| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3)
| 6.5 | 0.0065 |
| P8 GC+1d culture | ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3)
| 9.1 | 0.0091 |
| P8 GC+SHH+1d culture | AACCTTGTCT (3) ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3)
| 8.2 | 0.0082 |
| 3T3 fibroblasts | GCTGTTTTGT (3)
| 17.5 | 0.0175 |
| E15 cortex | GCTGTTTTGT (3)
| 9.9 | 0.0099 |
| P1 cortex | GCTGTTTTGT (3)
| 4.5 | 0.0045 |
| Hypothalamus | GCTGTTTTGT (3)
| 1.8 | 0.0018 |
| E12.5 retina | AACCTTGTCT (3) ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3)
| 20.6 | 0.0206 |
| E14.5 retina | AACCTTGTCT (3) ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3)
| 7.2 | 0.0072 |
| E16.5 retina | AACCTTGTCT (3) GCTGTTTTGT (3)
| 16.3 | 0.0163 |
| E18.5 retina | AACCTTGTCT (3) GCTGTTTTGT (3)
| 5.4 | 0.0054 |
| P0.5 retina | AACCTTGTCT (3) ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3)
| 11.7 | 0.0117 |
| P2.5 retina | AACCTTGTCT (3) ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3)
| 12.4 | 0.0124 |
| P4.5 retina | GCTGTTTTGT (3)
| 11.9 | 0.0119 |
| P6.5 retina | ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3)
| 5 | 0.005 |
| P10.5 crx- retina | ACGCTATGGA (3) GCTGTTTTGT (3)
| 7.5 | 0.0075 |
| P10.5 crx+ retina | AACCTTGTCT (3) ACGCTATGGA (3)
| 3.8 | 0.0038 |
| ONL | GCTGTTTTGT (3)
| 5.7 | 0.0057 |