Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.23987 Tiraptoll-interleukin 1 receptor (TIR) domain-containing adaptor protein 9    117149 
 Mm.23987 C130027E04RikRIKEN cDNA C130027E04 gene 9    102378 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 64 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTGGTTGCTGG (369)68.50.0685
P8 Cb GCGTGACTCCCA (4)3.30.0033
Cb medulloblastomaTGGTTGCTGG (369)113.30.1133
Cb medulloblastomaGTGACTCCCA (4)2.30.0023
Cb medulloblastomaTGGATCCTGG (11)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGGTTGCTGG (369)57.10.0571
P8 GC+1d cultureGTGACTCCCA (4)9.10.0091
P8 GC+1d cultureAAATACTGCA (2)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTGGATCCTGG (11)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTGGTTGCTGG (369)890.089
P8 GC+SHH+1d cultureGTGACTCCCA (4)9.40.0094
P8 GC+SHH+1d cultureTACTATGTGG (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTGGATCCTGG (11)1.20.0012
3T3 fibroblastsTGGTTGCTGG (369)220.80.2208
3T3 fibroblastsGTGACTCCCA (4)70.007
3T3 fibroblastsTGGATCCTGG (11)3.50.0035
E15 cortexTGGTTGCTGG (369)277.10.2771
E15 cortexGTGACTCCCA (4)4.90.0049
P1 cortexTGGTTGCTGG (369)86.40.0864
P1 cortexGTGACTCCCA (4)9.10.0091
HypothalamusTGGTTGCTGG (369)349.60.3496
HypothalamusGTGACTCCCA (4)7.20.0072
HypothalamusTGGATCCTGG (11)5.40.0054
HypothalamusAAATACTGCA (2)1.80.0018
E12.5 retinaTGGTTGCTGG (369)157.70.1577
E12.5 retinaGTGACTCCCA (4)3.80.0038
E14.5 retinaTGGTTGCTGG (369)936.50.9365
E14.5 retinaTGGATCCTGG (11)3.60.0036
E16.5 retinaTGGTTGCTGG (369)767.90.7679
E16.5 retinaGTGACTCCCA (4)9.10.0091
E16.5 retinaTACTATGTGG (3)3.60.0036
E16.5 retinaTGGATCCTGG (11)1.80.0018
E18.5 retinaTGGTTGCTGG (369)252.80.2528
E18.5 retinaGTGACTCCCA (4)5.50.0055
E18.5 retinaAAATACTGCA (2)1.80.0018
P0.5 retinaTGGTTGCTGG (369)190.40.1904
P0.5 retinaGTGACTCCCA (4)5.90.0059
P0.5 retinaTACTATGTGG (3)20.002
P0.5 retinaTGGATCCTGG (11)20.002
P2.5 retinaTGGTTGCTGG (369)165.40.1654
P2.5 retinaGTGACTCCCA (4)10.60.0106
P2.5 retinaAAATACTGCA (2)1.80.0018
P2.5 retinaTGGATCCTGG (11)1.80.0018
P4.5 retinaTGGTTGCTGG (369)150.60.1506
P4.5 retinaTGGATCCTGG (11)40.004
P6.5 retinaTGGTTGCTGG (369)156.70.1567
P6.5 retinaGTGACTCCCA (4)8.30.0083
P6.5 retinaTACTATGTGG (3)50.005
P6.5 retinaAAATACTGCA (2)1.70.0017
P6.5 retinaAAGCTGTCAT (2)1.70.0017
P6.5 retinaTGGATCCTGG (11)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTGGTTGCTGG (369)280.50.2805
P10.5 crx- retinaTGGATCCTGG (11)130.013
P10.5 crx- retinaGTGACTCCCA (4)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTACTATGTGG (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGGTTGCTGG (369)101.90.1019
P10.5 crx+ retinaTGGATCCTGG (11)9.60.0096
P10.5 crx+ retinaGTGACTCCCA (4)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaTACTATGTGG (3)3.80.0038
Adult retinalTGGTTGCTGG (369)214.80.2148
Adult retinalGTGACTCCCA (4)1.90.0019
Adult retinalTGGATCCTGG (11)1.90.0019
ONLTGGTTGCTGG (369)398.40.3984
ONLGTGACTCCCA (4)5.70.0057