Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.49544 HcrHCR (a-helix coiled-coil rod homolog) 17    240084 
 Gene Ontology cell differentiation | nucleus
 Human Homolog C6orf18[chromosome 6 open reading frame 18]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 53 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
GAGTTTCTAA (2)
11.40.0114
Cb medulloblastomaAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
GAGTTTCTAA (2)
41.60.0416
P8 GC+1d cultureAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
GAGTTTCTAA (2)
10.30.0103
P8 GC+SHH+1d cultureAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
GAGTTTCTAA (2)
7.10.0071
3T3 fibroblastsACATCAGCCC (3)
70.007
E15 cortexAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
GAGTTTCTAA (2)
24.60.0246
P1 cortexAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
18.10.0181
HypothalamusAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
GAGTTTCTAA (2)
23.50.0235
E12.5 retinaAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
9.40.0094
E14.5 retinaAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
12.80.0128
E16.5 retinaAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
GAGTTTCTAA (2)
10.80.0108
E18.5 retinaAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
GAGTTTCTAA (2)
200.02
P0.5 retinaAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
GAGTTTCTAA (2)
7.90.0079
P2.5 retinaAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
GAGTTTCTAA (2)
22.80.0228
P4.5 retinaAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
GAGTTTCTAA (2)
13.90.0139
P6.5 retinaAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
GAGTTTCTAA (2)
15.10.0151
P10.5 crx- retinaAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
GAGTTTCTAA (2)
18.60.0186
P10.5 crx+ retinaAGACCCTGTC (2)
GAGTTTCTAA (2)
19.20.0192
Adult retinalAGACCCTGTC (2)
CTCAGAGGTC
GAGTTTCTAA (2)
20.50.0205
ONLACATCAGCCC (3)
AGACCCTGTC (2)
19.10.0191