Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.38813 AI265322expressed sequence AI265322 17    106543 
 Mm.38813 9030612M13RikRIKEN cDNA 9030612M13 gene 17    208292 
 Gene Ontology intracellular | nucleic acid binding | regulation of transcription, DNA-dependent
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 92 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTGTAATTTT
GTTCTCCAAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
24.40.0244
Cb medulloblastomaGTTCTCCAAA (2)
TAAATAAAGT
TCAAAAAAAA (2)
TGACTCTAGT (2)
113.20.1132
P8 GC+1d cultureATTCTCTTTT (5)
ATTTTATTGA (3)
GATGTAAAAA
GTTCTCCAAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCAAAAGAAA (4)
26.10.0261
P8 GC+SHH+1d cultureATTTTATTGA (3)
CTGTAATTTT
GATGTAAAAA
GTTCTCCAAA (2)
TAAATAAAGT
TCAAAAAAAA (2)
TGTGAAGTCT (6)
74.90.0749
3T3 fibroblastsATTCTCTTTT (5)
GTTCTCCAAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
140.014
E15 cortexAGTCTGGGGC (3)
GTTCTCCAAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
29.60.0296
P1 cortexGTTCTCCAAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
36.30.0363
HypothalamusATTCTCTTTT (5)
GATGTAAAAA
GTTCTCCAAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCAAAAGAAA (4)
TGACTCTAGT (2)
TGTGAAGTCT (6)
52.40.0524
E12.5 retinaATTTTATTGA (3)
GATGTAAAAA
GTTCTCCAAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCAAAAGAAA (4)
TGACTCTAGT (2)
32.10.0321
E14.5 retinaAGTCTGGGGC (3)
ATTCTCTTTT (5)
GTTCTCCAAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
47.30.0473
E16.5 retinaAGTCTGGGGC (3)
CTGTAATTTT
GTTCTCCAAA (2)
TAAATAAAGT
TCAAAAAAAA (2)
TGTGAAGTCT (6)
37.90.0379
E18.5 retinaATTCTCTTTT (5)
CTGTAATTTT
GATGTAAAAA
GTTCTCCAAA (2)
TAAATAAAGT
TCAAAAAAAA (2)
78.20.0782
P0.5 retinaCTGTAATTTT
GTTCTCCAAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
41.20.0412
P2.5 retinaCTGTAATTTT
GATGTAAAAA
GTTCTCCAAA (2)
TAAATAAAGT
TCAAAAAAAA (2)
TGACTCTAGT (2)
56.30.0563
P4.5 retinaATTTTATTGA (3)
GATGTAAAAA
GTTCTCCAAA (2)
TAAATAAAGT
TCAAAAAAAA (2)
55.50.0555
P6.5 retinaATTTTATTGA (3)
GATGTAAAAA
GTTCTCCAAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
450.045
P10.5 crx- retinaGATGTAAAAA
GTTCTCCAAA (2)
TAAATAAAGT
TCAAAAAAAA (2)
26.10.0261
P10.5 crx+ retinaCTGTAATTTT
GATGTAAAAA
GTTCTCCAAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
36.50.0365
Adult retinalCTGTAATTTT
GATGTAAAAA
GTTCTCCAAA (2)
TAAATAAAGT
TCAAAAAAAA (2)
390.039
ONLCTGTAATTTT
GATGTAAAAA
GTTCTCCAAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
30.60.0306