Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.245522 D5Wsu152eDNA segment, Chr 5, Wayne State University 152, expressed 5  5 51.0 cM  28022 
 Mm.245522 D5Ertd236eDNA segment, Chr 5, ERATO Doi 236, expressed 5  5 51.0 cM  52247 
 Mm.245522 AU017193expressed sequence AU017193 5    100798 
 Mm.245522 A130069E23RikRIKEN cDNA A130069E23 gene 5    320883 
 Mm.245522 AL118186expressed sequence AL118186 5    404570 
 Mm.245522 E330009E22RikRIKEN cDNA E330009E22 gene 5    320567 
 Mm.245522 Ankrd17ankyrin repeat domain 17 5    81702 
 Gene Ontology cellular_component unknown | endoderm development | molecular_function unknown
 Human Homolog ANKRD17[ankyrin repeat domain 17]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 64 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGCACTGTG (9)
AATAAACTCT (8)
AATTTAAGTC (7)
TGAGATATGT (7)
8.10.0081
Cb medulloblastomaAAGCACTGTG (9)
GTAAAAGAAA (7)
TGAGATATGT (7)
11.50.0115
P8 GC+1d cultureAAGCACTGTG (9)
AATAAACTCT (8)
CAGTTTTCCC (8)
TGAGATATGT (7)
TTTGGTGTTT (7)
13.60.0136
P8 GC+SHH+1d cultureAAGCACTGTG (9)
AATAAACTCT (8)
AATTTAAGTC (7)
TGAGATATGT (7)
12.90.0129
3T3 fibroblastsAAGCACTGTG (9)
10.50.0105
E15 cortexAAGCACTGTG (9)
AATAAACTCT (8)
9.80.0098
P1 cortexAAGCACTGTG (9)
CAGTTTTCCC (8)
TGAGATATGT (7)
13.50.0135
HypothalamusTGAGATATGT (7)
3.60.0036
E12.5 retinaAAGCACTGTG (9)
GTAAAAGAAA (7)
TGAGATATGT (7)
13.20.0132
E14.5 retinaTGAGATATGT (7)
3.60.0036
E16.5 retinaTGAGATATGT (7)
3.60.0036
E18.5 retinaAAGCACTGTG (9)
AATAAACTCT (8)
GTTCTAGAAG (7)
TGAGATATGT (7)
14.50.0145
P0.5 retinaAATAAACTCT (8)
CAGTTTTCCC (8)
GTAAAAGAAA (7)
TGAGATATGT (7)
TTCATCAGCA (8)
19.70.0197
P2.5 retinaAATAAACTCT (8)
AATTTAAGTC (7)
TGAGATATGT (7)
10.60.0106
P4.5 retinaAAGCACTGTG (9)
GTAAAAGAAA (7)
GTTCTAGAAG (7)
TGAGATATGT (7)
100.01
P6.5 retinaAACCAGCTTG (7)
AAGCACTGTG (9)
TGAGATATGT (7)
TTCATCAGCA (8)
TTTGGTGTTT (7)
18.40.0184
P10.5 crx- retinaAAGCACTGTG (9)
GTTCTAGAAG (7)
TGAGATATGT (7)
TTTGGTGTTT (7)
22.40.0224
P10.5 crx+ retinaAACCAGCTTG (7)
AAGCACTGTG (9)
AATAAACTCT (8)
GTTCTAGAAG (7)
9.50.0095
Adult retinalGAGCAGACCC (7)
TGAGATATGT (7)
TTCATCAGCA (8)
TTTGGTGTTT (7)
9.40.0094
ONLAACCAGCTTG (7)
AAGCACTGTG (9)
TGAGATATGT (7)
5.70.0057