Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.153030 1110019K23RikRIKEN cDNA 1110019K23 gene 5  5 E2  68621 
 Mm.153030 E330024J20RikRIKEN cDNA E330024J20 gene 5    320654 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 142 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAAAAAA (2)
AAAATTACAG (2)
GAAGGGTATT (2)
GCGACGCGGG (3)
GTGGTTCACA (2)
TAATTGTACT (2)
TGAAGAATAC (2)
241.40.2414
Cb medulloblastomaAAAAAAAAAA (2)
AAAATTACAG (2)
GAAGGGTATT (2)
GCGACGCGGG (3)
GGAGCAGAAA
GTGGTTCACA (2)
TAGAGAAAAC
TATTTATTTT (3)
825.50.8255
P8 GC+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
AAAATTACAG (2)
ACATTTGAAT (2)
CTCTTAATAC (2)
GAAGGGTATT (2)
GCGACGCGGG (3)
GGAGCAGAAA
GTGGTTCACA (2)
TAATTGTACT (2)
TGAAGAATAC (2)
244.20.2442
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
AAAATACAGC
AAAATTACAG (2)
CTCTTAATAC (2)
GCGACGCGGG (3)
GTGGTTCACA (2)
TAAAGAATAC (2)
TAATTGTACT (2)
TAGAGAAAAC
TGAAGAATAC (2)
345.40.3454
3T3 fibroblastsAAAAAAAAAA (2)
GCGACGCGGG (3)
GTGGTTCACA (2)
52.50.0525
E15 cortexAAAAAAAAAA (2)
GAAGGGTATT (2)
GTGGTTCACA (2)
GTTACAGGGA
TAGAGAAAAC
TGGGCTCTGG (2)
242.30.2423
P1 cortexAAAAAAAAAA (2)
GCGACGCGGG (3)
GTGGTTCACA (2)
TGAAGAATAC (2)
286.30.2863
HypothalamusAAAAAAAAAA (2)
AAAATTACAG (2)
CTCTTAATAC (2)
GAAGGGTATT (2)
GCGACGCGGG (3)
GTGGTTCACA (2)
TAATTGTACT (2)
161.20.1612
E12.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAATTACAG (2)
GAAGGGTATT (2)
GCGACGCGGG (3)
GTGGTTCACA (2)
TGAAGAATAC (2)
1840.184
E14.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAATTACAG (2)
GAAGGGTATT (2)
GCGACGCGGG (3)
GTGGTTCACA (2)
TAATTGTACT (2)
TATTTATTTT (3)
TGAAGAATAC (2)
165.70.1657
E16.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAATACAGC
AAAATTACAG (2)
GAAGGGTATT (2)
GCGACGCGGG (3)
GGAGCAGAAA
GTGGTTCACA (2)
TAATTGTACT (2)
TGAAGAATAC (2)
115.90.1159
E18.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAATTACAG (2)
GAAGGGTATT (2)
GCGACGCGGG (3)
GTGGTTCACA (2)
TGAAGAATAC (2)
458.50.4585
P0.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
GAAGGGTATT (2)
GCGACGCGGG (3)
GTGGTTCACA (2)
TAAAGAATAC (2)
TAATTGTACT (2)
TGAAGAATAC (2)
172.90.1729
P2.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAATTACAG (2)
GAAGGGTATT (2)
GCGACGCGGG (3)
GTGGTTCACA (2)
TGAAGAATAC (2)
390.60.3906
P4.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAATTACAG (2)
GAAGGGTATT (2)
GCGACGCGGG (3)
GTGGTTCACA (2)
TAATTGTACT (2)
TGAAGAATAC (2)
382.40.3824
P6.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAATTACAG (2)
GAAGGGTATT (2)
GCGACGCGGG (3)
GGAGCAGAAA
GTGGTTCACA (2)
GTTACAGGGA
TGAAGAATAC (2)
TGGGCTCTGG (2)
331.80.3318
P10.5 crx- retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAATTACAG (2)
ACATTTGAAT (2)
GAAGGGTATT (2)
GCGACGCGGG (3)
GTGGTTCACA (2)
TAATTGTACT (2)
TAGAGAAAAC
TGAAGAATAC (2)
94.80.0948
P10.5 crx+ retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAATTACAG (2)
GAAGGGTATT (2)
GCGACGCGGG (3)
GTGGTTCACA (2)
TGAAGAATAC (2)
155.70.1557
Adult retinalAAAAAAAAAA (2)
AAAATACAGC
GCGACGCGGG (3)
GTGGTTCACA (2)
GTTACAGGGA
TATTTATTTT (3)
98.30.0983
ONLAAAAAAAAAA (2)
ACATTTGAAT (2)
GAAGGGTATT (2)
GCGACGCGGG (3)
GTGGTTCACA (2)
GTTACAGGGA
TAAAGAATAC (2)
TGGGCTCTGG (2)
156.90.1569