Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.2180 Hspcbheat shock protein 1, beta 17  17 B3 (17 15.0 cM)  15516 
 Mm.2180 Slc35b1solute carrier family 35, member B1 17  17 B3  73836 
 Gene Ontology extracellular space | integral to membrane
 Human Homolog SLC35B2[solute carrier family 35, member B2]
 Clusters 
   Neighbors    

Total 7 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 154 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAACATCATCC (3)
AAGGAGACCC (2)
AAGGAGATCT (7)
AAGGCCAGGC (5)
ATGGCCAAAA (3)
CGCGAGGCAT (3)
CGGTAGATGC (3)
GAAGAGGTGG (3)
GACAGCTGTG (2)
GTCTGCCCGG (2)
GTGAGCCCAT (2)
TCTACAAGAA (3)
101.10.1011
Cb medulloblastomaAACATCATCC (3)
AAGGAGATCT (7)
GAAGAGGTGG (3)
GTGAGCCCAT (2)
TCTACAAGAA (3)
27.70.0277
P8 GC+1d cultureAACATCATCC (3)
AAGGAGACCC (2)
AAGGCCAGGC (5)
AAGGCCCAGG (3)
ATGGCCAAAA (3)
CGCGAGGCAT (3)
CGGTAGATGC (3)
GAAGAGGTGG (3)
GAGAGGAGGA (3)
GTGAGCCCAT (2)
TCCACAAGAA (2)
TCTACAAGAA (3)
144.90.1449
P8 GC+SHH+1d cultureAACATCATCC (3)
AAGGAGACCC (2)
AAGGAGATCT (7)
AAGGCCAGGC (5)
AGCTTGCAGA (2)
ATGAACACAC (2)
CCTACAAGAA (2)
CGCGAGGCAT (3)
CGGTAGATGC (3)
GAAGAGGTGG (3)
GTCTGCCCGG (2)
GTGAGCCCAT (2)
TCTACAAGAA (3)
152.30.1523
3T3 fibroblastsCGCGAGGCAT (3)
GTGAGCCCAT (2)
TCTACAAGAA (3)
77.10.0771
E15 cortexAAGATTCCAC (2)
AAGGAGACCC (2)
ATCGGGCAGT (2)
CGGTAGATGC (3)
GACAGCTGTG (2)
GAGAGGAGGA (3)
GTGAGCCCAT (2)
TCTACAAGAA (3)
212.60.2126
P1 cortexAACATCATCC (3)
GTGAGCCCAT (2)
TCTACAAGAA (3)
113.60.1136
HypothalamusAACATCATCC (3)
ATCGGGCAGT (2)
ATGAACACAC (2)
CGGTAGATGC (3)
GAAGAGGTGG (3)
GTGAGCCCAT (2)
TCTACAAGAA (3)
TTTACAAAAA (2)
74.20.0742
E12.5 retinaAACATCATCC (3)
AAGGAGATCT (7)
AGCTTGCAGA (2)
CGCGAGGCAT (3)
CGGTAGATGC (3)
GAAGAGGTGG (3)
GTGAGCCCAT (2)
TCTACAAGAA (3)
TTTACAAGAA (2)
159.80.1598
E14.5 retinaAAGATTCCAC (2)
AAGGAGACCC (2)
AAGGAGATCT (7)
AAGGCCCAGG (3)
AGCTTGCAGA (2)
ATGAACACAC (2)
CCTACAAGAA (2)
CGCGAGGCAT (3)
CGGTAGATGC (3)
GAAGAGGTGG (3)
GACAGCTGTG (2)
GAGAGGAGGA (3)
GTGAGCCCAT (2)
TCCCTCATCA (2)
TCTACAAGAA (3)
96.30.0963
E16.5 retinaAACATCATCC (3)
AAGGAGATCT (7)
AGCTTGCAGA (2)
ATGAACACAC (2)
CGCGAGGCAT (3)
CGGTAGATGC (3)
GAAGAGGTGG (3)
GACAGCTGTG (2)
GTCTGCCCGG (2)
GTGAGCCCAT (2)
TCCACAAGAA (2)
TCCCTCATCA (2)
TCTACAAGAA (3)
TTTACAAAAA (2)
121.20.1212
E18.5 retinaAACATCATCC (3)
CGCGAGGCAT (3)
CGGTAGATGC (3)
GACCAGGAAA (2)
GTGAGCCCAT (2)
TCTACAAGAA (3)
41.70.0417
P0.5 retinaAACATCATCC (3)
AAGATTCCAC (2)
AAGGCCAGGC (5)
ATGAACACAC (2)
CGGTAGATGC (3)
GAAGAGGTGG (3)
GACCAGGAAA (2)
GTCTGCCCGG (2)
GTGAGCCCAT (2)
TCTACAAGAA (3)
74.80.0748
P2.5 retinaAACATCATCC (3)
GACAGCTGTG (2)
GTGAGCCCAT (2)
TCTACAAGAA (3)
TTTACAAGAA (2)
47.60.0476
P4.5 retinaAGCTTGCAGA (2)
CCTACAAGAA (2)
GACCAGGAAA (2)
GTGAGCCCAT (2)
TCTACAAGAA (3)
TTTACAAGAA (2)
35.80.0358
P6.5 retinaAACATCATCC (3)
AAGGAGATCT (7)
GTGAGCCCAT (2)
TCTACAAGAA (3)
TTTACAAAAA (2)
46.70.0467
P10.5 crx- retinaAACATCATCC (3)
AAGGCCCAGG (3)
CGGTAGATGC (3)
GAAGAGGTGG (3)
TCCACAAGAA (2)
TCTACAAGAA (3)
42.90.0429
P10.5 crx+ retinaAACATCATCC (3)
AAGGCCAGGC (5)
GTGAGCCCAT (2)
TCTACAAGAA (3)
34.50.0345
Adult retinalAACATCATCC (3)
AAGGAGACCC (2)
CCTACAAGAA (2)
CGCGAGGCAT (3)
GTCTGCCCGG (2)
GTGAGCCCAT (2)
TCTACAAGAA (3)
24.40.0244
ONLAACATCATCC (3)
AAGGAGATCT (7)
TCTACAAGAA (3)
15.30.0153