Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.153061 1700023D09RikRIKEN cDNA 1700023D09 gene 19    69445 
 Mm.153061 Stx5asyntaxin 5A 19    56389 
 Mm.153061 B930096F20RikRIKEN cDNA B930096F20 gene 19    319332 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 99 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTGGTTGCTGG (369)68.50.0685
P8 Cb GCCCTTTAATCC (355)52.20.0522
P8 Cb GCGAGGGCTTGG (9)29.40.0294
P8 Cb GCCTGCAGCCTA (6)16.30.0163
Cb medulloblastomaTGGTTGCTGG (369)113.30.1133
Cb medulloblastomaCCTTTAATCC (355)41.60.0416
Cb medulloblastomaGAGGGCTTGG (9)23.10.0231
Cb medulloblastomaCTGCAGCCTA (6)13.90.0139
P8 GC+1d cultureTGGTTGCTGG (369)57.10.0571
P8 GC+1d cultureCCTTTAATCC (355)320.032
P8 GC+1d cultureCTGCAGCCTA (6)9.10.0091
P8 GC+1d cultureGAGGGCTTGG (9)9.10.0091
P8 GC+1d cultureTGGTTTCGTT (4)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTGGTTGCTGG (369)890.089
P8 GC+SHH+1d cultureCCTTTAATCC (355)25.80.0258
P8 GC+SHH+1d cultureCTGCAGCCTA (6)16.40.0164
P8 GC+SHH+1d cultureGAGGGCTTGG (9)16.40.0164
P8 GC+SHH+1d cultureTGGTTTCGTT (4)2.30.0023
3T3 fibroblastsTGGTTGCTGG (369)220.80.2208
3T3 fibroblastsCCTTTAATCC (355)70.10.0701
3T3 fibroblastsGAGGGCTTGG (9)350.035
3T3 fibroblastsCTGCAGCCTA (6)17.50.0175
E15 cortexTGGTTGCTGG (369)277.10.2771
E15 cortexCCTTTAATCC (355)54.40.0544
E15 cortexGAGGGCTTGG (9)24.70.0247
P1 cortexCCTTTAATCC (355)154.50.1545
P1 cortexTGGTTGCTGG (369)86.40.0864
P1 cortexGAGGGCTTGG (9)13.60.0136
HypothalamusTGGTTGCTGG (369)349.60.3496
HypothalamusCTGCAGCCTA (6)21.70.0217
HypothalamusCCTTTAATCC (355)19.90.0199
HypothalamusGAGGGCTTGG (9)10.90.0109
HypothalamusGTGAGGAGAA (4)3.60.0036
HypothalamusTGGTTTCGTT (4)3.60.0036
HypothalamusATAGCAGTGT (7)1.80.0018
E12.5 retinaTGGTTGCTGG (369)157.70.1577
E12.5 retinaCCTTTAATCC (355)75.10.0751
E12.5 retinaGAGGGCTTGG (9)31.90.0319
E12.5 retinaCTGCAGCCTA (6)11.30.0113
E14.5 retinaTGGTTGCTGG (369)936.50.9365
E14.5 retinaCCTTTAATCC (355)120.30.1203
E14.5 retinaCTGCAGCCTA (6)7.30.0073
E14.5 retinaGAGGGCTTGG (9)7.30.0073
E16.5 retinaTGGTTGCTGG (369)767.90.7679
E16.5 retinaCCTTTAATCC (355)68.80.0688
E16.5 retinaCTGCAGCCTA (6)21.70.0217
E16.5 retinaGAGGGCTTGG (9)19.90.0199
E16.5 retinaGGAAAGATCT (6)3.60.0036
E16.5 retinaATAGCAGTGT (7)1.80.0018
E16.5 retinaGTGAGGAGAA (4)1.80.0018
E18.5 retinaTGGTTGCTGG (369)252.80.2528
E18.5 retinaCTGCAGCCTA (6)34.60.0346
E18.5 retinaCCTTTAATCC (355)23.60.0236
E18.5 retinaGAGGGCTTGG (9)16.40.0164
P0.5 retinaTGGTTGCTGG (369)190.40.1904
P0.5 retinaCCTTTAATCC (355)72.60.0726
P0.5 retinaGAGGGCTTGG (9)11.80.0118
P0.5 retinaCTGCAGCCTA (6)7.90.0079
P0.5 retinaTGAGGTGAGG (5)3.90.0039
P0.5 retinaATAGCAGTGT (7)20.002
P0.5 retinaTGGTTTCGTT (4)20.002
P2.5 retinaTGGTTGCTGG (369)165.40.1654
P2.5 retinaCCTTTAATCC (355)70.40.0704
P2.5 retinaGAGGGCTTGG (9)24.60.0246
P2.5 retinaCTGCAGCCTA (6)21.10.0211
P2.5 retinaTGGTTTCGTT (4)1.80.0018
P4.5 retinaTGGTTGCTGG (369)150.60.1506
P4.5 retinaCCTTTAATCC (355)43.60.0436
P4.5 retinaCTGCAGCCTA (6)23.80.0238
P4.5 retinaGAGGGCTTGG (9)11.90.0119
P6.5 retinaTGGTTGCTGG (369)156.70.1567
P6.5 retinaCCTTTAATCC (355)700.07
P6.5 retinaCTGCAGCCTA (6)200.02
P6.5 retinaGAGGGCTTGG (9)18.30.0183
P6.5 retinaGTGAGGAGAA (4)1.70.0017
P6.5 retinaTGAGGTGAGG (5)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTGGTTGCTGG (369)280.50.2805
P10.5 crx- retinaCCTTTAATCC (355)63.20.0632
P10.5 crx- retinaGAGGGCTTGG (9)59.40.0594
P10.5 crx- retinaCTGCAGCCTA (6)20.40.0204
P10.5 crx- retinaGTGAGGAGAA (4)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTGGTTTCGTT (4)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTGAGGTGAGG (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGGTTGCTGG (369)101.90.1019
P10.5 crx+ retinaCCTTTAATCC (355)38.40.0384
P10.5 crx+ retinaGAGGGCTTGG (9)30.80.0308
P10.5 crx+ retinaCTGCAGCCTA (6)26.90.0269
P10.5 crx+ retinaATAGCAGTGT (7)1.90.0019
Adult retinalTGGTTGCTGG (369)214.80.2148
Adult retinalCCTTTAATCC (355)129.60.1296
Adult retinalCTGCAGCCTA (6)130.013
Adult retinalGAGGGCTTGG (9)11.10.0111
Adult retinalTGGTTTCGTT (4)3.70.0037
ONLTGGTTGCTGG (369)398.40.3984
ONLCCTTTAATCC (355)84.30.0843
ONLCTGCAGCCTA (6)11.50.0115
ONLGAGGGCTTGG (9)7.70.0077
ONLACAGTCAGGG (4)5.70.0057
ONLGGAAAGATCT (6)3.80.0038