Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.246869 8430423A01RikRIKEN cDNA 8430423A01 gene 1  1 E4  98415 
 Mm.246869 2700010L10RikRIKEN cDNA 2700010L10 gene 1    108914 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 3 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 97 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATAATGACAT (2)
GAAGGTTTGC (2)
GCTGCAAAGC (2)
GTACTAAGGA (3)
GTGTCTCAAA (2)
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
16.30.0163
Cb medulloblastomaATAATGACAT (2)
ATAGTGACAT (2)
GTGTCTCAAA (2)
GTGTGCGGAC (2)
TTATTTTTAG (2)
TTCGCTGTCG (2)
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
29.90.0299
P8 GC+1d cultureATAATGACAT (2)
ATAGTGACAT (2)
TTATTTTTAG (2)
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
90.009
P8 GC+SHH+1d cultureAATTCTGGAT (2)
ATAATGACAT (2)
GGGGAGGGTA (2)
GTACTAAGGA (3)
GTGTCTCAAA (2)
TTATTTTTAG (2)
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
18.60.0186
3T3 fibroblastsGGCTTTCAGT (3)
TCTCGGCCTG (2)
TTCGCTGTCG (2)
TTGGTATTGT (2)
38.50.0385
E15 cortexTTTGTCTCAG (3)
4.90.0049
P1 cortexGTGTCTCAAA (2)
TCTCGGCCTG (2)
TTATTTTTAG (2)
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
27.10.0271
HypothalamusATAGTGACAT (2)
GAAGGTTTGC (2)
GGGGAGGGTA (2)
5.40.0054
E12.5 retinaAATTCTGGAT (2)
GCTGCAAAGC (2)
GGCTTTCAGT (3)
GTACTAAGGA (3)
GTGTGCGGAC (2)
TTATTTTTAG (2)
TTCGCTGTCG (2)
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
22.70.0227
E14.5 retinaGTGTCTCAAA (2)
1.80.0018
E16.5 retinaTTGGTATTGT (2)
1.80.0018
E18.5 retinaGTGTCTCAAA (2)
TTTGTCTCAG (3)
TTTTCAATGG (2)
7.20.0072
P0.5 retinaATAGTGACAT (2)
GTGTCTCAAA (2)
GTGTGCGGAC (2)
TTATTTTTAG (2)
TTCGCTGTCG (2)
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
TTTTCAATGG (2)
19.80.0198
P2.5 retinaGCTGCAAAGC (2)
GGCTTTCAGT (3)
GGGGAGGGTA (2)
GTACTAAGGA (3)
GTGTCTCAAA (2)
TTTGTCTCAG (3)
TTTTCAATGG (2)
19.50.0195
P4.5 retinaATAATGACAT (2)
GTACTAAGGA (3)
GTGTCTCAAA (2)
GTGTGCGGAC (2)
TTTGTCTCAG (3)
TTTTCAATGG (2)
160.016
P6.5 retinaGTACTAAGGA (3)
GTGTCTCAAA (2)
TTATTTTTAG (2)
8.40.0084
P10.5 crx- retinaGCTGCAAAGC (2)
GGCTTTCAGT (3)
TTCTGAGCAG (2)
TTTGTCTCAG (3)
TTTTCAATGG (2)
9.50.0095
P10.5 crx+ retinaGGCTTTCAGT (3)
GTACTAAGGA (3)
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
19.20.0192
Adult retinalATAATGACAT (2)
ATAGTGACAT (2)
GTACTAAGGA (3)
TCTCGGCCTG (2)
TTATTTTTAG (2)
TTGGTATTGT (2)
150.015
ONLGGGGAGGGTA (2)
GTACTAAGGA (3)
TTTGTCTCAG (3)
7.60.0076