Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.157648 5730403B10RikRIKEN cDNA 5730403B10 gene 16  16 2.7 cM  66626 
 Mm.157648 C77872expressed sequence C77872 16    98011 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 91 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTAAATACCA (2)
GCCTCCTATC (2)
TCTGCTCTTC (2)
TTGTTTGCAT (4)
TTTTTTTTTT (2)
16.30.0163
Cb medulloblastomaGCCTCCTATC (2)
TGCTCTGCCT (2)
TTGTTTGCAT (4)
TTTTTTTTTT (2)
23.10.0231
P8 GC+1d cultureCTAAATACCA (2)
GCCTCCTATC (2)
TCCTGTCTAA (2)
TGCTCTGCCT (2)
TTGTTTGCAT (4)
TTTTTTTTTT (2)
34.20.0342
P8 GC+SHH+1d cultureGCCTCCTATC (2)
TCCTGTCTAA (2)
TGCTCTGCCT (2)
TTGTTTGCAT (4)
TTTTTTTTTT (2)
22.40.0224
3T3 fibroblastsCCAGCAGGCA (2)
GCCTCCTATC (2)
TGCTCTGCCT (2)
17.50.0175
E15 cortexCCAGCAGGCA (2)
GCCTCCTATC (2)
TGCTCTGCCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
24.60.0246
P1 cortexCCAGCAGGCA (2)
TCTGCTCTTC (2)
TGCTCTGCCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
45.30.0453
HypothalamusGCCTCCTATC (2)
TCTGCTCTTC (2)
TGCTCTGCCT (2)
TTGTTTGCAT (4)
TTTTTTTTTT (2)
270.027
E12.5 retinaTCTGCTCTTC (2)
TGCTCTGCCT (2)
TTGTTTGCAT (4)
TTTTTTTTTT (2)
20.60.0206
E14.5 retinaTCCTGTCTAA (2)
TGCTCTGCCT (2)
TTGTTTGCAT (4)
TTTTTTTTTT (2)
30.90.0309
E16.5 retinaTCCTGTCTAA (2)
TGCTCTGCCT (2)
TTGTTTGCAT (4)
TTTTTTTTTT (2)
16.20.0162
E18.5 retinaGCCTCCTATC (2)
TGCTCTGCCT (2)
TTGTTTGCAT (4)
TTTTTTTTTT (2)
200.02
P0.5 retinaCTAAATACCA (2)
GCCTCCTATC (2)
TGCTCTGCCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
19.60.0196
P2.5 retinaGCCTCCTATC (2)
TCGGCCCAGA
TGCTCTGCCT (2)
TTGTTTGCAT (4)
TTTTTTTTTT (2)
28.20.0282
P4.5 retinaGCCTCCTATC (2)
TCCTGTCTAA (2)
TCTGCTCTTC (2)
TGCTCTGCCT (2)
TTGTTTGCAT (4)
TTTTTTTTTT (2)
29.80.0298
P6.5 retinaCCAGCAGGCA (2)
CTAAATACCA (2)
GCCTCCTATC (2)
TCCTGTCTAA (2)
TCTGCTCTTC (2)
TGCTCTGCCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
33.20.0332
P10.5 crx- retinaGCCTCCTATC (2)
TGCTCTGCCT (2)
TTGTTTGCAT (4)
130.013
P10.5 crx+ retinaGCCTCCTATC (2)
TCGGCCCAGA
TGCTCTGCCT (2)
TTGTTTGCAT (4)
TTTTTTTTTT (2)
44.20.0442
Adult retinalGCCTCCTATC (2)
TCCTGTCTAA (2)
TCGGCCCAGA
TGCTCTGCCT (2)
TTGTTTGCAT (4)
TTTTTTTTTT (2)
44.60.0446
ONLGCCTCCTATC (2)
TCTGCTCTTC (2)
TTTTTTTTTT (2)
9.50.0095