Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.193925 Gna13guanine nucleotide binding protein, alpha 13 11  11 68.0 cM  14674 
 Mm.193925 C85143expressed sequence C85143 11    97743 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 143 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGTCAAGGGA (2)
GCAAAAAAAA (2)
GCATTGTTTT (4)
GCTGCCCCAG
GCTGCCTCCC (2)
GTTAATGCTA (3)
GTTCTACATC (2)
GTTTATGCTA (2)
TGCCACAGCT (2)
TTGGGTTTTT (4)
42.30.0423
Cb medulloblastomaAGTCAAGGGA (2)
GCAAAAAAAA (2)
TATGTCAGTA
TTGGGTTTTT (4)
73.90.0739
P8 GC+1d cultureAGTCAAGGGA (2)
GCAAAAAAAA (2)
GCTGCCCCAG
GTTAATGCTA (3)
GTTCTACATC (2)
GTTTATGCTA (2)
TTGGGTTTTT (4)
23.90.0239
P8 GC+SHH+1d cultureACGTTCAAAC (2)
GCAAAAAAAA (2)
GTTAATGCTA (3)
GTTTATGCTA (2)
TAATAAACAT (3)
TTGGGTTTTT (4)
42.20.0422
3T3 fibroblastsAGTCAAGGGA (2)
GCAAAAAAAA (2)
GTCATAGCTG (2)
TGCCACAGCT (2)
TTGGGTTTTT (4)
280.028
E15 cortexGCAAAAAAAA (2)
GCTGCCCAGG (3)
GCTGCCCCAG
GTCATAGCTG (2)
TTGGGTTTTT (4)
34.50.0345
P1 cortexAGTCAAGGGA (2)
GCAAAAAAAA (2)
GCATTGTTTT (4)
GCTGCCCCAG
TGCCACAGCT (2)
TTGGGTTTTT (4)
270.027
HypothalamusACGTTCAAAC (2)
AGTCAAGGGA (2)
GCAAAAAAAA (2)
GCATTGTTTT (4)
GTTCTACATC (2)
GTTTATGCTA (2)
TATGTCAGTA
43.40.0434
E12.5 retinaGCAAAAAAAA (2)
GTTAATGCTA (3)
GTTCTACATC (2)
GTTTATGCTA (2)
TTGGGTTTTT (4)
20.80.0208
E14.5 retinaGCAAAAAAAA (2)
GCATTGTTTT (4)
GTTAATGCTA (3)
GTTCTACATC (2)
TATGTCAGTA
TTGGGTTTTT (4)
32.80.0328
E16.5 retinaACGTTCAAAC (2)
AGTCAAGGGA (2)
GCAAAAAAAA (2)
GCATTGTTTT (4)
GCTGCCCAGG (3)
GCTGCCCCAG
GTTAATGCTA (3)
GTTTATGCTA (2)
GTTTCTGGCT
TATGTCAGTA
TTGGGTTTTT (4)
470.047
E18.5 retinaGCAAAAAAAA (2)
TATGTCAGTA
TATGTTTGTT
TGCCACAGCT (2)
TTGGGTTTTT (4)
47.30.0473
P0.5 retinaGCAAAAAAAA (2)
GCTGCCCCAG
GCTGCCTCCC (2)
GTCATAGCTG (2)
GTTAATGCTA (3)
GTTTATGCTA (2)
TATGTCAGTA
TGCCACAGCT (2)
45.20.0452
P2.5 retinaGCAAAAAAAA (2)
GTCATAGCTG (2)
GTTAATGCTA (3)
GTTTCTGGCT
TATGTCAGTA
TGCCACAGCT (2)
TTGGGTTTTT (4)
59.90.0599
P4.5 retinaGCAAAAAAAA (2)
GCATTGTTTT (4)
GCTGCCTCCC (2)
GTCATAGCTG (2)
GTTAATGCTA (3)
GTTCTACATC (2)
TATGTCAGTA
TATGTTTGTT
TTGGGTTTTT (4)
59.60.0596
P6.5 retinaACGTTCAAAC (2)
GCAAAAAAAA (2)
GTCATAGCTG (2)
GTTAATGCTA (3)
GTTCTACATC (2)
TATGTCAGTA
TATGTTTGTT
TTGGGTTTTT (4)
38.50.0385
P10.5 crx- retinaGCAAAAAAAA (2)
GCTGCCCAGG (3)
GTTAATGCTA (3)
GTTTATGCTA (2)
TATGTCAGTA
TTGGGTTTTT (4)
31.70.0317
P10.5 crx+ retinaACGTTCAAAC (2)
AGTCAAGGGA (2)
GCAAAAAAAA (2)
GTTAATGCTA (3)
GTTCTACATC (2)
GTTTATGCTA (2)
GTTTCTGGCT
TATGTCAGTA
TGCCACAGCT (2)
TTGGGTTTTT (4)
28.60.0286
Adult retinalGCAAAAAAAA (2)
GCTGCCCAGG (3)
GCTGCCTCCC (2)
GTCATAGCTG (2)
TAATAAACAT (3)
TATGTCAGTA
TGCCACAGCT (2)
TTGGGTTTTT (4)
29.90.0299
ONLACGTTCAAAC (2)
AGTCAAGGGA (2)
GCAAAAAAAA (2)
GTCATAGCTG (2)
GTTAATGCTA (3)
GTTTATGCTA (2)
TAATAAACAT (3)
TATGTCAGTA
TATGTTTGTT
TTGGGTTTTT (4)
26.60.0266