT (2)
165.10.1651
ONLAACATCATCC (3)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAATCT (2)
GCTTTAATCC
TCTCCATCCA (3)
107.20.1072