Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.150856 Hmg20ahigh mobility group 20A 9    66867 
 Mm.150856 5830432F11RikRIKEN cDNA 5830432F11 gene 9    76029 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 119 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAGGTGAGCG
GAAGACCTTT
TCTCAAAAAA (3)
TGCTGCTGAC
TGTTTGGAGC (3)
65.20.0652
Cb medulloblastomaCAGGTGAGCG
GAAGACCTTT
GACCAGAAAA (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTTTGGAGC (3)
29.90.0299
P8 GC+1d cultureATCCTGGAGA
CAGGTGAGCG
GACCAGAAAA (2)
GAGGAAGAGG (3)
GGGGGTGGCT (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTTAGGCTT (2)
TGTTTGGAGC (3)
60.30.0603
P8 GC+SHH+1d cultureATCCTGGAGA
CAGGTGAGCG
GACCAGAAAA (2)
GTGGACTCTG (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTTTGGAGC (3)
57.50.0575
3T3 fibroblastsCAGGTGAGCG
42.10.0421
E15 cortexCAGGTGAGCG
GAGGAAGAGG (3)
TGTTTGGAGC (3)
49.40.0494
P1 cortexAGGGCTGTGT (2)
CAGGGTGAGC (2)
CAGGTGAGCG
GAGGAAGAGG (3)
180.018
HypothalamusCAGACCAGCA (3)
CAGGGTGAGC (2)
CAGGTGAGCG
GTGGACTCTG (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGCTGCTGAC
TGTTTGGAGC (3)
27.10.0271
E12.5 retinaATCCTGGAGA
CAGGGTGAGC (2)
CAGGTGAGCG
GAAGACCTTT
GAGGAAGAGG (3)
TGTTTGGAGC (3)
52.70.0527
E14.5 retinaATCCTGGAGA
CAGGTGAGCG
GAAGACCTTT
GAGGAAGAGG (3)
TCTCAAAAAA (3)
TGTTTGGAGC (3)
32.70.0327
E16.5 retinaATCCTGGAGA
CAGGTGAGCG
GTGGACTCTG (2)
TACACAATAT (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTTTGGAGC (3)
34.30.0343
E18.5 retinaCAGACCAGCA (3)
CAGGTGAGCG
GAAGACCTTT
GACCAGAAAA (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTTTGGAGC (3)
30.80.0308
P0.5 retinaAGGGCTGTGT (2)
ATCCTGGAGA
CAGGGTGAGC (2)
CAGGTGAGCG
GAAGACCTTT
GAGGAAGAGG (3)
TGTTAGGCTT (2)
TGTTTGGAGC (3)
670.067
P2.5 retinaAGGGCTGTGT (2)
ATCCTGGAGA
CAGGGTGAGC (2)
CAGGTGAGCG
GAAGACCTTT
GGGGGTGGCT (2)
TACACAATAT (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTTTGGAGC (3)
35.40.0354
P4.5 retinaAGGGCTGTGT (2)
CAGGGTGAGC (2)
CAGGTGAGCG
GAAGACCTTT
TCTCAAAAAA (3)
TGTTTGGAGC (3)
25.90.0259
P6.5 retinaAGGGCTGTGT (2)
ATCCTGGAGA
CAGACCAGCA (3)
CAGGGTGAGC (2)
CAGGTGAGCG
GAAGACCTTT
GAATCCCAGC (6)
TACACAATAT (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTTTGGAGC (3)
30.20.0302
P10.5 crx- retinaAGGGCTGTGT (2)
ATCCTGGAGA
CAGGTGAGCG
GAGGAAGAGG (3)
TACACAATAT (2)
TGTTTGGAGC (3)
55.90.0559
P10.5 crx+ retinaCAGGTGAGCG
GAAGACCTTT
GAATCCCAGC (6)
GGGGGTGGCT (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTTTGGAGC (3)
38.30.0383
Adult retinalAGGGCTGTGT (2)
CAGGTGAGCG
TCTCAAAAAA (3)
TGCTGCTGAC
53.70.0537
ONLAGGGCTGTGT (2)
CAGGTGAGCG
GAATCCCAGC (6)
GGGGGTGGCT (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTTAGGCTT (2)
TGTTTGGAGC (3)
30.70.0307