Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.215034	RNU19	RNA, U19 small nucleolar	18		436583
Mm.215034	1110061A14Rik	RIKEN cDNA 1110061A14 gene	18		68827
Mm.215034	AY223547	cDNA sequence AY223547			448986
Mm.215034	Matr3	matrin 3	18	18 15.0 cM	17184
Mm.215034	2810017I02Rik	RIKEN cDNA 2810017I02 gene	18		69967
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 229 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AATGAAGTTC (5) AATTACAAGC AATTAGAAGC (5) ACATTAAAAG (5) ACCCTGTGAA AGGTCACCCT (5) CAAAAAAAAA (2) CAAAAAGGCA (5) CCTTTAATCC (3) CTGCTGTGGA GGAAAATAAA (2) TATAATCTGT (5) TGACCTTTGT (6) TGGTGCCTCT TTGAAAAAAA (9) TTTGGATGTT (5) 161.4 0.1614 Cb medulloblastoma AATGAAGTTC (5) ACCCTGTGAA CAAAAAAAAA (2) CAAAAAGGCA (5) CAGGATTCCT (5) CCTTTAATCC (3) CTTTAACAAA (5) GAAGTCGTTC (6) GTGGCATATA (5) TATAATCTGT (5) TGGCCGGCTA (5) TGGTGCCTCT TTGAAAAAAA (9) TTTGGATGTT (5) 182.4 0.1824 P8 GC+1d culture AATGAAGTTC (5) AATTACAAGC ACCCTGTGAA CAAAAAAAAA (2) CAGGATTCCT (5) CCTTTAATCC (3) CTGTTTAGAT (5) CTTTAACAAA (5) TATAATCTGT (5) TGGCCGGCTA (5) TGGTGCCTCT TGTGTGTGAG (5) TTGAAAAAAA (9) TTTGGATGTT (5) 123.1 0.1231 P8 GC+SHH+1d culture AATGAAGTTC (5) AATTACAAGC AATTAGAAGC (5) ACCCTGTGAA AGGTCACCCT (5) CAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCC (3) CTGTTTAGAT (5) CTTTAACAAA (5) GAAGTCGTTC (6) TATAATCTGT (5) TGGCCGGCTA (5) TGGTGCCTCT TGTGTGTGAG (5) TTGAAAAAAA (9) TTTGGATGTT (5) 154.6 0.1546 3T3 fibroblasts AATTAGAAGC (5) CCTTTAATCC (3) TGGTGCCTCT 94.6 0.0946 E15 cortex CAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCC (3) CTTCTTGAAT (7) GTGGCATATA (5) TATAATCTGT (5) 103.7 0.1037 P1 cortex AATTACAAGC ACATTAAAAG (5) CAAAAAAAAA (2) CAGGATTCCT (5) CCTTTAATCC (3) TATAATCTGT (5) TGGCCGGCTA (5) TTTGGATGTT (5) 249.8 0.2498 Hypothalamus AATTACAAGC CAAAAAAAAA (2) CAGGATTCCT (5) CCTTTAATCC (3) GGAAAATAAA (2) TATAATCTGT (5) TGGCCGGCTA (5) TTTGGATGTT (5) 101.5 0.1015 E12.5 retina AATTACAAGC ACCCTGTGAA CAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCC (3) CTTCTTGAAT (7) TATAATCTGT (5) TGGTGCCTCT TTGAAAAAAA (9) 131.5 0.1315 E14.5 retina AATTACAAGC AATTAGAAGC (5) AGTCTGGAGC CAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCC (3) CTGTTTAGAT (5) GAAAATGGGA GAAGTCGTTC (6) TATAATCTGT (5) TGGTGCCTCT TTTGGATGTT (5) 169.4 0.1694 E16.5 retina AATTACAAGC CAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCC (3) CTTCTTGAAT (7) CTTTAACAAA (5) GTGGCATATA (5) TATAATCTGT (5) TGACCTTTGT (6) TGGCCGGCTA (5) TGGTGCCTCT TTTGGATGTT (5) 108.6 0.1086 E18.5 retina AATTACAAGC ACATTAAAAG (5) CAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCC (3) CTGTTTAGAT (5) TATAATCTGT (5) TGGTGCCTCT TGTGTGTGAG (5) TTGAAAAAAA (9) TTTGGATGTT (5) 109 0.109 P0.5 retina AATTACAAGC CAAAAAAAAA (2) CACAAAAAAT (6) CAGGATTCCT (5) CCTTTAATCC (3) CTGCTGTGGA GGAAGGTCGG TATAATCTGT (5) TGGTGCCTCT TGTGTGTGAG (5) TTGAAAAAAA (9) TTTGGATGTT (5) 255.3 0.2553 P2.5 retina AATGAAGTTC (5) AATTACAAGC AATTAGAAGC (5) ACCCTGTGAA AGGTCACCCT (5) CAAAAAAAAA (2) CACAAAAAAT (6) CCTTTAATCC (3) CTGCTGTGGA CTGTTTAGAT (5) CTTCTTGAAT (7) GGAAAATAAA (2) GTGGCATATA (5) TATAATCTGT (5) TGGTGCCTCT TTTGGATGTT (5) 176.3 0.1763 P4.5 retina AATTACAAGC ACCCTGTGAA AGGTCACCCT (5) AGTCTGGAGC CAAAAAAAAA (2) CAGGATTCCT (5) CCTTTAATCC (3) TATAATCTGT (5) TGGTGCCTCT TTGAAAAAAA (9) TTTGGATGTT (5) 134.8 0.1348 P6.5 retina AATTACAAGC ACATTAAAAG (5) ACCCTGTGAA AGGTCACCCT (5) CAAAAAAAAA (2) CCTTTAATCC (3) CTGTTTAGAT (5) CTTTAACAAA (5) GTGGCATATA (5) TATAATCTGT (5) TGACCTTTGT (6) TGGTGCCTCT TTTGGATGTT (5) 148.4 0.1484 P10.5 crx- retina AATGAAGTTC (5) AATTACAAGC AGGTCACCCT (5) CAAAAAAAAA (2) CAAAAAGGCA (5) CACAAAAAAT (6) CCTTTAATCC (3) CTGTTTAGAT (5) GTGGCATATA (5) TATAATCTGT (5) TGGCCGGCTA (5) TTGAAAAAAA (9) TTTGGATGTT (5) 132.1 0.1321 P10.5 crx+ retina AATGAAGTTC (5) AATTACAAGC AATTAGAAGC (5) ACCCTGTGAA CAAAAAAAAA (2) CAAAAAGGCA (5) CCTTTAATCC (3) CTGTTTAGAT (5) CTTTAACAAA (5) GTGGCATATA (5) TATAATCTGT (5) TGGCCGGCTA (5) TGGTGCCTCT TGTGTGTGAG (5) TTTGGATGTT (5) 138.2 0.1382 Adult retinal AATGAAGTTC (5) AATTAGAAGC (5) CAAAAAAAAA (2) CAAAAAGGCA (5) CAGGATTCCT (5) CCTTTAATCC (3) CTGCTGTGGA GGAAGGTCGG TATAATCTGT (5) TGGCCGGCTA (5) TTGAAAAAAA (9) TTTGGATGTT (5) 178.2 0.1782 ONL AATGAAGTTC (5) ACCCTGTGAA AGGTCACCCT (5) AGTCTGGAGC CAAAAAAAAA (2) CACAAAAAAT (6) CAGGATTCCT (5) CCTTTAATCC (3) CTTTAACAAA (5) GGAAGGTCGG TATAATCTGT (5) TTGAAAAAAA (9) TTTGGATGTT (5) 135.8 0.1358