Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.4714 Yaf2YY1 associated factor 2 15    67057 
 Mm.4714 D030074K08RikRIKEN cDNA D030074K08 gene 15    320531 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 60 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAATGTGGT (2)
GTAATGTCAC (2)
GTCAGACTCT
TAACTATTAC (2)
TAATGAGTTT (2)
16.30.0163
Cb medulloblastomaGTAATGTCAC (2)
TCTGTGACCC (3)
TGACTCTAGT (2)
TGTTTTACTA (2)
11.50.0115
P8 GC+1d cultureAAAATGTGGT (2)
ATGTCTTTAA (3)
GAGATGCAGA (2)
TAACTATTAC (2)
4.40.0044
P8 GC+SHH+1d cultureAAAATGTGGT (2)
GAGATGCAGA (2)
GTCAGACTCT
TAACTATTAC (2)
9.30.0093
3T3 fibroblastsGAGATGCAGA (2)
70.007
P1 cortexTGTTTTACTA (2)
4.50.0045
HypothalamusAAAATGTGGT (2)
GAGATGCAGA (2)
GTAATGTCAC (2)
TAACTATTAC (2)
TAATGAGTTT (2)
TCTGTGACCC (3)
TGACTCTAGT (2)
19.80.0198
E12.5 retinaAAAATGTGGT (2)
ATGTCTTTAA (3)
GAGATGCAGA (2)
TGACTCTAGT (2)
7.60.0076
E14.5 retinaAAAATGTGGT (2)
ATGTCTTTAA (3)
TAATGAGTTT (2)
TCTGTGACCC (3)
90.009
E16.5 retinaAAAATGTGGT (2)
GAGATGCAGA (2)
TAACTATTAC (2)
5.40.0054
E18.5 retinaTAACTATTAC (2)
TAATGAGTTT (2)
5.40.0054
P0.5 retinaGTAATGTCAC (2)
TGTTTTACTA (2)
40.004
P2.5 retinaTAACTATTAC (2)
TAATGAGTTT (2)
TGACTCTAGT (2)
7.10.0071
P4.5 retinaAAAATGTGGT (2)
GAGATGCAGA (2)
GTAATGTCAC (2)
TAACTATTAC (2)
TAATGAGTTT (2)
120.012
P6.5 retinaAAAATGTGGT (2)
1.70.0017
P10.5 crx- retinaAAAATGTGGT (2)
GAGATGCAGA (2)
GTCAGACTCT
TAACTATTAC (2)
TAATGAGTTT (2)
TCTGTGACCC (3)
280.028
P10.5 crx+ retinaGTAATGTCAC (2)
1.90.0019
Adult retinalATGTCTTTAA (3)
TAACTATTAC (2)
5.60.0056
ONLTCTGTGACCC (3)
1.90.0019