Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.196607	Eif5a	eukaryotic translation initiation factor 5A	19	19 15.0 cM	276770
Gene Ontology	apoptosis | cytoplasm | nucleus
Human Homolog	EIF5A[eukaryotic translation initiation factor 5A]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 60 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGCCTACAGA GCCTTGGTGA (2) 6.6 0.0066 Cb medulloblastoma AGCCTACAGA CCAAGGCTCC GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) 27.7 0.0277 P8 GC+1d culture GCCGGCCTTT GCCTTGGTGA (2) GGCCTTGGGG (2) 19.3 0.0193 P8 GC+SHH+1d culture AGCCTACAGA GCCGGCCTTT GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) GGCCTTGGGG (2) 27 0.027 3T3 fibroblasts GCCGGCCTTT GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) GGCCTTGGGG (2) 108.6 0.1086 E15 cortex AGCCTACAGA GCCTTGGTGA (2) GGCCTTGGGG (2) 39.5 0.0395 P1 cortex GCCGGCCTTT GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) 22.7 0.0227 Hypothalamus AGCCTACAGA CCAAGGCTCC GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) 21.7 0.0217 E12.5 retina AGCCTACAGA GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) 43.2 0.0432 E14.5 retina GCCGGCCTTT GGCCTTGGGG (2) 7.3 0.0073 E16.5 retina AGCCTACAGA GCCTTGGTGA (2) GGCCTTGGGG (2) 19.9 0.0199 E18.5 retina GCCGGCCTTT GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) 9.1 0.0091 P0.5 retina AGCCTACAGA GCCGGCCTTT GCCTTGGTGA (2) GGCCTTGGGG (2) 23.5 0.0235 P2.5 retina GCCTTGGTGA (2) GGCCTTGGGG (2) 10.5 0.0105 P4.5 retina AGCCTACAGA GCCTTGGTGA (2) GGCCTTGGGG (2) 11.9 0.0119 P6.5 retina GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) GGCCTTGGGG (2) 10 0.01 P10.5 crx- retina GCCTTGGTGA (2) 16.7 0.0167 P10.5 crx+ retina AGCCTACAGA GCCTTGGTGA (2) 7.6 0.0076 Adult retinal AGCCTACAGA CCAAGGCTCC GCCTTGGTGA (2) GCTCCCTCAT (2) 20.5 0.0205 ONL AGCCTACAGA GCCTTGGTGA (2) 5.7 0.0057