Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.40546 AI839402expressed sequence AI839402 16    106263 
 Mm.40546 Itsn1intersectin 1 (SH3 domain protein 1A) 16    16443 
 Gene Ontology calcium ion binding | endocytosis | lamellipodium | protein binding | small GTPase mediated signal transduction
 Human Homolog ITSN1[intersectin 1 (SH3 domain protein)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 112 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATCAAGGGTG
GATATGAATG (2)
GGGCTGCTCA (3)
TGATCGAAAT (2)
TGGTTGCTGG
TGTGGAAGTG (2)
99.50.0995
Cb medulloblastomaGCTTCTAGAG (2)
GGGCTGCTCA (3)
TATTCAGTTG
TGGTTGCTGG
TGTGGAAGTG (2)
129.40.1294
P8 GC+1d cultureGATATGAATG (2)
GCTTCTAGAG (2)
GGGCTGCTCA (3)
TCTCATTTTA
TGATCGAAAT (2)
TGGTTGCTGG
TGTGGAAGTG (2)
77.50.0775
P8 GC+SHH+1d cultureCATTTAACTG (2)
GATATGAATG (2)
GGGCTGCTCA (3)
TATTCAGTTG
TGGTGGTTTG (5)
TGGTTGCTGG
TGTGGAAGTG (2)
1090.109
3T3 fibroblastsGGGCTGCTCA (3)
TGGTTGCTGG
227.80.2278
E15 cortexGGGCTGCTCA (3)
TATTCAGTTG
TGGTTGCTGG
306.70.3067
P1 cortexCATTTAACTG (2)
GGGCTGCTCA (3)
TGATCGAAAT (2)
TGGTTGCTGG
99.90.0999
HypothalamusATCAAGGGTG
GGGCTGCTCA (3)
TATTCAGTTG
TCACATCCAA (2)
TGGTTGCTGG
TGTGGAAGTG (2)
365.80.3658
E12.5 retinaATCAAGGGTG
GAAAGAGCAA (2)
GATATGAATG (2)
GCTTCTAGAG (2)
GGGCTGCTCA (3)
TGGTTGCTGG
TGTGGAAGTG (2)
191.70.1917
E14.5 retinaATCAAGGGTG
CGCGACAGGT (3)
GAAAGAGCAA (2)
GATATGAATG (2)
GGGCTGCTCA (3)
TGGTGGTTTG (5)
TGGTTGCTGG
963.80.9638
E16.5 retinaATCAAGGGTG
ATTACGCCAA
GATATGAATG (2)
GGGCTGCTCA (3)
TGGTGGTTTG (5)
TGGTTGCTGG
TGTGGAAGTG (2)
798.70.7987
E18.5 retinaATCAAGGGTG
GAAAGAGCAA (2)
GGGCTGCTCA (3)
TGGTGGTTTG (5)
TGGTTGCTGG
TGTGGAAGTG (2)
261.80.2618
P0.5 retinaATCAAGGGTG
ATTACGCCAA
GGGCTGCTCA (3)
TATTCAGTTG
TCTCATTTTA
TGGTGGTTTG (5)
TGGTTGCTGG
TGTGGAAGTG (2)
2240.224
P2.5 retinaATCAAGGGTG
GATATGAATG (2)
GGGCTGCTCA (3)
TCACATCCAA (2)
TGGTGGTTTG (5)
TGGTTGCTGG
TGTGGAAGTG (2)
190.10.1901
P4.5 retinaGATATGAATG (2)
GGGCTGCTCA (3)
TGGTTGCTGG
TGTGGAAGTG (2)
160.60.1606
P6.5 retinaGATATGAATG (2)
GGGCTGCTCA (3)
TCACATCCAA (2)
TCTCATTTTA
TGGTTGCTGG
TGTGGAAGTG (2)
178.40.1784
P10.5 crx- retinaATCAAGGGTG
GGGCTGCTCA (3)
TGGTTGCTGG
TGTGGAAGTG (2)
299.10.2991
P10.5 crx+ retinaGGGCTGCTCA (3)
TATTCAGTTG
TGGTTGCTGG
TGTGGAAGTG (2)
113.40.1134
Adult retinalATTACGCCAA
CATTTAACTG (2)
CGCGACAGGT (3)
GAAAGAGCAA (2)
GGGCTGCTCA (3)
TCTCATTTTA
TGGTGGTTTG (5)
TGGTTGCTGG
TGTGGAAGTG (2)
239.10.2391
ONLGAAAGAGCAA (2)
GATATGAATG (2)
TGGTTGCTGG
419.50.4195