Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.18705 Vps4bvacuolar protein sorting 4b (yeast) 1    20479 
 Gene Ontology ATP binding | ATPase activity | endosome | endosome transport | nucleotide binding
 Human Homolog VPS4B[vacuolar protein sorting 4B (yeast)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 55 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCACAACTGGT
CTATGCTATA
GAGCTTTAGA
TAAAATGTGG (2)
TTCTATTCTC
9.70.0097
Cb medulloblastomaAGTACTTGTT (2)
CTATGCTATA
TTCTATTCTC
6.90.0069
P8 GC+1d cultureAGTACTTGTT (2)
CTATGCTATA
GCGTCCACGA (2)
TAAAATGTGG (2)
6.80.0068
P8 GC+SHH+1d cultureAGTACTTGTT (2)
CTATGCTATA
TAAAATGTGG (2)
TGAACCAGGA (2)
TTCTATTCTC
8.30.0083
3T3 fibroblastsCTATGCTATA
3.50.0035
P1 cortexCACAACTGGT
TTCTATTCTC
13.60.0136
E12.5 retinaAGTACTTGTT (2)
CTATGCTATA
TAAAATGTGG (2)
TGAACCAGGA (2)
9.50.0095
E14.5 retinaCTATGCTATA
GAGCTTTAGA
TGAACCAGGA (2)
7.20.0072
E16.5 retinaCTATGCTATA
TGAACCAGGA (2)
7.20.0072
E18.5 retinaCTATGCTATA
GAGCTTTAGA
TGAACCAGGA (2)
TTCTATTCTC
10.80.0108
P0.5 retinaCTATGCTATA
GCGTCCACGA (2)
TGAACCAGGA (2)
9.90.0099
P2.5 retinaCTATGCTATA
TGAACCAGGA (2)
TTCTATTCTC
33.50.0335
P4.5 retinaCTATGCTATA
TGAACCAGGA (2)
TTCTATTCTC
33.70.0337
P6.5 retinaCTATGCTATA
TAAAATGTGG (2)
TGAACCAGGA (2)
TTCTATTCTC
23.40.0234
P10.5 crx- retinaCTATGCTATA
TAAAATGTGG (2)
TGAACCAGGA (2)
24.20.0242
P10.5 crx+ retinaCTATGCTATA
TGAACCAGGA (2)
15.40.0154
Adult retinalCTATGCTATA
GCGTCCACGA (2)
TGAACCAGGA (2)
TTCTATTCTC
16.80.0168