Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.102305 Tnrc6trinucleotide repeat containing 6 7    233833 
 Mm.102305 2010321I05RikRIKEN cDNA 2010321I05 gene 7    76695 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 85 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACTTTTTGGC (2)
TGTGTGCTGG (2)
TTGTTTTGAA (2)
11.40.0114
Cb medulloblastomaACTTTTTGGC (2)
AGAGAATTGG (3)
CTGTTTTGTG (3)
GTTCTCAGGA (2)
TTGTTTTGAA (2)
13.80.0138
P8 GC+1d cultureACTTCGTTAA (2)
ACTTTTTGGC (2)
CTGTTTTGAA (3)
GTTCTCAGGA (2)
TTGTTTTGAA (2)
20.40.0204
P8 GC+SHH+1d cultureACTTTTTGGC (2)
AGAGAATTGG (3)
CTGTTTTGAA (3)
GTTCTCAGGA (2)
TGTGGGATGT (3)
TTTAGCCTTC (2)
11.80.0118
3T3 fibroblastsTGTGTGCTGG (2)
3.50.0035
E15 cortexACTTTTTGGC (2)
GTTCTCAGGA (2)
14.80.0148
P1 cortexAGAGAATTGG (3)
TGTGTGCTGG (2)
TTGTTTTGAA (2)
13.50.0135
HypothalamusACTTCGTTAA (2)
CTGTTTTGAA (3)
GTTCTCAGGA (2)
TTGTTTTGAA (2)
12.60.0126
E12.5 retinaACTTCGTTAA (2)
ACTTTTTGGC (2)
TGTGTGCTGG (2)
TTGTTTTGAA (2)
18.80.0188
E14.5 retinaACTTCGTTAA (2)
ACTTTTTGGC (2)
GTTCTCAGGA (2)
7.20.0072
E16.5 retinaACTTCGTTAA (2)
ACTTTTTGGC (2)
CTGTTTTGAA (3)
CTGTTTTGTG (3)
GTTCTCAGGA (2)
TTGTTTTGAA (2)
21.60.0216
E18.5 retinaACTTCGTTAA (2)
ACTTTTTGGC (2)
GTTCTCAGGA (2)
TGTGTGCTGG (2)
12.70.0127
P0.5 retinaACTTTTTGGC (2)
GTTCTCAGGA (2)
TTGTTTTGAA (2)
TTTAGCCTTC (2)
11.90.0119
P2.5 retinaACTTTTTGGC (2)
CTGTTTTGAA (3)
GTTCTCAGGA (2)
TGTGTGCTGG (2)
TTGTTTTGAA (2)
TTTAGCCTTC (2)
21.30.0213
P4.5 retinaAGAGAATTGG (3)
CTGTTTTGAA (3)
GTTCTCAGGA (2)
TGTGGGATGT (3)
TTGTTTTGAA (2)
140.014
P6.5 retinaACTTCGTTAA (2)
ACTTTTTGGC (2)
CTGTTTTGAA (3)
GTTCTCAGGA (2)
TGTGGGATGT (3)
23.40.0234
P10.5 crx- retinaACTTTTTGGC (2)
CTGTTTTGAA (3)
TTGTTTTGAA (2)
TTTAGCCTTC (2)
14.90.0149
P10.5 crx+ retinaACTTTTTGGC (2)
AGAGAATTGG (3)
GTTCTCAGGA (2)
TGTGGGATGT (3)
TGTGTGCTGG (2)
TTTAGCCTTC (2)
26.80.0268
Adult retinalACTTCGTTAA (2)
ACTTTTTGGC (2)
AGAGAATTGG (3)
CTGTTTTGAA (3)
TTGTTTTGAA (2)
16.80.0168
ONLACTTTTTGGC (2)
CTGTTTTGTG (3)
TGTGGGATGT (3)
TGTGTGCTGG (2)
7.60.0076