Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.221244 2610100L16RikRIKEN cDNA 2610100L16 gene 3    70441 
 Mm.221244 A930005K07RikRIKEN cDNA A930005K07 gene 3    109217 
 Mm.221244 6430547I21RikRIKEN cDNA 6430547I21 gene 3    320521 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 85 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTGGAACTTC (7)
TCATTAAAAA (4)
TTTGTATGTC (4)
6.50.0065
Cb medulloblastomaGTAGCCTTGA (3)
TCATTAAAAA (4)
4.60.0046
P8 GC+1d cultureTTTGTATGTC (4)
2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureCAGGTGGAAA
CGAGTCCTTT (3)
TTTGTATGTC (4)
3.60.0036
3T3 fibroblastsCTGGAACTTC (7)
GTAGCCTTGA (3)
70.007
P1 cortexCTTGAATTTC (3)
GAACATTTTC (2)
TTGTGAAGCA (3)
13.50.0135
HypothalamusATGGAAAGAA (2)
CAGGTGGAAA
CTGGAACTTC (7)
TCATTAAAAA (4)
TTGTGAAGCA (3)
10.80.0108
E12.5 retinaCTGGAACTTC (7)
CTTGAATTTC (3)
GTGTGGTCCT (5)
5.70.0057
E14.5 retinaATGGAAAGAA (2)
ATTAAACCCA (3)
CGAGTCCTTT (3)
GTAGCCTTGA (3)
TCATTAAAAA (4)
TTGTGAAGCA (3)
19.90.0199
E16.5 retinaTTGAAAAGTT (3)
TTGTGAAGCA (3)
10.90.0109
E18.5 retinaCCTATTTTTC
CTGGAACTTC (7)
TAATATGAAA (3)
TTAAATCAAC (3)
TTGTGAAGCA (3)
10.80.0108
P0.5 retinaATGGAAAGAA (2)
CCTATTTTTC
CTGGAACTTC (7)
CTTGAATTTC (3)
TCATTAAAAA (4)
TTGTGAAGCA (3)
41.40.0414
P2.5 retinaATTAAACCCA (3)
CGAGTCCTTT (3)
TTGTGAAGCA (3)
22.90.0229
P4.5 retinaCTGGAACTTC (7)
GTGTGGTCCT (5)
TTGTGAAGCA (3)
39.60.0396
P6.5 retinaATGGAAAGAA (2)
CTGGAACTTC (7)
TAATATGAAA (3)
TTAAATCAAC (3)
TTGTGAAGCA (3)
71.80.0718
P10.5 crx- retinaATTAAACCCA (3)
CAGGTGGAAA
CTGGAACTTC (7)
GTGTGGTCCT (5)
TAATATGAAA (3)
TTAAATCAAC (3)
TTGAAAAGTT (3)
TTGTGAAGCA (3)
76.40.0764
P10.5 crx+ retinaCGAGTCCTTT (3)
CTGGAACTTC (7)
CTTGAATTTC (3)
GAACATTTTC (2)
GTCCTCTGCA (2)
GTGTGGTCCT (5)
TAATATGAAA (3)
TTAAATCAAC (3)
TTGAAAAGTT (3)
TTGTGAAGCA (3)
88.30.0883
Adult retinalCCTATTTTTC
CTGGAACTTC (7)
CTTGAATTTC (3)
GAACATTTTC (2)
GTGTGGTCCT (5)
TTAAATCAAC (3)
TTGTGAAGCA (3)
83.40.0834
ONLCAGGTGGAAA
CCTATTTTTC
GAACATTTTC (2)
TAATATGAAA (3)
TTAAATCAAC (3)
TTGAAAAGTT (3)
TTGTGAAGCA (3)
TTTGTATGTC (4)
630.063