Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.209265 C78997expressed sequence C78997 1    96887 
 Mm.209265 C130021H21RikRIKEN cDNA C130021H21 gene     320693 
 Mm.209265 6720416K24RikRIKEN cDNA 6720416K24 gene 1    320464 
 Mm.209265 Trip12thyroid hormone receptor interactor 12 9    14897 
 Mm.209265 1110036I07RikRIKEN cDNA 1110036I07 gene 1    73751 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 150 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAATGTCAGCT
ACCAAACTGA (6)
ATTTCTTTTC (6)
CCTTTAATCT (2)
GTGCTAGGAA
TATTTTTTTC (3)
TGTATTTGAA
TTCCTCCCTC (5)
TTTGTGTAAA
TTTTCTTTTT (6)
30.90.0309
Cb medulloblastomaATTTCTTTTC (6)
ATTTTTTTCT
GGGAACGCAA (5)
GTATTTCCCT (5)
TATTTTTTTC (3)
TTTGTGTAAA
34.60.0346
P8 GC+1d cultureACCAAACTGA (6)
ACCACCTCTG (5)
ATTTCTTTTC (6)
ATTTTATTGA (3)
CCTTTAATCT (2)
TATTTTTTTC (3)
TGTATTTGAC (6)
TTCCTCCCTC (5)
TTTTCTTTTT (6)
260.026
P8 GC+SHH+1d cultureAATGGCTGTT
AATGTCAGCT
ACCAAACTGA (6)
ACCACCTCTG (5)
ACTAGTGCTT (4)
ATTTTATTGA (3)
CCTTTAATCT (2)
GGGAACGCAA (5)
TGTATTTGAC (6)
TTTCTCCCTC (5)
TTTGTGTAAA
TTTTCTTTTT (6)
21.30.0213
3T3 fibroblastsCCTTTAATCT (2)
GTATTTCCCT (5)
GTCATAGCTG (2)
TTTTCTTTTT (6)
31.50.0315
E15 cortexACCAAACTGA (6)
GGGAACGCAA (5)
GTCATAGCTG (2)
14.70.0147
P1 cortexCCTTTAATCT (2)
CTGTTTCAAG (6)
TTCCTCCCTC (5)
13.50.0135
HypothalamusATTTCTTTTC (6)
CCTTTAATCT (2)
GGGAACGCAA (5)
TTCCTCCCTC (5)
TTTTCTTTTT (6)
14.40.0144
E12.5 retinaAATGGCTGTT
ACCAAACTGA (6)
ACTAGTGCTT (4)
ATTTTATTGA (3)
CCTTTAATCT (2)
GAAACCTTAC
GTATTTCCCT (5)
TTTTCTTTTT (6)
17.10.0171
E14.5 retinaAATGTCAGCT
ACCAAACTGA (6)
ACCACCTCTG (5)
ATTTTTTTCT
CCTTTAATCT (2)
GTATTTCCCT (5)
TATTTTTTTC (3)
TTCCTCCCTC (5)
TTTCTCCCTC (5)
TTTTCTTTTT (6)
30.80.0308
E16.5 retinaAATGGCTGTT
ACCAAACTGA (6)
GAAACCTTAC
TTCCTCCCTC (5)
TTTCTCCCTC (5)
TTTTCTTTTT (6)
19.80.0198
E18.5 retinaGGGAACGCAA (5)
GTATTTCCCT (5)
TTCCCCCCCC (5)
TTTTCTTTTT (6)
12.70.0127
P0.5 retinaAATGGCTGTT
ACCAAACTGA (6)
ACCACCTCTG (5)
CCTTTAATCT (2)
CTGTTTCAAG (6)
GTCATAGCTG (2)
TTCCTCCCTC (5)
23.70.0237
P2.5 retinaCACTTTGCTG
CCTTTAATCT (2)
GCTCACTGAG (6)
GGGAACGCAA (5)
GTCATAGCTG (2)
GTGCTAGGAA
TATTTTTTTC (3)
TGTATTTGAA
TTCCTCCCTC (5)
TTTGTGTAAA
TTTTCTTTTT (6)
390.039
P4.5 retinaACTAGTGCTT (4)
ATTTTATTGA (3)
ATTTTTTTCT
CACTTTGCTG
CCTTTAATCT (2)
GGGAACGCAA (5)
GTCATAGCTG (2)
TTCCTCCCTC (5)
TTTCTCCCTC (5)
57.60.0576
P6.5 retinaAATGGCTGTT
ACCAAACTGA (6)
ATTTTATTGA (3)
CACTTTGCTG
CCTTTAATCT (2)
GCTCACTGAG (6)
GTATTTCCCT (5)
GTCATAGCTG (2)
TTCCCCCCCC (5)
TTCCTCCCTC (5)
TTTTCTTTTT (6)
100.20.1002
P10.5 crx- retinaAATGGCTGTT
CACTTTGCTG
GCTCACTGAG (6)
GTATTTCCCT (5)
TTTCTCCCTC (5)
35.50.0355
P10.5 crx+ retinaCACTTTGCTG
GAAACCTTAC
GCTCACTGAG (6)
GGGAACGCAA (5)
TGTATTTGAC (6)
TTTTCTTTTT (6)
69.10.0691
Adult retinalATTTCTTTTC (6)
CACTTTGCTG
CCTTTAATCT (2)
GTCATAGCTG (2)
GTGCTAGGAA
TGTATTTGAA
TTCCTCCCTC (5)
TTTCTCCCTC (5)
37.30.0373
ONLAATGGCTGTT
AATGTCAGCT
ACCAAACTGA (6)
ATTTCTTTTC (6)
ATTTTTTTCT
CACTTTGCTG
CCTTTAATCT (2)
GCTCACTGAG (6)
GTATTTCCCT (5)
GTCATAGCTG (2)
TGTATTTGAC (6)
TTTCTCCCTC (5)
TTTTCTTTTT (6)
630.063