Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.172897	Map3k12	mitogen activated protein kinase kinase kinase 12	15		26404
Mm.172897	C81508	expressed sequence C81508	15		97977
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 194 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAGACACTC (2) AGCCAAACAA (3) CAAAAAAAAA (2) CAGGCAAAAA (3) CAGGCCCAAA (2) CCTTTAATTC (3) GAAACACTAT (4) GAAATGTAAG (3) GTGCTGGGAT (2) TGGATGCTGG (3) 154.9 0.1549 Cb medulloblastoma ACCTTCTACT (2) AGCCAAACAA (3) ATTTTTTAAT (2) CAAAAAAAAA (2) CAGGCAAAAA (3) CAGGCCCAAA (2) CCTTTAATTC (3) CTGTTAGTCG (3) GAAACACTAT (4) GAAATGTAAG (3) TGGATGCTGG (3) 187.1 0.1871 P8 GC+1d culture ACCTTCTACT (2) AGCCAAACAA (3) ATTTTTTAAT (2) CAAAAAAAAA (2) CAGGCAAAAA (3) CAGGCCCAAA (2) CCACCTGTCT (2) GAAACACTAT (4) GAAATGTAAG (3) GGTGGTGAAC (3) TGATGGCTCA (2) TGGATGCTGG (3) 108.2 0.1082 P8 GC+SHH+1d culture AGCCAAACAA (3) CAAAAAAAAA (2) CAGGCAAAAA (3) CAGGCCCAAA (2) CCACCTGTCT (2) CCTTTAATTC (3) GAAACACTAT (4) GAAATGTAAG (3) GAGGGGGAGG (2) GTGCTGGGAT (2) TGGAAAATGT TGGATGCTGG (3) 159.2 0.1592 3T3 fibroblasts AGCCAAACAA (3) CAGGCCCAAA (2) CCTTTAATTC (3) GAAATGTAAG (3) TGGATGCTGG (3) 24.5 0.0245 E15 cortex CAAAAAAAAA (2) CAGGCCCAAA (2) GAAATGTAAG (3) TGGATGCTGG (3) 79.1 0.0791 P1 cortex CAAAAAAAAA (2) CAGGCAAAAA (3) CCTTTAATTC (3) GAAACACTAT (4) GAAATGTAAG (3) 81.7 0.0817 Hypothalamus AAAGACACTC (2) ACAAACAAAA (3) AGCCAAACAA (3) AGTGGATGAT (3) CAAAAAAAAA (2) CAGGCAAAAA (3) CAGGCCCAAA (2) GAAACACTAT (4) GAAATGTAAG (3) TGCACTAAAT (2) TGGATGCTGG (3) 108.6 0.1086 E12.5 retina AGCCAAACAA (3) AGTGGATGAT (3) CAAAAAAAAA (2) CAGGCCCAAA (2) CCACCTGTCT (2) CCTTTAATTC (3) GAAATGTAAG (3) GAGGGGGAGG (2) GTGCTGGGAT (2) TGGATGCTGG (3) 146.5 0.1465 E14.5 retina AGCCAAACAA (3) AGTGGATGAT (3) CAAAAAAAAA (2) CAGGCAAAAA (3) CAGGCCCAAA (2) CCACCTGTCT (2) CCTTTAATTC (3) CTGTTAGTCG (3) GAAACACTAT (4) GAAATGTAAG (3) GGTGGTGAAC (3) TGGATGCTGG (3) 160.2 0.1602 E16.5 retina AAAGACACTC (2) CAAAAAAAAA (2) CAGGCAAAAA (3) CAGGCCCAAA (2) CAGGCCCAAC CCTTTAATTC (3) CTGTTAGTCG (3) GAAACACTAT (4) GAAATGTAAG (3) GAGGGGGAGG (2) GGTGGTGAAC (3) TGATGGCTCA (2) TGGATGCTGG (3) 188.2 0.1882 E18.5 retina AAAGACACTC (2) ACAAACAAAA (3) AGCCAAACAA (3) AGTGGATGAT (3) CAAAAAAAAA (2) CAGGCAAAAA (3) CAGGCCCAAA (2) CCTTTAATTC (3) GAAATGTAAG (3) GTGCTGGGAT (2) TGGATGCTGG (3) 143.6 0.1436 P0.5 retina CAAAAAAAAA (2) CAGGCCCAAA (2) CCTTTAATTC (3) CTGTTAGTCG (3) GAAATGTAAG (3) GTGCTGGGAT (2) TGGAAAATGT TGGATGCTGG (3) 216.1 0.2161 P2.5 retina AGCCAAACAA (3) ATTTTTTAAT (2) CAAAAAAAAA (2) CAGGCAAAAA (3) CCTTTAATTC (3) GAAACACTAT (4) GAAATGTAAG (3) GAGGGGGAGG (2) GTGCTGGGAT (2) TGGATGCTGG (3) 176.2 0.1762 P4.5 retina AAAGACACTC (2) AGCCAAACAA (3) CAAAAAAAAA (2) CAGGCAAAAA (3) CAGGCCCAAA (2) CCTTTAATTC (3) GAAACACTAT (4) GAAATGTAAG (3) GGTGGTGAAC (3) TGGATGCTGG (3) 204.1 0.2041 P6.5 retina AAAGACACTC (2) ACAAACAAAA (3) AGCCAAACAA (3) AGTGGATGAT (3) ATTTTTTAAT (2) CAAAAAAAAA (2) CAGGCAAAAA (3) CAGGCCCAAA (2) CAGGCCCAAC CCTTTAATTC (3) GAAACACTAT (4) GAAATGTAAG (3) GAGGGGGAGG (2) TGCACTAAAT (2) TGGATGCTGG (3) 228.6 0.2286 P10.5 crx- retina AAAGACACTC (2) CAAAAAAAAA (2) CAGGCCCAAA (2) CCACCTGTCT (2) CCTTTAATTC (3) GAAACACTAT (4) GAAATGTAAG (3) TGATGGCTCA (2) TGCACTAAAT (2) TGGATGCTGG (3) 171.2 0.1712 P10.5 crx+ retina AGCCAAACAA (3) CAAAAAAAAA (2) CAGGCAAAAA (3) CAGGCCCAAA (2) CAGGCCCAAC CTGTTAGTCG (3) GAAACACTAT (4) GAAATGTAAG (3) TGGATGCTGG (3) 165.3 0.1653 Adult retinal ACAAACAAAA (3) AGCCAAACAA (3) CAAAAAAAAA (2) CAGGCAAAAA (3) CAGGCCCAAA (2) CCTTTAATTC (3) GAAATGTAAG (3) TGGATGCTGG (3) 107.6 0.1076 ONL ACCTTCTACT (2) AGCCAAACAA (3) CAAAAAAAAA (2) CAGGCAAAAA (3) CAGGCCCAAA (2) CCTTTAATTC (3) CTGTTAGTCG (3) GAAATGTAAG (3) 145.4 0.1454