Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.806	Cd81	CD 81 antigen	7	7 69.3 cM	12520
Gene Ontology	integral to membrane | plasma membrane
Human Homolog	CD81[CD81 antigen (target of antiproliferative antibody 1)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 175 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ATAACACATA CAAAAAAAAA (2) CACCACGACC CCCACCAGCA (4) CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GCCTGCTGGG GCCTGTGTAT (2) GCTGTGTATT TCTTCCACTT (2) TGTGATGTCA 112.6 0.1126 Cb medulloblastoma ATAACACATA CAAAAAAAAA (2) CAAAAGGAAA (2) CACCACGACC CCCACCAGCA (4) CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GCCTGTGTAT (2) GGGGTGGAGG (2) TGTGATGTCA 198.7 0.1987 P8 GC+1d culture ATACACAGAC CAAAAAAAAA (2) CACCACGACC CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GCCCTCTAGC GCCTGTGTAT (2) GCTGTGTATT TCTTCCACTT (2) TGTGATGTCA 78.7 0.0787 P8 GC+SHH+1d culture ATAACACATA CAAAAAAAAA (2) CAAAAGGAAA (2) CACCACGACC CCACCCACTC (2) CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GCCTGCTGGG GCCTGTGTAT (2) GCTGTGTATT GGGGAGCCGG (2) GGGGTGGAGG (2) TCTTCCACTT (2) TGTGATGTCA 152.4 0.1524 3T3 fibroblasts CACCACGACC CCCACCCACT (2) GCTGTGTATT 59.6 0.0596 E15 cortex CAAAAAAAAA (2) CACCACGACC CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GCTGTGTATT GGGGAGCCGG (2) 83.9 0.0839 P1 cortex ATAACACATA CAAAAAAAAA (2) CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) 45.3 0.0453 Hypothalamus CAAAAAAAAA (2) CACCACGACC CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GATGCCGCTG GCCTGTGTAT (2) GTGCTGTGCT TCTTCCACTT (2) TGTGATGTCA 103.1 0.1031 E12.5 retina ATAACACATA CAAAAAAAAA (2) CACCACGACC CCACCCACTC (2) CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GATGCCGCTG GCCTGTGTAT (2) GCTGTGTATT TGTGATGTCA 62.1 0.0621 E14.5 retina CAAAAAAAAA (2) CACCACGACC CCACCCACTC (2) CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GCCCTCTAGC GCTGTGTATT TGTGATGTCA 50.9 0.0509 E16.5 retina ATAACACATA CAAAAAAAAA (2) CACCACGACC CCACCCACTC (2) CCCACCAGCA (4) CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GATGCCGCTG GCTGTGTATT GTGCTGTGCT TCTTCCACTT (2) TGTGATGTCA 46.9 0.0469 E18.5 retina ATAACACATA CAAAAAAAAA (2) CACCACGACC CTAAAAAAAA (2) GCTGTGTATT TGTGATGTCA 123.7 0.1237 P0.5 retina CAAAAAAAAA (2) CACCACGACC CCACCCACTC (2) CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GCTGTGTATT TCTTCCACTT (2) TGTGATGTCA 167 0.167 P2.5 retina ATAACACATA CAAAAAAAAA (2) CACCACGACC CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GCCTGTGTAT (2) GCTGTGTATT TGTGATGTCA 110.7 0.1107 P4.5 retina ATAACACATA ATACACAGAC CAAAAAAAAA (2) CAAAAGGAAA (2) CACCACGACC CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GCTGTGTATT GGGGAGCCGG (2) TGTGATGTCA TTGGAAAAGG 107.1 0.1071 P6.5 retina ATAACACATA CAAAAAAAAA (2) CAAAAGGAAA (2) CACCACGACC CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GATACCACAT (2) GGGGTGGAGG (2) TGTGATGTCA 76.8 0.0768 P10.5 crx- retina CAAAAAAAAA (2) CACCACGACC CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GATACCACAT (2) GATGCCGCTG GCCCTCTAGC GCCTGTGTAT (2) TCTTCCACTT (2) TGTGATGTCA TTGGAAAAGG 83.9 0.0839 P10.5 crx+ retina ATAACACATA CAAAAAAAAA (2) CACCACGACC CCACCCACTC (2) CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GCCCTCTAGC GCCTGTGTAT (2) TGTGATGTCA 86.4 0.0864 Adult retinal ATAACACATA CAAAAAAAAA (2) CACCACGACC CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GATACCACAT (2) TGTGATGTCA 53.9 0.0539 ONL ATACACAGAC CAAAAAAAAA (2) CACCACGACC CCCACCCACT (2) CTAAAAAAAA (2) GCCTGTGTAT (2) GGGGTGGAGG (2) TGTGATGTCA TTGGAAAAGG 47.7 0.0477