Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.147091 C230011H18RikRIKEN cDNA C230011H18 gene 2    399590 
 Mm.147091 D230046B21RikRIKEN cDNA D230046B21 gene 2    320325 
 Mm.147091 6430543K15RikRIKEN cDNA 6430543K15 gene 2    320349 
 Mm.147091 B230345P09RikRIKEN cDNA B230345P09 gene 2    319536 
 Mm.147091 Cugbp2CUG triplet repeat,RNA binding protein 2 2    14007 
 Gene Ontology mRNA splice site selection | nucleus | pre-mRNA splicing factor activity
 Human Homolog CUGBP2[CUG triplet repeat, RNA binding protein 2]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 119 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAACCCTTAT (5)
ACATTTATTG (5)
ATTGGTGTTA (5)
CAAGACTGAA (5)
CCTACAGTCC (5)
CGTCTGAGAA (6)
GATTGTCTAA (5)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
620.062
Cb medulloblastomaGTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
11.50.0115
P8 GC+1d cultureAAACCCTTAT (5)
ACATTTATTG (5)
CAAGACTGAA (5)
CCTACAGTCC (5)
GATTGTCTAA (5)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
TTTCATTGTT (6)
45.60.0456
P8 GC+SHH+1d cultureAAACCCTTAT (5)
ACATTTATTG (5)
CCTACAGTCC (5)
GAGGGTGTGT (5)
GATTGTCTAA (5)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
TTTCATTGTT (6)
51.50.0515
E15 cortexCCTACAGTCC (5)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
34.60.0346
P1 cortexAAACCCTTAT (5)
ATTGGTGTTA (5)
CGTCTGAGAA (6)
GATTGTCTAA (5)
TTTCATTGTT (6)
27.10.0271
HypothalamusACATTTATTG (5)
CAAGACTGAA (5)
CCTACAGTCC (5)
GATTGTCTAA (5)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
19.80.0198
E12.5 retinaAAACCCTTAT (5)
ACATTTATTG (5)
CAAGACTGAA (5)
GATTGTCTAA (5)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
33.90.0339
E14.5 retinaCCTACAGTCC (5)
GATTGTCTAA (5)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
TTTCATTGTT (6)
25.40.0254
E16.5 retinaAAACCCTTAT (5)
ACATTTATTG (5)
ATTGGTGTTA (5)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
28.90.0289
E18.5 retinaACATTTATTG (5)
CCTACAGTCC (5)
CGTCTGAGAA (6)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
38.10.0381
P0.5 retinaAAACCCTTAT (5)
CAAGACTGAA (5)
CCTACAGTCC (5)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
TTTCATTGTT (6)
23.70.0237
P2.5 retinaAAACCCTTAT (5)
ACATTTATTG (5)
ATTGGTGTTA (5)
CAAGACTGAA (5)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
38.70.0387
P4.5 retinaACATTTATTG (5)
ATTGGTGTTA (5)
CAAGACTGAA (5)
CGTCTGAGAA (6)
GATTGTCTAA (5)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
TTTCATTGTT (6)
37.80.0378
P6.5 retinaAAACCCTTAT (5)
ACATTTATTG (5)
CCTACAGTCC (5)
CGTCTGAGAA (6)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
33.40.0334
P10.5 crx- retinaACATTTATTG (5)
CAAGACTGAA (5)
GAGGGTGTGT (5)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
16.90.0169
P10.5 crx+ retinaACATTTATTG (5)
CAAGACTGAA (5)
GATTGTCTAA (5)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
15.30.0153
Adult retinalACATTTATTG (5)
CCTACAGTCC (5)
GATTGTCTAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
TTTCATTGTT (6)
150.015
ONLAAACCCTTAT (5)
ACATTTATTG (5)
CGTCTGAGAA (6)
GAGGGTGTGT (5)
TGAGAGAAAA (5)
TTGGTGCTTC (7)
15.20.0152