Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.35389	Cycs	cytochrome c, somatic	6	6 23.0 cM	13063
Gene Ontology	caspase activation via cytochrome c | electron transport | electron transporter activity | heme binding | mitochondrial electron transport chain | mitochondrion | mitochondrion
Human Homolog	CYCS[cytochrome c, somatic]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 146 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AATGGCTAGC CTAAAAAAAA (2) CTCTCAGCTG GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GCTAACCACC GCTTTTAATG TCCCCCTCAA (2) 164.8 0.1648 Cb medulloblastoma AATGGCTAGC CTAAAAAAAA (2) GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GCTAACCACC 101.8 0.1018 P8 GC+1d culture AATGGCTAGC CTAAAAAAAA (2) CTCTCAGCTG GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GCTAACCACC TCACCTCAAA (2) 105 0.105 P8 GC+SHH+1d culture AATGGCTAGC CTAAAAAAAA (2) CTCTCAGCTG GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GCTAACCACC TCCCCCTCAA (2) 145.2 0.1452 3T3 fibroblasts AATGGCTAGC CTCTCAGCTG GATGTGGCTG GCTAACCACC GTCATAGCTG (2) 192.7 0.1927 E15 cortex AATGGCTAGC CTAAAAAAAA (2) CTCTCAGCTG GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GTCATAGCTG (2) 148.3 0.1483 P1 cortex CTAAAAAAAA (2) GATGTGGCTG GCTAACCACC GCTTTTAATG TAATTAAAGT (3) 68 0.068 Hypothalamus AATGGCTAGC CTAAAAAAAA (2) GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GCTAACCACC TAATTAAAGT (3) TCCCCCTCAA (2) 128.5 0.1285 E12.5 retina AATGGCTAGC CTAAAAAAAA (2) GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GCTAACCACC TAATTAAAGT (3) TCCCCCTCAA (2) 249.9 0.2499 E14.5 retina AATGGCTAGC CTAAAAAAAA (2) GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GCTAACCACC TCCCCCTCAA (2) TCCCTCAACT (4) 231.4 0.2314 E16.5 retina AATGGCTAGC CTAAAAAAAA (2) CTCTCAGCTG GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GCTAACCACC GCTTTTAATG TCCCCCTCAA (2) TCCCTCAACT (4) 219 0.219 E18.5 retina AATGGCTAGC CTAAAAAAAA (2) GATGTGGCTG GCTAACCACC TCACCTCAAA (2) TCCCCCTCAA (2) 249.1 0.2491 P0.5 retina AATGGCTAGC CCTGGCTGCT (3) CTAAAAAAAA (2) GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GCTAACCACC GTCATAGCTG (2) TCACCTCAAA (2) 108 0.108 P2.5 retina AATGGCTAGC CTAAAAAAAA (2) GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GCTAACCACC GTCATAGCTG (2) TCCCTCAACT (4) 112.7 0.1127 P4.5 retina AATGGCTAGC CTAAAAAAAA (2) CTCTCAGCTG GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GCTAACCACC GTCATAGCTG (2) TAATTAAAGT (3) 99.1 0.0991 P6.5 retina AATGGCTAGC CCTGGCTGCT (3) CTAAAAAAAA (2) CTCTCAGCTG GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GCTAACCACC GTCATAGCTG (2) TAATTAAAGT (3) TCACCTCAAA (2) 96.6 0.0966 P10.5 crx- retina AATGGCTAGC CTAAAAAAAA (2) CTCTCAGCTG GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GCTAACCACC TCCCCCTCAA (2) 109.6 0.1096 P10.5 crx+ retina AATGGCTAGC CCTGGCTGCT (3) CTAAAAAAAA (2) CTCTCAGCTG GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GCTAACCACC TAATTAAAGT (3) TCCCCCTCAA (2) 115.3 0.1153 Adult retinal AATGGCTAGC CCTGGCTGCT (3) CTAAAAAAAA (2) CTCTCAGCTG GACTGGGAAG (3) GATGTGGCTG GCTAACCACC GTCATAGCTG (2) TCCCCCTCAA (2) TCCCTCAACT (4) 57.7 0.0577 ONL AATGGCTAGC CCTGGCTGCT (3) CTAAAAAAAA (2) CTCTCAGCTG GATGTGGCTG GCTAACCACC GTCATAGCTG (2) TAATTAAAGT (3) 30.5 0.0305