Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.46847 4930469P12RikRIKEN cDNA 4930469P12 gene 6    67636 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 127 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAAATAT (6)
AACCGTACTG
GTTTTAAAAA (3)
TAACAGTCCT (2)
TGGCAGTGGA (3)
TTAGCTAAAT (2)
TTTAATAAAC
24.40.0244
Cb medulloblastomaAAAAAAATAT (6)
AACCGTACTG
GAAACTGAAT
GTTTTAAAAA (3)
TGGCAGTGGA (3)
TTAGCTAAAT (2)
TTTAATAAAC
20.70.0207
P8 GC+1d cultureAACCGTACTG
AATTCTGCAT
ACAAAAATAT (3)
GTTTTAAAAA (3)
GTTTTTAAAA (2)
TAACAGTCCT (2)
TTAGCTAAAT (2)
28.40.0284
P8 GC+SHH+1d cultureAACCGTACTG
CTACCCAGTA
GTGAGAATGC
GTTTTAAAAA (3)
GTTTTTAAAA (2)
TAACAGTCCT (2)
TAACATTCCT
TTTAATAAAC
25.70.0257
3T3 fibroblastsGTCATAGCTG (2)
TAACAGTCCT (2)
17.50.0175
E15 cortexAACCGTACTG
GTCATAGCTG (2)
GTTTTAAAAA (3)
TTAGCTAAAT (2)
19.60.0196
P1 cortexAACCGTACTG
GTTTTTAAAA (2)
TTTAATAAAC
31.80.0318
HypothalamusAACCGTACTG
ATGTGAGTTT
GTTTTTAAAA (2)
TAACAGTCCT (2)
TGGCAGTGGA (3)
TTTAATAAAC
19.90.0199
E12.5 retinaAACCGTACTG
GTGAGAATGC
GTTTTAAAAA (3)
TAACAGTCCT (2)
TTTAATAAAC
15.20.0152
E14.5 retinaAACCGTACTG
GTTTTAAAAA (3)
TAACAGTCCT (2)
TTAGCTAAAT (2)
TTTAATAAAC
38.20.0382
E16.5 retinaAACCGTACTG
ACAAAAATAT (3)
CTACCCAGTA
GAAACTGAAT
GTTTTAAAAA (3)
GTTTTTAAAA (2)
TAACAGTCCT (2)
TATAAAAGTG (2)
TTTAATAAAC
39.70.0397
E18.5 retinaAACCGTACTG
CTACCCAGTA
GTTTTAAAAA (3)
TAACAGTCCT (2)
41.90.0419
P0.5 retinaAACCGTACTG
ACAAAAATAT (3)
CTACCCAGTA
GTCATAGCTG (2)
GTTTTTAAAA (2)
TAACAGTCCT (2)
TGGCAGTGGA (3)
TTAGCTAAAT (2)
23.60.0236
P2.5 retinaAAAAAAATAT (6)
AACCGTACTG
ACAAAAATAT (3)
GTCATAGCTG (2)
GTTTTAAAAA (3)
TAACAGTCCT (2)
TGATGGTGAC (2)
TGGCAGTGGA (3)
TTAGCTAAAT (2)
TTTAATAAAC
26.60.0266
P4.5 retinaAACCGTACTG
AATTCTGCAT
GAAACTGAAT
GTCATAGCTG (2)
GTTTTAAAAA (3)
GTTTTTAAAA (2)
TAACAGTCCT (2)
TAACATTCCT
TGGCAGTGGA (3)
TTTAATAAAC
35.80.0358
P6.5 retinaAACCGTACTG
AATTCTGCAT
ACAAAAATAT (3)
GTCATAGCTG (2)
GTTTTAAAAA (3)
TAACAGTCCT (2)
TGGCAGTGGA (3)
TTTAATAAAC
23.40.0234
P10.5 crx- retinaAACCGTACTG
ACAAAAATAT (3)
ATGTGAGTTT
TAACATTCCT
TGGCAGTGGA (3)
TTTAATAAAC
16.90.0169
P10.5 crx+ retinaAACCGTACTG
CTACCCAGTA
TAACAGTCCT (2)
11.50.0115
Adult retinalGTCATAGCTG (2)
GTGAGAATGC
TAACAGTCCT (2)
TTAGCTAAAT (2)
11.30.0113
ONLAAAAAAATAT (6)
AACCGTACTG
ACAAAAATAT (3)
ATGTGAGTTT
CTACCCAGTA
GTCATAGCTG (2)
GTTTTAAAAA (3)
TAACAGTCCT (2)
TATAAAAGTG (2)
TTAGCTAAAT (2)
TTTAATAAAC
400.04