Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.246990 A830080L01RikRIKEN cDNA A830080L01 gene 19    320200 
 Mm.246990 A830039H05RikRIKEN cDNA A830039H05 gene 19    320596 
 Mm.246990 Rtn3reticulon 3 19    20168 
 Gene Ontology endoplasmic reticulum | integral to membrane | molecular_function unknown
 Human Homolog RTN3[reticulon 3]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 103 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAGCCTTC (5)
AGAGGGTTTT (3)
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
TAAAGCTCCA (3)
TCACTAAGTT (5)
TGGCTGATGA (4)
TGTTGGTTGA (3)
52.10.0521
Cb medulloblastomaAAAAGCCTTC (5)
AGAGGGTTTT (3)
GAAATCCAGT (3)
GATCCCAGAC (3)
TCACTAAGTT (5)
TGTGGTGTGT (3)
TGTTGGTTGA (3)
41.50.0415
P8 GC+1d cultureAGAGGGTTTT (3)
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
GTCTATGGGG (3)
TGGCTGATGA (4)
TGTTGGTTGA (3)
43.30.0433
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAGCCTTC (5)
AGAGGGTTTT (3)
GGAATCCTTG (3)
GTCTATGGGG (3)
TGTTGGTTGA (3)
45.70.0457
3T3 fibroblastsAGAGGGTTTT (3)
CAGCTGCTTG (3)
TGGCTGATGA (4)
TGTTGGTTGA (3)
210.021
E15 cortexAGAGGGTTTT (3)
GGAATCCTTG (3)
29.60.0296
P1 cortexAGAGGGTTTT (3)
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
TACCATAAAA (4)
TGTTGGTTGA (3)
40.90.0409
HypothalamusAGAGGGTTTT (3)
GAAATCCAGT (3)
GGAATCCTTG (3)
GTGATGGGAG (3)
TGGCTGATGA (4)
25.30.0253
E12.5 retinaAGAGGGTTTT (3)
GGAATCCTTG (3)
GTCTATGGGG (3)
TGTTGGTTGA (3)
150.015
E14.5 retinaAGAGGGTTTT (3)
GGAATCCTTG (3)
TGTTGGTTGA (3)
25.60.0256
E16.5 retinaAGAGGGTTTT (3)
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
TAAAGCTCCA (3)
TACCATAAAA (4)
TCACTAAGTT (5)
TGTTGGTTGA (3)
41.60.0416
E18.5 retinaAGAGGGTTTT (3)
GGAATCCTTG (3)
TGTTGGTTGA (3)
14.60.0146
P0.5 retinaAGAGGGTTTT (3)
CAGCTGCTTG (3)
GAAATCCAGT (3)
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
TAAAGCTCCA (3)
TGTTGGTTGA (3)
41.30.0413
P2.5 retinaAGAGGGTTTT (3)
GGAATCCTTG (3)
TGTTGGTTGA (3)
21.20.0212
P4.5 retinaAGAGGGTTTT (3)
CAGCTGCTTG (3)
GGAATCCTTG (3)
GTCTATGGGG (3)
TGTTGGTTGA (3)
31.80.0318
P6.5 retinaAGAGGGTTTT (3)
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
GTCTATGGGG (3)
TCACTAAGTT (5)
TGTTGGTTGA (3)
21.80.0218
P10.5 crx- retinaAGAGGGTTTT (3)
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
TCACTAAGTT (5)
TGTTGGTTGA (3)
50.30.0503
P10.5 crx+ retinaAGAGGGTTTT (3)
GATCCCAGAC (3)
GGAATCCTTG (3)
GTGATGGGAG (3)
TCACTAAGTT (5)
TGTTGGTTGA (3)
24.90.0249
Adult retinalAGAGGGTTTT (3)
GGAATCCTTG (3)
GTCTATGGGG (3)
GTGATGGGAG (3)
TAAAGCTCCA (3)
TCACTAAGTT (5)
TGTGGTGTGT (3)
TGTTGGTTGA (3)
39.10.0391
ONLAGAGGGTTTT (3)
GGAATCCTTG (3)
TCACTAAGTT (5)
TGTTGGTTGA (3)
30.60.0306