Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.221275 Rtn1reticulon 1 12  12 C2  104001 
 Mm.221275 4930441F12RikRIKEN cDNA 4930441F12 gene 12    78799 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 5 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 111 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGTGGGGGTG (3)
TAAATCAGCC (2)
TCCTTGGGTT (2)
TGTATGTGTG (3)
TTGACTTTAT (3)
71.80.0718
Cb medulloblastomaAGTGGGGGTG (3)
TCCTTGGGTT (2)
TTGACTTTAT (3)
55.50.0555
P8 GC+1d cultureAGTGGGGGTG (3)
ATAAGCGATC (2)
ATAAGGGATC (2)
ATGGTGAGAG (2)
CACTTTTTTT (2)
TAAATCAGCC (2)
TAGACTTTAT (3)
TCCGGCTTCT (2)
TCCTTGGGTT (2)
TGTATGTGTG (3)
TTGACTTTAT (3)
2030.203
P8 GC+SHH+1d cultureAGTGGGGGTG (3)
ATAAGCGATC (2)
ATAAGGGATC (2)
ATGGTGAGAG (2)
CACTTTTTTT (2)
TAAATCAGCC (2)
TAGACTTTAT (3)
TCCGGCTTCT (2)
TCCTTGGGTT (2)
TTGACTTTAT (3)
131.20.1312
E15 cortexAGTGGGGGTG (3)
CACTTTTTTT (2)
TCCTTGGGTT (2)
TTGACTTTAT (3)
49.40.0494
P1 cortexAGTGGGGGTG (3)
TCCGGCTTCT (2)
TCCTTGGGTT (2)
TGTATGTGTG (3)
TTGACTTTAT (3)
127.20.1272
HypothalamusAGTGGGGGTG (3)
ATGGTGAGAG (2)
CACTTTTTTT (2)
TAAATCAGCC (2)
TCCGGCTTCT (2)
TCCTTGGGTT (2)
TGGCTCCTGA (2)
TTGACTTTAT (3)
155.70.1557
E12.5 retinaAGTGGGGGTG (3)
TAGACTTTAT (3)
TTGACTTTAT (3)
16.90.0169
E14.5 retinaAGTGGGGGTG (3)
ATAAGCGATC (2)
ATGGTGAGAG (2)
CACTTTTTTT (2)
TAAATCAGCC (2)
TCCGGCTTCT (2)
TGTATGTGTG (3)
TTGACTTTAT (3)
72.70.0727
E16.5 retinaAGTGGGGGTG (3)
ATAAGCGATC (2)
ATGGTGAGAG (2)
CACTTTTTTT (2)
TAAATCAGCC (2)
TCCGGCTTCT (2)
TCCTTGGGTT (2)
TGGCTCCTGA (2)
TGTATGTGTG (3)
TTGACTTTAT (3)
121.30.1213
E18.5 retinaAGTGGGGGTG (3)
ATGGTGAGAG (2)
CACTTTTTTT (2)
TAAATCAGCC (2)
TCCGGCTTCT (2)
TCCTTGGGTT (2)
TGTATGTGTG (3)
TTGACTTTAT (3)
74.60.0746
P0.5 retinaAGTGGGGGTG (3)
ATAAGCGATC (2)
CACTTTTTTT (2)
TAAATCAGCC (2)
TCCTTGGGTT (2)
TTGACTTTAT (3)
60.90.0609
P2.5 retinaAGTGGGGGTG (3)
ATAAGGGATC (2)
TAAATCAGCC (2)
TGGCTCCTGA (2)
TTGACTTTAT (3)
51.10.0511
P4.5 retinaAGTGGGGGTG (3)
ATAAGCGATC (2)
CACTTTTTTT (2)
TAAATCAGCC (2)
TCCTTGGGTT (2)
TGGCTCCTGA (2)
TTGACTTTAT (3)
51.60.0516
P6.5 retinaAGTGGGGGTG (3)
TAAATCAGCC (2)
TCCTTGGGTT (2)
TTGACTTTAT (3)
48.40.0484
P10.5 crx- retinaAGTGGGGGTG (3)
TCCGGCTTCT (2)
TCCTTGGGTT (2)
TTGACTTTAT (3)
63.30.0633
P10.5 crx+ retinaAGTGGGGGTG (3)
CACTTTTTTT (2)
TTGACTTTAT (3)
36.50.0365
Adult retinalAGTGGGGGTG (3)
TCCTTGGGTT (2)
TGTATGTGTG (3)
TTGACTTTAT (3)
29.80.0298
ONLAGTGGGGGTG (3)
TGTATGTGTG (3)
TTGACTTTAT (3)
15.30.0153