Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.168965 C130015C19hypothetical LOC403342     403342 
 Mm.168965 Nsd1nuclear receptor-binding SET-domain protein 1 13  13 B1  18193 
 Gene Ontology gastrulation (sensu Mammalia) | histone methyltransferase activity | negative regulation of transcription from Pol II promoter | nucleus | protein binding | receptor activity | regulation of transcription, DNA-dependent | transcription cofactor activity
 Human Homolog NSD1[nuclear receptor binding SET domain protein 1] | NSD1[nuclear receptor binding SET domain protein 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 89 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAATAGCTCCA (2)
CTGCGGCTTC (2)
CTGTGTGTAA (3)
TACTGTAATT (4)
TGTGTGCCCA (3)
22.80.0228
Cb medulloblastomaCTGCGGCTTC (2)
CTGTGTGTAA (3)
TACTGTAATT (4)
TGTGTGCCCA (3)
670.067
P8 GC+1d cultureAATAGCTCCA (2)
CTGCGGCTTC (2)
CTGTGTGTAA (3)
GGGACTTGTG (2)
TACTGTAATT (4)
TGTGTGCCCA (3)
TTCCAACCAG (2)
27.30.0273
P8 GC+SHH+1d cultureAGACAGCTCC (2)
CTGCGGCTTC (2)
CTGTGTGTAA (3)
GGGACTTGTG (2)
TACTGTAATT (4)
TGTGTGCCCA (3)
TTCCAACCAG (2)
33.80.0338
3T3 fibroblastsCTGCGGCTTC (2)
CTGTGTGTAA (3)
TACTGTAATT (4)
49.10.0491
E15 cortexCTGCGGCTTC (2)
GGGACTTGTG (2)
TACTGTAATT (4)
TGTGTGCCCA (3)
34.60.0346
P1 cortexCTGCGGCTTC (2)
18.20.0182
HypothalamusCTGCGGCTTC (2)
GGGACTTGTG (2)
TGTGTGCCCA (3)
94.10.0941
E12.5 retinaCTGCGGCTTC (2)
GGGACTTGTG (2)
TACTGTAATT (4)
TTCCAACCAG (2)
39.40.0394
E14.5 retinaCTGAGTTGCC (2)
CTGCGGCTTC (2)
CTGTGTGTAA (3)
TGTGTGCCCA (3)
25.40.0254
E16.5 retinaCTGCGGCTTC (2)
CTGTGTGTAA (3)
GGGACTTGTG (2)
TACTGTAATT (4)
TGTGTGCCCA (3)
21.70.0217
E18.5 retinaCTGCGGCTTC (2)
TACTGTAATT (4)
65.50.0655
P0.5 retinaCTGCGGCTTC (2)
CTGTGTGTAA (3)
TACTGTAATT (4)
TGTGTGCCCA (3)
TTCCAACCAG (2)
21.70.0217
P2.5 retinaCTGCGGCTTC (2)
CTGTGTGTAA (3)
GGGACTTGTG (2)
TACTGTAATT (4)
TGTGTGCCCA (3)
24.60.0246
P4.5 retinaAATAGCTCCA (2)
CTGCGGCTTC (2)
CTGTGTGTAA (3)
GGGACTTGTG (2)
TACTGTAATT (4)
TGTGTGCCCA (3)
45.70.0457
P6.5 retinaCTGCGGCTTC (2)
CTGTGTGTAA (3)
GGGACTTGTG (2)
TACTGTAATT (4)
43.40.0434
P10.5 crx- retinaCTGCGGCTTC (2)
CTGTGTGTAA (3)
GGGACTTGTG (2)
TACTGTAATT (4)
TGTGTGCCCA (3)
24.20.0242
P10.5 crx+ retinaCTGCGGCTTC (2)
CTGTGTGTAA (3)
GGGACTTGTG (2)
TACTGTAATT (4)
TGTGTGCCCA (3)
480.048
Adult retinalCTGAGTTGCC (2)
CTGCGGCTTC (2)
CTGTGTGTAA (3)
TACTGTAATT (4)
TGTGTGCCCA (3)
TTCCAACCAG (2)
31.60.0316
ONLCTGCGGCTTC (2)
CTGTGTGTAA (3)
TACTGTAATT (4)
TGTGTGCCCA (3)
19.10.0191