Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.154136 D5Abb2eDNA segment, Chr 5, Abbott 2 expressed 5  5 66.0 cM  27760 
 Mm.154136 2500003M10RikRIKEN cDNA 2500003M10 gene 3    66511 
 Mm.154136 D19Bwg0552eDNA segment, Chr 19, Brigham & Women's Genetics 0552 expressed 19  19 5.0 cM  52861 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 46 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTGCTGCTCGT (4)13.10.0131
P8 Cb GCAGAAGAAATC (4)3.30.0033
P8 Cb GCAGAATGCCAA (4)1.60.0016
Cb medulloblastomaTGCTGCTCGT (4)16.20.0162
Cb medulloblastomaAGAATGCCAA (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGCTGCTCGT (4)320.032
P8 GC+1d cultureAGAAGAAATC (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAGACAGAAAG (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTATGCATCCA (3)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTGCTGCTCGT (4)21.10.0211
P8 GC+SHH+1d cultureTATGCATCCA (3)1.20.0012
3T3 fibroblastsTGCTGCTCGT (4)17.50.0175
3T3 fibroblastsTATGCATCCA (3)3.50.0035
E15 cortexTGCTGCTCGT (4)19.80.0198
E15 cortexAGACAGAAAG (4)4.90.0049
P1 cortexTGCTGCTCGT (4)9.10.0091
HypothalamusTGCTGCTCGT (4)12.70.0127
E12.5 retinaTGCTGCTCGT (4)20.70.0207
E12.5 retinaTATGCATCCA (3)3.80.0038
E12.5 retinaAGAAGAAATC (4)1.90.0019
E14.5 retinaTGCTGCTCGT (4)14.60.0146
E16.5 retinaTGCTGCTCGT (4)9.10.0091
E18.5 retinaTGCTGCTCGT (4)23.60.0236
E18.5 retinaAGAAGAAATC (4)3.60.0036
E18.5 retinaAGCCCTTCCC (4)1.80.0018
E18.5 retinaTATGCATCCA (3)1.80.0018
P0.5 retinaTGCTGCTCGT (4)19.60.0196
P0.5 retinaAGAAGAAATC (4)3.90.0039
P0.5 retinaAGACAGAAAG (4)3.90.0039
P0.5 retinaAGAATGCCAA (4)20.002
P0.5 retinaTATGCATCCA (3)20.002
P2.5 retinaTGCTGCTCGT (4)24.60.0246
P2.5 retinaAGACAGAAAG (4)3.50.0035
P2.5 retinaAGCCCTTCCC (4)1.80.0018
P4.5 retinaTGCTGCTCGT (4)11.90.0119
P4.5 retinaAGCCCTTCCC (4)20.002
P6.5 retinaTGCTGCTCGT (4)11.70.0117
P6.5 retinaAGACAGAAAG (4)3.30.0033
P6.5 retinaAGAAGAAATC (4)1.70.0017
P6.5 retinaTATGCATCCA (3)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTGCTGCTCGT (4)24.20.0242
P10.5 crx+ retinaTGCTGCTCGT (4)26.90.0269
P10.5 crx+ retinaAGCCCTTCCC (4)1.90.0019
Adult retinalTGCTGCTCGT (4)22.20.0222
ONLAGACAGAAAG (4)5.70.0057
ONLTGCTGCTCGT (4)3.80.0038