Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.2136	Cox4i1	cytochrome c oxidase subunit IV isoform 1	8	8 64.0 cM	12857
Gene Ontology	cytochrome-c oxidase activity | electron transport | inner membrane | integral to membrane | mitochondrial inner membrane | mitochondrion | oxidoreductase activity | respiratory chain complex IV (sensu Eukarya)
Human Homolog	COX4I1[cytochrome c oxidase subunit IV isoform 1]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 237 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ATGGACTTTA CCAATAAAAG CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTATTAAAAG (2) CTGGAAAGCT (2) CTGGGAAGCT (2) GGAATGTTGT GGAGTGTTGT (2) GGTCCACTGG GTAATAAAAG GTCGGCCGCC (2) TCACGATGCT (2) TCCCCCCCCC (2) TTAATAAAAG (2) 177.9 0.1779 Cb medulloblastoma CCGAGGGAGT CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTATTAAAAG (2) CTGGGAAGCT (2) CTTAATAAAA (6) GACACTGGCA (2) GCTTTCTTCC (2) GTAATAAAAG TTAATAAAAG (2) 166.4 0.1664 P8 GC+1d culture AAGGCCAACC (2) AGAAAGTTCA (3) ATGGACTTTA CCGAGGGAGT CTAATAAAAA CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTAATAAAGA CTAATAGAAG (2) CTTAATAAAA (6) GTAATAAAAG GTCGGCCGCC (2) TCCCCCCCCC (2) TTAATAAAAG (2) 155 0.155 P8 GC+SHH+1d culture AAATTTAAAG AACGCCAACC (3) AAGGCCTACC (2) ATGGACTTTA CCAATAAAAG CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTATAAAAAA (3) CTGGGAAGCT (2) CTTAATAAAA (6) GCTTTCTTCC (2) GTAATAAAAG GTCGGCCGCC (2) TTAATAAAAG (2) 179.3 0.1793 3T3 fibroblasts AACGCCAACC (3) CTAATAAAAG (3) CTGGGAAGCT (2) GGTCCACTGG GTCGGCCGCC (2) GTGCTGCAGG (2) TTAATAAAAG (2) 31.5 0.0315 E15 cortex AACGCCAACC (3) CTGGAAAGCT (2) CTGGAAGCTG 14.7 0.0147 P1 cortex AAATTTAAAG CCAATAAAAG CTAATAAAAA CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTAATAAAGA CTTAATAAAA (6) TTAATAAAAG (2) 113.4 0.1134 Hypothalamus AAGGCCAACC (2) AGAAAGTTCA (3) CCAATAAAAG CCGAGGGAGT CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTATTAAAAG (2) CTGGAAGCTG CTGGGAAGCT (2) CTTAATAAAA (6) GCTTTCTTCC (2) GGCCACATCA (2) GGTCCACTGG GTAATAAAAG GTCGGCCGCC (2) GTGCTGCAGG (2) TCACGATGCT (2) TTAATAAAAG (2) 291.4 0.2914 E12.5 retina AAGGCCTACC (2) AATGGCTGGC (2) CCAATAAAAG CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTGGAAAGCT (2) CTGGGAAGCT (2) CTTAATAAAA (6) GGGGATCAGT GGTCCACTGG GTAATAAAAG GTCGGCCGCC (2) TTAATAAAAG (2) 114.6 0.1146 E14.5 retina AACGCCAACC (3) AAGGCCTACC (2) CCGAGGGAGT CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTATAAAAAA (3) CTTAATAAAA (6) GGAATGTTGT GGCCACATCA (2) GTAATAAAAG GTCGGCCGCC (2) GTGCTGCAGG (2) TTAATAAAAG (2) 182.1 0.1821 E16.5 retina AACGCCAACC (3) AAGGCCTACC (2) CCGAGGGAGT CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTGGAAAGCT (2) CTTAATAAAA (6) GGCCACATCA (2) GGTCCACTGG GTAATAAAAG GTGCTGCAGG (2) TTAATAAAAG (2) TTCTTTATTG (3) 182.9 0.1829 E18.5 retina CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTAATAAAGA CTTAATAAAA (6) GCTTTCTTCC (2) GGAATGTTGT GGCCACATCA (2) GTAATAAAAG GTGCTGCAGG (2) TCCCCCCCCC (2) TTAATAAAAG (2) 245.4 0.2454 P0.5 retina AATGGCTGGC (2) CCGAGGGAGT CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTGGGAAGCT (2) CTTAATAAAA (6) GTAATAAAAG GTCGGCCGCC (2) GTGCTGCAGG (2) TTAATAAAAG (2) 80.7 0.0807 P2.5 retina AACGCCAACC (3) ATGGACTTTA CCAATAAAAG CTAATAAAAA CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTAATAGAAG (2) CTGGAAGCTG CTGGGAAGCT (2) CTTAATAAAA (6) GGACCTCCTT GGCCACATCA (2) GTAATAAAAG GTCGGCCGCC (2) TTAATAAAAG (2) TTCTTTATTG (3) 192.1 0.1921 P4.5 retina AAGGCCAACC (2) CCAATAAAAG CTAAATAAAA CTAATAAAAA CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTGGGAAGCT (2) CTTAATAAAA (6) GACACTGGCA (2) GGCCACATCA (2) GTAATAAAAG GTCGGCCGCC (2) GTGCTGCAGG (2) TTAATAAAAG (2) 265.7 0.2657 P6.5 retina AACGCCAACC (3) AGAAAGTTCA (3) ATGGACTTTA CCAATAAAAG CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTATAAAAAA (3) CTTAATAAAA (6) GGACCTCCTT GGTCCACTGG GTAATAAAAG GTGCTGCAGG (2) TTAATAAAAG (2) 201.9 0.2019 P10.5 crx- retina AATGGCTGGC (2) CCAATAAAAG CCGAGGGAGT CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTTAATAAAA (6) GGAGTGTTGT (2) GGGGATCAGT GTAATAAAAG GTCGGCCGCC (2) GTGCTGCAGG (2) TTAATAAAAG (2) 98.6 0.0986 P10.5 crx+ retina AACGCCAACC (3) AAGGCCTACC (2) CCAATAAAAG CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTATTAAAAG (2) CTGGAAAGCT (2) CTTAATAAAA (6) GACACTGGCA (2) GGCCACATCA (2) GGGGATCAGT GTAATAAAAG GTCGGCCGCC (2) GTGCTGCAGG (2) TCACGATGCT (2) TTAATAAAAG (2) 128.4 0.1284 Adult retinal CTAAATAAAA CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTATAAAAAA (3) CTATTAAAAG (2) CTTAATAAAA (6) GCTTTCTTCC (2) GTCGGCCGCC (2) TTAATAAAAG (2) 40.9 0.0409 ONL CTAATAAAAA CTAATAAAAG (3) CTAATAAACG (4) CTGGGAAGCT (2) GACACTGGCA (2) GCTTTCTTCC (2) GGACCTCCTT TTAATAAAAG (2) 59.2 0.0592