Mouse Retina SAGE Library

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Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

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UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.64104	2410016F19Rik	RIKEN cDNA 2410016F19 gene	10		67371
Human Homolog	C6orf51[chromosome 6 open reading frame 51]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

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SAGE Tags

Total 84 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAAAAAAA (2) ACAAGGACGC CCTTTAATCT (2) GGAACTCAAG (2) TCGGCCGCCC 213.6 0.2136 Cb medulloblastoma AAAAAAAAAA (2) AGAGAGAGCA (3) GGAACTCAAG (2) 802.4 0.8024 P8 GC+1d culture AAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCT (2) CCTTTTAATC GGAACTCAAG (2) 211.1 0.2111 P8 GC+SHH+1d culture AAAAAAAAAA (2) CAATATACTT (2) CCTTTAATCT (2) CCTTTTAATC GGAACTCAAG (2) TCGGCCGCCC 295.1 0.2951 3T3 fibroblasts AAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCT (2) TGGTGCTGGG (2) 42 0.042 E15 cortex AAAAAAAAAA (2) AGAGAGAGCA (3) GGAACTCAAG (2) 222.6 0.2226 P1 cortex AAAAAAAAAA (2) AGAGAGAGCA (3) CCTTTAATCT (2) CCTTTTAATC GGAACTCAAG (2) 263.4 0.2634 Hypothalamus AAAAAAAAAA (2) ACAAGGACGC CCTTTAATCT (2) GGAACTCAAG (2) 134 0.134 E12.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCT (2) GGAACTCAAG (2) 144.6 0.1446 E14.5 retina AAAAAAAAAA (2) CAATATACTT (2) CCTTTAATCT (2) CCTTTTAATC GGAACTCAAG (2) TCGGCCGCCC TGGTGCTGGG (2) 127.4 0.1274 E16.5 retina AAAAAAAAAA (2) ACAAGGACGC GGAACTCAAG (2) TGGTGCTGGG (2) 54.3 0.0543 E18.5 retina AAAAAAAAAA (2) ACAAGGACGC CAATATACTT (2) GGAACTCAAG (2) TGGTGCTGGG (2) 389.2 0.3892 P0.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCT (2) CCTTTTAATC GGAACTCAAG (2) 123.8 0.1238 P2.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCT (2) CCTTTTAATC GGAACTCAAG (2) 339.6 0.3396 P4.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCT (2) CCTTTTAATC GGAACTCAAG (2) TGGTGCTGGG (2) 299.2 0.2992 P6.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCT (2) CCTTTTAATC GGAACTCAAG (2) TCGGCCGCCC 288.6 0.2886 P10.5 crx- retina AAAAAAAAAA (2) CCTTTTAATC 46.5 0.0465 P10.5 crx+ retina AAAAAAAAAA (2) CAATATACTT (2) CCTTTTAATC GGAACTCAAG (2) 103.7 0.1037 Adult retinal AAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCT (2) CCTTTTAATC TGGTGCTGGG (2) 70.4 0.0704 ONL AAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCT (2) GGAACTCAAG (2) TGGTGCTGGG (2) 120.6 0.1206