Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.41271	Stard7	START domain containing 7	2	2 F1 (2 62.5 cM)	99138
Human Homolog	STARD7[START domain containing 7]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

Total 21 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge

SAGE Tags

Total 104 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) CTTACACTTG (2) GTGGCGCACG TATGTGTGCG TTTGATAGAT (2) 62.1 0.0621 Cb medulloblastoma CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) CTTACACTTG (2) GTGGCGCACG TATGTGTGCG 50.9 0.0509 P8 GC+1d culture CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) CTTACACTTG (2) GCCTCTGCCG GTGGCGCACG TATGTGTGCG 53.5 0.0535 P8 GC+SHH+1d culture CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) CTTACACTTG (2) GTGGCGCACG TATGTGTGCG 46.8 0.0468 3T3 fibroblasts CCTCTGTTTG (2) GTGGCGCACG TATGTGTGCG 73.6 0.0736 E15 cortex CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) GTGGCGCACG TAGGCCGAAG (2) 148.3 0.1483 P1 cortex CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) GTGGCGCACG TATGTGTGCG 81.9 0.0819 Hypothalamus CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) CTTACACTTG (2) GTGGCGCACG TATGTGTGCG 50.8 0.0508 E12.5 retina CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) CTTACACTTG (2) GCCTCTGCCG GTGGCGCACG TTTGATAGAT (2) 47 0.047 E14.5 retina CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) CTTACACTTG (2) GCCTCTGCCG GTGGCGCACG TTTGATAGAT (2) 71.1 0.0711 E16.5 retina CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) CTTACACTTG (2) GTGGCGCACG TATGTGTGCG TTTGATAGAT (2) 67 0.067 E18.5 retina CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) CTTACACTTG (2) GTGGCGCACG 45.5 0.0455 P0.5 retina CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) CTTACACTTG (2) GTGGCGCACG TATGTGTGCG 72.6 0.0726 P2.5 retina CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) CTTACACTTG (2) GTGGCGCACG TATGTGTGCG TTTGATAGAT (2) 72.2 0.0722 P4.5 retina CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) GTGGCGCACG TATGTGTGCG 73.2 0.0732 P6.5 retina CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) GTGGCGCACG TATGTGTGCG 103.3 0.1033 P10.5 crx- retina CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) CTTACACTTG (2) GTGGCGCACG TATGTGTGCG 68.8 0.0688 P10.5 crx+ retina CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) GTGGCGCACG TAGGCCGAAG (2) TATGTGTGCG 88.4 0.0884 Adult retinal CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) CTTACACTTG (2) GAGGAGTGAG (2) GCCTCTGCCG GTGGCGCACG TATGTGTGCG 87.1 0.0871 ONL CCTCTGTTTG (2) CCTTACACTT (4) CTTACACTTG (2) GAGGAGTGAG (2) GCCTCTGCCG GTGGCGCACG TAGGCCGAAG (2) TATGTGTGCG 65.1 0.0651