Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.87773 Tra1tumor rejection antigen gp96 10  10 49.0 cM  22027 
 Mm.87773 Targ2transforming growth factor alpha regulated gene 2     21361 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 116 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGGCACAGC (2)
AATTCTCTGT (4)
ACAAGATTTT (2)
AGGGTCCTGT (2)
GAGAGGATCC (3)
GATCTTGCTG (3)
GCTGGGTCAA (2)
GGTATAAAAA (2)
GTGGGAGCTG
TCACAGACAC (2)
TGTATAAAAA (3)
63.70.0637
Cb medulloblastomaAAGGCACAGC (2)
ACAAGATTTT (2)
GTCAGAGACC (2)
TGTATAAAAA (3)
60.10.0601
P8 GC+1d cultureAAGGCACAGC (2)
AATTCTCTGT (4)
ACAAGATTTT (2)
GAGAGGATCC (3)
GATCTTGCTG (3)
GTCAGAGACC (2)
TAAATTTGTA
TGGGAGCCTG (2)
TGTATAAAAA (3)
TGTATACAAA
61.50.0615
P8 GC+SHH+1d cultureAAGGCACAGC (2)
AATTCTCTGT (4)
ACAAGATTTT (2)
GATCAAGAAA
GATCTTGCTG (3)
TGTATAAAAA (3)
TGTATACAAT
87.90.0879
3T3 fibroblastsAGGGTCCTGT (2)
GTGGGAGCTG
TCACAGACAC (2)
59.60.0596
E15 cortexAATTCTCTGT (4)
TCACAGACAC (2)
TGTATAAAAA (3)
24.70.0247
P1 cortexAATTCTCTGT (4)
ACAAGATTTT (2)
GATCAAGAAA
TAAATTTGTA
TGTATAAAAA (3)
186.20.1862
HypothalamusACAAGATTTT (2)
GATCTTGCTG (3)
TGTATAAAAA (3)
TGTTTAAAAA (2)
83.30.0833
E12.5 retinaAATTCTCTGT (4)
ACAAGATTTT (2)
TCACAGACAC (2)
TGTATAAAAA (3)
320.032
E14.5 retinaACAAGATTTT (2)
TAAATTTGTA
TCACAGACAC (2)
TGTATAAAAA (3)
TGTATACAAA
61.90.0619
E16.5 retinaAAGGCACAGC (2)
ACAAGATTTT (2)
GCTGGGTCAA (2)
TGTATAAAAA (3)
65.10.0651
E18.5 retinaAAGGCACAGC (2)
ACAAGATTTT (2)
AGGGTCTGTG (2)
GATCAAGAAA
GTCAAGAAAG
GTCAGAGACC (2)
GTGGGAGCTG
TGTATAAAAA (3)
TGTATACAAA
132.70.1327
P0.5 retinaACAAGATTTT (2)
GATCTTGCTG (3)
GTCAGAGACC (2)
TGTATAAAAA (3)
43.20.0432
P2.5 retinaAAGGCACAGC (2)
GTCAGAGACC (2)
TCACAGACAC (2)
TGGGAGCCTG (2)
TGTATAAAAA (3)
54.60.0546
P4.5 retinaAAGGCACAGC (2)
ACAAGATTTT (2)
GTCAAGAAAG
GTCAGAGACC (2)
TGTATAAAAA (3)
TGTATACAAA
TGTTTAAAAA (2)
89.20.0892
P6.5 retinaAATTCTCTGT (4)
GATCAAGAAA
GATCTTGCTG (3)
GGTATAAAAA (2)
TCACAGACAC (2)
TGTATAAAAA (3)
TGTATACAAT
TGTTTAAAAA (2)
93.50.0935
P10.5 crx- retinaAAGGCACAGC (2)
AGGGTCTGTG (2)
GATCAAGAAA
GATCTTGCTG (3)
TCACAGACAC (2)
TGTATAAAAA (3)
52.10.0521
P10.5 crx+ retinaAAGGCACAGC (2)
ACAAGATTTT (2)
GATCTTGCTG (3)
GCTGGGTCAA (2)
GTCAGAGACC (2)
TGGGAGCCTG (2)
TGTATAAAAA (3)
TGTATACAAT
76.80.0768
Adult retinalAAGGCACAGC (2)
ACAAGATTTT (2)
GGTATAAAAA (2)
GTCAGAGACC (2)
TGTATAAAAA (3)
280.028
ONLACAAGATTTT (2)
TCACAGACAC (2)
TGGGAGCCTG (2)
TGTATAAAAA (3)
34.40.0344