Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.1843 Hspcaheat shock protein 1, alpha 12  12 F1 (12 48.0 cM)  15519 
 Mm.1843 4932703K07RikRIKEN cDNA 4932703K07 gene 12    71006 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 9 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 136 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCACACAGAT (4)21.20.0212
P8 Cb GCTATTAGTCTT (4)21.20.0212
P8 Cb GCGAGGCTTTGC (4)11.40.0114
P8 Cb GCGCTTAGAAGT (4)8.20.0082
P8 Cb GCCTAACAGGAT (4)3.30.0033
Cb medulloblastomaTATTAGTCTT (4)11.60.0116
Cb medulloblastomaCCACACAGAT (4)9.20.0092
Cb medulloblastomaCAGAATTAAC (4)6.90.0069
Cb medulloblastomaGAGGCTTTGC (4)4.60.0046
Cb medulloblastomaAAGGCTTTGG (4)2.30.0023
Cb medulloblastomaCGTGATGTGT (2)2.30.0023
Cb medulloblastomaGATAACTGTG (4)2.30.0023
Cb medulloblastomaGCTTAGAAGT (4)2.30.0023
Cb medulloblastomaTTTGCTCTGG (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTATTAGTCTT (4)37.70.0377
P8 GC+1d cultureCCACACAGAT (4)4.60.0046
P8 GC+1d cultureTTTGCTCTGG (3)4.60.0046
P8 GC+1d cultureAAAACTAAGG (2)1.10.0011
P8 GC+1d cultureCGTGATGTGT (2)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGCAGCAAAGA (3)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTATTAGTCTT (4)23.40.0234
P8 GC+SHH+1d cultureCCACACAGAT (4)11.70.0117
P8 GC+SHH+1d cultureGAGGCTTTGC (4)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureGCTTAGAAGT (4)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureCTTTCGGAGA (2)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGAAGAAGTAG (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTACTAGTCTT (2)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTTGCTCTGG (3)1.20.0012
3T3 fibroblastsGAGGCTTTGC (4)77.10.0771
3T3 fibroblastsAAGGCTTTGG (4)3.50.0035
3T3 fibroblastsGAGGCTTTGG (10)3.50.0035
3T3 fibroblastsGCTTAGAAGT (4)3.50.0035
E15 cortexGAGGCTTTGC (4)84.10.0841
E15 cortexGCTTAGAAGT (4)14.80.0148
E15 cortexGAAGAAGTAG (3)4.90.0049
E15 cortexGATAACTGTG (4)4.90.0049
P1 cortexGAGGCTTTGC (4)18.20.0182
P1 cortexGCTTAGAAGT (4)18.20.0182
P1 cortexTATTAGTCTT (4)13.60.0136
P1 cortexCCACACAGAT (4)9.10.0091
HypothalamusTATTAGTCTT (4)16.30.0163
HypothalamusGAGGCTTTGC (4)10.90.0109
HypothalamusCCACACAGAT (4)9.10.0091
HypothalamusCTTTCGGAGA (2)3.60.0036
HypothalamusAAGGCTTTGG (4)1.80.0018
HypothalamusCAGAATTAAC (4)1.80.0018
HypothalamusGAAGAAGTAG (3)1.80.0018
HypothalamusGAGGCTTTGG (10)1.80.0018
E12.5 retinaCCACACAGAT (4)20.70.0207
E12.5 retinaTATTAGTCTT (4)18.80.0188
E12.5 retinaGAGGCTTTGC (4)5.60.0056
E12.5 retinaAAAACTAAGG (2)3.80.0038
E12.5 retinaGAGGCTTTGG (10)3.80.0038
E12.5 retinaGAAGAAGTAG (3)1.90.0019
E12.5 retinaGCTTAGAAGT (4)1.90.0019
E12.5 retinaTTTGCTCTGG (3)1.90.0019
E14.5 retinaTATTAGTCTT (4)200.02
E14.5 retinaGCAGCAAAGA (3)5.50.0055
E14.5 retinaCGTGATGTGT (2)3.60.0036
E14.5 retinaGAGGCTTTGC (4)3.60.0036
E14.5 retinaTTTGCTCTGG (3)3.60.0036
E14.5 retinaAAAACTAAGG (2)1.80.0018
E14.5 retinaAAGGCTTTGG (4)1.80.0018
E14.5 retinaCAGAATTAAC (4)1.80.0018
E14.5 retinaCCACACAGAT (4)1.80.0018
E14.5 retinaGAAGAAGTAG (3)1.80.0018
E14.5 retinaGCTTAGAAGT (4)1.80.0018
E16.5 retinaTATTAGTCTT (4)14.50.0145
E16.5 retinaCCACACAGAT (4)5.40.0054
E16.5 retinaGAGGCTTTGC (4)3.60.0036
E16.5 retinaGCAGCAAAGA (3)3.60.0036
E16.5 retinaAAAACTAAGG (2)1.80.0018
E16.5 retinaGAAGAAGTAG (3)1.80.0018
E16.5 retinaGATAACTGTG (4)1.80.0018
E16.5 retinaTTTGCTCTGG (3)1.80.0018
E18.5 retinaCCACACAGAT (4)200.02
E18.5 retinaTATTAGTCTT (4)10.90.0109
E18.5 retinaCAGAATTAAC (4)3.60.0036
E18.5 retinaTACTAGTCTT (2)3.60.0036
E18.5 retinaAAAACTAAGG (2)1.80.0018
E18.5 retinaAAGGCTTTGG (4)1.80.0018
E18.5 retinaGAGGCTTTGC (4)1.80.0018
E18.5 retinaGCTTAGAAGT (4)1.80.0018
P0.5 retinaCCACACAGAT (4)5.90.0059
P0.5 retinaTATTAGTCTT (4)5.90.0059
P0.5 retinaGAGGCTTTGC (4)3.90.0039
P0.5 retinaTGAAGGAACG (2)3.90.0039
P0.5 retinaAAAACTAAGG (2)20.002
P0.5 retinaGAAGAAGTAG (3)20.002
P2.5 retinaTATTAGTCTT (4)15.80.0158
P2.5 retinaGCTTAGAAGT (4)10.60.0106
P2.5 retinaCCACACAGAT (4)3.50.0035
P2.5 retinaAAGGCTTTGG (4)1.80.0018
P4.5 retinaTATTAGTCTT (4)9.90.0099
P4.5 retinaGCTTAGAAGT (4)5.90.0059
P4.5 retinaCCACACAGAT (4)40.004
P4.5 retinaGAAAATATAT (2)20.002
P4.5 retinaGAAGAAGTAG (3)20.002
P4.5 retinaGAGGCTTTGC (4)20.002
P4.5 retinaTTTGCTCTGG (3)20.002
P6.5 retinaCCACACAGAT (4)16.70.0167
P6.5 retinaTATTAGTCTT (4)100.01
P6.5 retinaAAGGCTTTGG (4)3.30.0033
P6.5 retinaTGAAGGAACG (2)3.30.0033
P6.5 retinaCGTGATGTGT (2)1.70.0017
P6.5 retinaGCAGCAAAGA (3)1.70.0017
P6.5 retinaGCTTAGAAGT (4)1.70.0017
P6.5 retinaTTTGCTCTGG (3)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTATTAGTCTT (4)61.30.0613
P10.5 crx- retinaGAGGCTTTGC (4)9.30.0093
P10.5 crx- retinaCCACACAGAT (4)7.40.0074
P10.5 crx- retinaAAAACTAAGG (2)1.90.0019
P10.5 crx- retinaAAGGCTTTGG (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaCGTGATGTGT (2)1.90.0019
P10.5 crx- retinaCTAACAGGAT (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGATAACTGTG (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGCAGCAAAGA (3)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGCTTAGAAGT (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTTTGCTCTGG (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCCACACAGAT (4)26.90.0269
P10.5 crx+ retinaTATTAGTCTT (4)250.025
P10.5 crx+ retinaCAGAATTAAC (4)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaCGTGATGTGT (2)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCTTTCGGAGA (2)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGAAGAAGTAG (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGAGGCTTTGG (10)1.90.0019
Adult retinalTATTAGTCTT (4)25.90.0259
Adult retinalCCACACAGAT (4)5.60.0056
Adult retinalGAGGCTTTGC (4)5.60.0056
Adult retinalTTTGCTCTGG (3)3.70.0037
Adult retinalCAGAATTAAC (4)1.90.0019
Adult retinalCGTGATGTGT (2)1.90.0019
Adult retinalGAAAATATAT (2)1.90.0019
Adult retinalGAAGAAGTAG (3)1.90.0019
ONLTATTAGTCTT (4)460.046
ONLCCACACAGAT (4)30.60.0306