Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.200770 Gsk3bglycogen synthase kinase 3 beta 16    56637 
 Mm.200770 BC031361cDNA sequence BC031361     414072 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 140 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGTAGTTGG (2)
AGGAAAAAAA (2)
GAGCATACTT
GCAGGATCCC (2)
GGTTTGTTCA (2)
TAGCGCGCCC (3)
TGTCTTGAAT (2)
TTTTTTTTTT (2)
34.30.0343
Cb medulloblastomaAGGAAAAAAA (2)
GGTTTGTTCA (2)
TGACTGCTGC (3)
TTTTTTTTTT (2)
25.30.0253
P8 GC+1d cultureAGGAAAAAAA (2)
CTCGGATTCA (2)
GAGCATACTT
GGTTTGTTCA (2)
TAGCGCGCCC (3)
TGACTGCTGC (3)
TGGCGATGGC (2)
TGTCTTGAAT (2)
TTTTTTTTTT (2)
42.20.0422
P8 GC+SHH+1d cultureAAGTAGTTGG (2)
AGGAAAAAAA (2)
CTCGGATTCA (2)
GAGCATACTT
GCAGGATCCC (2)
GGTTTGTTCA (2)
TGACTGCTGC (3)
TGGAGGGATA (2)
TGTCTTGAAT (2)
TTTTTTTTTT (2)
43.30.0433
3T3 fibroblastsCTCGGATTCA (2)
GGTTTGTTCA (2)
TAGCGCGCCC (3)
TGGCGATGGC (2)
17.50.0175
E15 cortexAGGAAAAAAA (2)
CTCGGATTCA (2)
GGTTTGTTCA (2)
TGACTGCTGC (3)
TGTCTTGAAT (2)
TTTTTTTTTT (2)
49.30.0493
P1 cortexCTCGGATTCA (2)
GAAGCGAAGG (2)
GAGCATACTT
GGTTTGTTCA (2)
TGACTGCTGC (3)
TTTTTTTTTT (2)
45.30.0453
HypothalamusACTCATTATA (2)
AGGAAAAAAA (2)
GGTTTGTTCA (2)
TGACTGCTGC (3)
TGGCGATGGC (2)
TGTCTTGAAT (2)
TTTTTTTTTT (2)
25.20.0252
E12.5 retinaAAGTAGTTGG (2)
AGGAAAAAAA (2)
GATAAAGGAA (2)
GGTTTGTTCA (2)
TGACTGCTGC (3)
TGTCTTGAAT (2)
TTTTTTTTTT (2)
30.10.0301
E14.5 retinaAGGAAAAAAA (2)
CTCGGATTCA (2)
GGTTTGTTCA (2)
TGTCTTGAAT (2)
TTTTTTTTTT (2)
400.04
E16.5 retinaAGGAAAAAAA (2)
CTCGGATTCA (2)
GAGCATACTT
GATAAAGGAA (2)
GGTTTGTTCA (2)
TGTCTTGAAT (2)
TTTTTTTTTT (2)
32.50.0325
E18.5 retinaAGGAAAAAAA (2)
GGTTTGTTCA (2)
TGACTGCTGC (3)
TTTTTTTTTT (2)
41.90.0419
P0.5 retinaAAGTAGTTGG (2)
CTCGGATTCA (2)
GAAGCGAAGG (2)
GAGCATACTT
GATAAAGGAA (2)
GGTTTGTTCA (2)
TGACTGCTGC (3)
TGGAGGGATA (2)
TGTCTTGAAT (2)
TTTTTTTTTT (2)
35.50.0355
P2.5 retinaAGGAAAAAAA (2)
CTCGGATTCA (2)
GATAAAGGAA (2)
GGTTTGTTCA (2)
TGACTGCTGC (3)
TGTCTTGAAT (2)
TTTTTTTTTT (2)
58.10.0581
P4.5 retinaAGGAAAAAAA (2)
GATAAAGGAA (2)
GGTTTGTTCA (2)
TGACTGCTGC (3)
TGTCTTGAAT (2)
TTTTTTTTTT (2)
39.70.0397
P6.5 retinaACTCATTATA (2)
AGGAAAAAAA (2)
GAAGCGAAGG (2)
GAGCATACTT
GATAAAGGAA (2)
GCAGGATCCC (2)
GGTTTGTTCA (2)
TGACTGCTGC (3)
TGTCTTGAAT (2)
TTTTTTTTTT (2)
48.30.0483
P10.5 crx- retinaAGGAAAAAAA (2)
GAGCATACTT
GGTTTGTTCA (2)
TGACTGCTGC (3)
TGGAGGGATA (2)
150.015
P10.5 crx+ retinaAGGAAAAAAA (2)
GAGCATACTT
GGTTTGTTCA (2)
TGACTGCTGC (3)
TGGCGATGGC (2)
TTTTTTTTTT (2)
46.10.0461
Adult retinalAAGTAGTTGG (2)
AGGAAAAAAA (2)
GAAGCGAAGG (2)
GAGCATACTT
GATAAAGGAA (2)
GGTTTGTTCA (2)
TGACTGCTGC (3)
TGGAGGGATA (2)
TGGCGATGGC (2)
TGTCTTGAAT (2)
TTTTTTTTTT (2)
39.20.0392
ONLAAGTAGTTGG (2)
AGGAAAAAAA (2)
GAGCATACTT
GCAGGATCCC (2)
GGTTTGTTCA (2)
TGACTGCTGC (3)
TGGCGATGGC (2)
TTTTTTTTTT (2)
38.10.0381