Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.87639 Hbp1high mobility group box transcription factor 1 12  12 A2  73389 
 Mm.87639 Cog5component of oligomeric golgi complex 5 12    238123 
 Gene Ontology Golgi apparatus | inter-Golgi cisterna transport | molecular_function unknown
 Human Homolog COG5[component of oligomeric golgi complex 5]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 99 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAATAAACTCA (2)
CTGTACCACA (2)
GCACAAGAAC (3)
GCCCTGGCAG
TCAAAAAAAA (2)
TCTTAAAAAA (3)
TGGGTGCTAG (4)
TTACTTACCA (3)
40.70.0407
Cb medulloblastomaAATAAACTCA (2)
GCCCTGGCAG
TCAAAAAAAA (2)
117.90.1179
P8 GC+1d cultureAATAAACTCA (2)
AGGAAGAGAA (2)
CTGTACCACA (2)
GCACAAGAAC (3)
GCCCTGGCAG
TCAAAAAAAA (2)
TTACTTACCA (3)
44.30.0443
P8 GC+SHH+1d cultureAATAAACTCA (2)
CTGTACCACA (2)
GCCCTGGCAG
TCAAAAAAAA (2)
TTACTTACCA (3)
73.70.0737
3T3 fibroblastsCTGTACCACA (2)
TCAAAAAAAA (2)
TTACTTACCA (3)
24.50.0245
E15 cortexAATAAACTCA (2)
GCCCTGGCAG
TCAAAAAAAA (2)
TGGGTGCTAG (4)
34.50.0345
P1 cortexAGGAAGAGAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
27.20.0272
HypothalamusAAGAGAGTGT (3)
AATAAACTCA (2)
GCCCTGGCAG
TCAAAAAAAA (2)
TGGGTGCTAG (4)
TTACTTACCA (3)
50.60.0506
E12.5 retinaAATAAACTCA (2)
CTGTACCACA (2)
TCAAAAAAAA (2)
TTACTTACCA (3)
35.80.0358
E14.5 retinaAATAAACTCA (2)
TCAAAAAAAA (2)
TGGGTGCTAG (4)
TTACTTACCA (3)
63.80.0638
E16.5 retinaAAGAGAGTGT (3)
AATAAACTCA (2)
CTGTACCACA (2)
GCACAAGAAC (3)
TCAAAAAAAA (2)
TTACTTACCA (3)
50.60.0506
E18.5 retinaAATAAACTCA (2)
GCCCTGGCAG
TCAAAAAAAA (2)
TCTTAAAAAA (3)
74.50.0745
P0.5 retinaAATAAACTCA (2)
TCAAAAAAAA (2)
TTACTTACCA (3)
41.20.0412
P2.5 retinaAATAAACTCA (2)
GCACAAGAAC (3)
GCCCTGGCAG
TCAAAAAAAA (2)
TCTTAAAAAA (3)
TGGGTGCTAG (4)
TTACTTACCA (3)
68.60.0686
P4.5 retinaAATAAACTCA (2)
CTGTACCACA (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCTTAAAAAA (3)
TTACTTACCA (3)
63.40.0634
P6.5 retinaAAGAGAGTGT (3)
AATAAACTCA (2)
AGGAAGAGAA (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCTTAAAAAA (3)
TTACTTACCA (3)
48.50.0485
P10.5 crx- retinaAAGAGAGTGT (3)
AATAAACTCA (2)
CTGTACCACA (2)
TCAAAAAAAA (2)
TGGGTGCTAG (4)
TTACTTACCA (3)
540.054
P10.5 crx+ retinaAATAAACTCA (2)
CTGTACCACA (2)
GCACAAGAAC (3)
GCCCTGGCAG
TCAAAAAAAA (2)
TGGGTGCTAG (4)
TTACTTACCA (3)
480.048
Adult retinalCTGTACCACA (2)
GCCCTGGCAG
TCAAAAAAAA (2)
TCTTAAAAAA (3)
TGGGTGCTAG (4)
29.80.0298
ONLAATAAACTCA (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCTTAAAAAA (3)
TGGGTGCTAG (4)
36.30.0363