Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.203962 Bat3HLA-B-associated transcript 3 17  17 19.03 cM  224727 
 Gene Ontology apoptosis | cytoplasm | hydrogen transport | hydrogen-exporting ATPase activity, phosphorylative mechanism | membrane | protein binding | protein binding | regulation of apoptosis
 Human Homolog BAT3[HLA-B associated transcript 3]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 189 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAGAGGTCCA
CCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GAATTCAAAA (2)
GAGCCGAGTG
GCTTCTTCTG (4)
GTTGGAACCT (3)
TGCTGCACTG
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
60.50.0605
Cb medulloblastomaCAGAGGTCCA
CCTGCCAAGA (2)
GAATTCAAAA (2)
GCCATTTCCA
GCTTCTTCTG (4)
TGCTGCACTG
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
73.90.0739
P8 GC+1d cultureCACTCTCAGA (4)
CAGAGGTCCA
CATTGTCTTT (2)
CCAATGAGGT (2)
CCACTGAGGT
CCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GAATTCAAAA (2)
GCTTCTCCCA (4)
GCTTCTTCTG (4)
GTTGGAACCT (3)
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
88.90.0889
P8 GC+SHH+1d cultureCACTCTCAGA (4)
CAGAGGTCCA
CATTGTCTTT (2)
CCACTGAGGT
CCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GCTTCTCCCA (4)
GCTTCTTCTG (4)
GTTGGAACCT (3)
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
67.90.0679
3T3 fibroblastsCCTGCCAAGA (2)
GAGCCGAGTG
GCTTCTTCTG (4)
GTTGGAACCT (3)
420.042
E15 cortexCCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GAATTCAAAA (2)
GAGCTGAGTG (2)
GCTTCTTCTG (4)
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
690.069
P1 cortexCCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GCTTCTTCTG (4)
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
81.80.0818
HypothalamusCACTCTCAGA (4)
CCACTGAGGT
CCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GCAGCCCGGG
GCCATTTCCA
GCCTTCTTCT (2)
GCTTCTTCTG (4)
GGAGTCAGAA
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
54.10.0541
E12.5 retinaCCTGCCAAAA (2)
CCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GCTTCTTCTG (4)
GTTCTGCATC
GTTGGAACCT (3)
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
37.70.0377
E14.5 retinaCCACTGAGGT
CCTGCCAAAA (2)
CCTGCCAAGA (2)
GCAGCCCGGG
GCCATTTCCA
GCCTTCTTCT (2)
GCTTCTCCCA (4)
GCTTCTTCTG (4)
GGAGTCAGAA
GTTGGAACCT (3)
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
56.30.0563
E16.5 retinaCACTCTCAGA (4)
CAGAGGTCCA
CCTGCCAAAA (2)
CCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GCCTTCTTCT (2)
GCTTCTCCCA (4)
GCTTCTTCTG (4)
GTTCTGCATC
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
54.20.0542
E18.5 retinaCCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GAGCCGAGTG
GCTTCTTCTG (4)
GTTGGAACCT (3)
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
36.30.0363
P0.5 retinaCACTCTCAGA (4)
CCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GCTTCTTCTG (4)
GTTGGAACCT (3)
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
49.10.0491
P2.5 retinaCACTCTCAGA (4)
CAGAGGTCCA
CATTGTCTTT (2)
CCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GCTTCTTCTG (4)
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
52.80.0528
P4.5 retinaCACTCTCAGA (4)
CAGAGGTCCA
CCAATGAGGT (2)
CCACTGAGGT
CCTGCCAAAA (2)
CCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GCTTCTTCTG (4)
GGAGTCAGAA
GTTGGAACCT (3)
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
71.50.0715
P6.5 retinaCACTCTCAGA (4)
CAGAGGTCCA
CATTGTCTTT (2)
CCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GAATTCAAAA (2)
GCCATTTCCA
GCTTCTTCTG (4)
GTTGGAACCT (3)
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
91.70.0917
P10.5 crx- retinaCACTCTCAGA (4)
CAGAGGTCCA
CCAATGAGGT (2)
CCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GAATTCAAAA (2)
GACAGACCTG
GAGCTGAGTG (2)
GCTTCTTCTG (4)
GGAGTCAGAA
TAAGGTTTGG
TGTGTTGTTT (2)
59.70.0597
P10.5 crx+ retinaCACTCTCAGA (4)
CAGAGGTCCA
CCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GACAGACCTG
GAGCTGAGTG (2)
GCAGCCCGGG
GCTTCTTCTG (4)
GTTGGAACCT (3)
TAAGGTTTGG
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
55.50.0555
Adult retinalCACTCTCAGA (4)
CCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GACAGACCTG
GCTTCTTCTG (4)
GGAGTCAGAA
GTTGGAACCT (3)
TGCTGCACTG
TTTTTTTTTT (2)
70.60.0706
ONLCACTCTCAGA (4)
CCTGCCAAGA (2)
CCTGTGGGTC (2)
GACAGACCTG
GCCATTTCCA
GCTTCTTCTG (4)
GGAGTCAGAA
GTTCTGCATC
GTTGGAACCT (3)
TGTGTTGTTT (2)
TTTTTTTTTT (2)
47.80.0478