Mouse Retina SAGE Library

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Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

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UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.38241	Irak1	interleukin-1 receptor-associated kinase 1	X	X 29.6 cM	16179
Gene Ontology	ATP binding | kinase activity | protein amino acid phosphorylation | protein binding | protein kinase activity | protein serine/threonine kinase activity | receptor activity | signal transduction | transferase activity
Human Homolog	IRAK1[interleukin-1 receptor-associated kinase 1]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

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SAGE Tags

Total 151 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCCCTGTGTA GAGGCTCACA GGGTTGCTGG GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TCTGAATTAT TGGTTGCTGG 97.9 0.0979 Cb medulloblastoma CCCCTGTGTA GAGGCTCACA GCTGCCCAGC GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TGGTTGCTGG TGTTGGCAAA 145.6 0.1456 P8 GC+1d culture CCCCTGTGTA GAGGCTCACA GAGTCACCAC GCTGCCCAGC GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TGGTTGCTGG TTTGAATTAT 91.3 0.0913 P8 GC+SHH+1d culture CCCCTGTGTA GAGGCTCACA GAGTCACCAC GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TCTGAATTAT TGGTTGCTGG TGGTTGGTGG (2) TTTGAATTAT 137 0.137 3T3 fibroblasts GGGTTGCTGG GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TGGTTGCTGG TGGTTGGTGG (2) 259.3 0.2593 E15 cortex GAGGCTCACA GAGTCACCAC GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TGGTTGCTGG TGGTTGGTGG (2) 331.3 0.3313 P1 cortex CCCCTGTGTA GAGGCTCACA GGGTGGGGAG (2) GGGTTGCTGG GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TGGTTGCTGG TGGTTGGTGG (2) 163.5 0.1635 Hypothalamus GAGGCTCACA GGGTTGCTGG GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TGGTTGCTGG TGTTGGCAAA TTTGAATTAT 378.5 0.3785 E12.5 retina CCCCTGTGTA GAGGCTCACA GCTGCCCAGC GTGGTTCACA (2) TCTGAATTAT TGGTTGCTGG 208.5 0.2085 E14.5 retina GAGGCTCACA GCTGCCCAGC GGGTGGGGAG (2) GGGTTGCTGG GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TGGTTGCTGG TGGTTGGTGG (2) 1036.6 1.0366 E16.5 retina CCCCTGTGTA GAGGCTCACA GAGTCACCAC GGGTTGCTGG GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TGGTTGCTGG TGGTTGGTGG (2) 845.6 0.8456 E18.5 retina GAGGCTCACA GGGTTGCTGG GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TGGTTGCTGG 312.8 0.3128 P0.5 retina CCCCTGTGTA GAGGCTCACA GGGTTGCTGG GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TCTGAATTAT TGGTTGCTGG TGGTTGGTGG (2) 251.4 0.2514 P2.5 retina CCCCTGTGTA GAGGCTCACA GCTGCCCAGC GGGTGGGGAG (2) GGGTTGCTGG GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TGGTTGCTGG TGTTGGCAAA TTTGAATTAT 204.1 0.2041 P4.5 retina GAGGCTCACA GGGTTGCTGG GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TCTGAATTAT TGGTTGCTGG TGGTTGGTGG (2) 206.1 0.2061 P6.5 retina CCCCTGTGTA GAGGCTCACA GGGTTGCTGG GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TGGTTGCTGG TGGTTGGTGG (2) TTTGAATTAT 215 0.215 P10.5 crx- retina CCCCTGTGTA GAGGCTCACA GAGTCACCAC GGGTTGCTGG GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TCTGAATTAT TGGTTGCTGG TTTGAATTAT 329 0.329 P10.5 crx+ retina CCCCTGTGTA GAGGCTCACA GCTGCCCAGC GGGTTGCTGG GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TGGTTGCTGG 155.7 0.1557 Adult retinal CCCCTGTGTA GAGGCTCACA GAGTCACCAC GGGTTGCTGG GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TCTGAATTAT TGGTTGCTGG TGGTTGGTGG (2) TTTGAATTAT 277.9 0.2779 ONL GAGGCTCACA GGGTTGCTGG GTGGTTCACA (2) GTGTCTCACA TGGTTGCTGG TGGTTGGTGG (2) TGTTGGCAAA TTTGAATTAT 461.6 0.4616