Mouse Retina SAGE Library

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Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

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UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.207678	Ube2r2	ubiquitin-conjugating enzyme E2R 2	4		67615
Mm.207678	2310029O18Rik	RIKEN cDNA 2310029O18 gene	4		76946
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

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SAGE Tags

Total 101 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC GAGGCTGCAG (2) GTTCCCTTTC (2) TTAATATTTA TTTATGTTTT (3) TTTCCTTCCA 39.1 0.0391 Cb medulloblastoma GAGGCTGCAG (2) TTAATATTTA 34.7 0.0347 P8 GC+1d culture GAGGCTGCAG (2) TTAATATTTA TTCCTTCAGT (3) TTGGGATGGT (2) TTTATGTTTT (3) 65 0.065 P8 GC+SHH+1d culture GAGGCTGCAG (2) GTTCCCTTTC (2) TTAATATTTA TTATGAAGTG (2) TTCCTTCAGT (3) TTGGGATGGT (2) TTTATGTTTT (3) 44.5 0.0445 3T3 fibroblasts AGGGCATAAA GAGGCTGCAG (2) GGGCTGGAGA (2) TTCCTTCAGT (3) TTGGGATGGT (2) 38.5 0.0385 E15 cortex GAGGCTGCAG (2) 19.8 0.0198 P1 cortex AGAATGGAGA (3) GAGGCTGCAG (2) TTAATATTTA TTCCTTCAGT (3) TTGGGATGGT (2) 40.8 0.0408 Hypothalamus AGAATGGAGA (3) GAGGCTGCAG (2) GGAATTGGAG TTAATATTTA TTCCTTCAGT (3) TTGGGATGGT (2) 68.7 0.0687 E12.5 retina AGGGCATAAA GAGGCTGCAG (2) GTTCCCTTTC (2) TTAATATTTA TTCCTTCAGT (3) TTGGGATGGT (2) 110.8 0.1108 E14.5 retina AGGGCATAAA GAGGCTGCAG (2) GGGCTGGAGA (2) TTAATATTTA TTCCTTCAGT (3) TTGGGATGGT (2) TTTATGTTTT (3) 78.3 0.0783 E16.5 retina AGGGCATAAA GAGGCTGCAG (2) TTAATATTTA TTCCTTCAGT (3) TTGGGATGGT (2) 56.2 0.0562 E18.5 retina GAGGCTGCAG (2) GTTCCCTTTC (2) TTAATATTTA TTGGGATGGT (2) 61.8 0.0618 P0.5 retina GAGGCTGCAG (2) GGAATTGGAG GGGCTGGAGA (2) TTAATATTTA TTATGAAGTG (2) TTCCTTCAGT (3) TTGGGATGGT (2) TTTATGTTTT (3) 31.6 0.0316 P2.5 retina GAGGCTGCAG (2) TTAATATTTA TTCCTTCAGT (3) TTGGGATGGT (2) 35.3 0.0353 P4.5 retina AGAATGGAGA (3) GAGGCTGCAG (2) GGGCTGGAGA (2) TTAATATTTA TTATGAAGTG (2) TTCCTTCAGT (3) TTGGGATGGT (2) TTTCCTTCCA 57.6 0.0576 P6.5 retina AGGGCATAAA GAGGCTGCAG (2) GTTCCCTTTC (2) TTAATATTTA TTCCTTCAGT (3) TTGGGATGGT (2) 45 0.045 P10.5 crx- retina GAGGCTGCAG (2) GGAATTGGAG TTAATATTTA TTGGGATGGT (2) 29.8 0.0298 P10.5 crx+ retina GAGGCTGCAG (2) TTAATATTTA TTGGGATGGT (2) TTTCCTTCCA 26.9 0.0269 Adult retinal GAGGCTGCAG (2) GGGCTGGAGA (2) TTAATATTTA TTCCTTCAGT (3) 22.3 0.0223 ONL GAGGCTGCAG (2) GGGCTGGAGA (2) GTTCCCTTTC (2) TTAATATTTA TTGGGATGGT (2) 24.8 0.0248