Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.246863 Prpf31PRP31 pre-mRNA processing factor 31 homolog (yeast) 7    68988 
 Human Homolog PRPF31[PRP31 pre-mRNA processing factor 31 homolog (yeast)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 100 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGGAAGATGCT (3)65.30.0653
P8 Cb GCCTAGACACCT (3)4.90.0049
P8 Cb GCCTGCTGCTTC (4)4.90.0049
P8 Cb GCCATATTGTAC (2)1.60.0016
P8 Cb GCGGTGTGGCTG (5)1.60.0016
Cb medulloblastomaGGAAGATGCT (3)97.10.0971
Cb medulloblastomaCTAGACACCT (3)9.20.0092
Cb medulloblastomaGACCCAGCTC (3)4.60.0046
P8 GC+1d cultureGGAAGATGCT (3)50.20.0502
P8 GC+1d cultureCTAGACACCT (3)45.70.0457
P8 GC+1d cultureCTGCTGCTTC (4)3.40.0034
P8 GC+1d cultureCATATTGTAC (2)1.10.0011
P8 GC+1d cultureCTGTGCTCCT (4)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureGGAAGATGCT (3)71.40.0714
P8 GC+SHH+1d cultureCTAGACACCT (3)30.40.0304
P8 GC+SHH+1d cultureCTGCTGCTTC (4)4.70.0047
P8 GC+SHH+1d cultureCATATTGTAC (2)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGACCCAGCTC (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTGCATCTCTG (4)1.20.0012
3T3 fibroblastsCTGCTGCTTC (4)140.014
3T3 fibroblastsGACCCAGCTC (3)3.50.0035
3T3 fibroblastsGGAACCTTGG (5)3.50.0035
E15 cortexGGAAGATGCT (3)9.90.0099
E15 cortexCTAGACACCT (3)4.90.0049
E15 cortexGACCCAGCTC (3)4.90.0049
E15 cortexGGTGTGGCTG (5)4.90.0049
P1 cortexGGAAGATGCT (3)36.40.0364
P1 cortexCTAGACACCT (3)4.50.0045
P1 cortexCTGCTGCTTC (4)4.50.0045
HypothalamusGGAAGATGCT (3)123.20.1232
HypothalamusCTGTGCTCCT (4)7.20.0072
HypothalamusCTAGACACCT (3)3.60.0036
HypothalamusGACCCAGCTC (3)3.60.0036
HypothalamusCATATTGTAC (2)1.80.0018
HypothalamusTTAACTGAAG (9)1.80.0018
E12.5 retinaGGAAGATGCT (3)39.40.0394
E12.5 retinaCTGCTGCTTC (4)11.30.0113
E12.5 retinaGGAACCTTGG (5)3.80.0038
E12.5 retinaCTAGACACCT (3)1.90.0019
E12.5 retinaGACCCAGCTC (3)1.90.0019
E14.5 retinaGGAAGATGCT (3)32.80.0328
E14.5 retinaCTAGACACCT (3)3.60.0036
E14.5 retinaCTGCTGCTTC (4)3.60.0036
E14.5 retinaCATATTGTAC (2)1.80.0018
E14.5 retinaGGAACCTTGG (5)1.80.0018
E14.5 retinaGGTGTGGCTG (5)1.80.0018
E14.5 retinaTGCATCTCTG (4)1.80.0018
E16.5 retinaGGAAGATGCT (3)18.10.0181
E16.5 retinaCTAGACACCT (3)7.20.0072
E16.5 retinaCTGCTGCTTC (4)3.60.0036
E16.5 retinaCATATTGTAC (2)1.80.0018
E16.5 retinaGGAACCTTGG (5)1.80.0018
E16.5 retinaTTAACTGAAG (9)1.80.0018
E18.5 retinaGGAAGATGCT (3)85.50.0855
E18.5 retinaCTGCTGCTTC (4)12.70.0127
E18.5 retinaCTAGACACCT (3)10.90.0109
E18.5 retinaGACCCAGCTC (3)3.60.0036
E18.5 retinaCATATTGTAC (2)1.80.0018
E18.5 retinaCTGTGCTCCT (4)1.80.0018
E18.5 retinaGGAACCTTGG (5)1.80.0018
P0.5 retinaGGAAGATGCT (3)45.10.0451
P0.5 retinaCTAGACACCT (3)9.80.0098
P0.5 retinaCTGCTGCTTC (4)9.80.0098
P0.5 retinaGACCCAGCTC (3)5.90.0059
P2.5 retinaGGAAGATGCT (3)38.70.0387
P2.5 retinaCTAGACACCT (3)10.60.0106
P2.5 retinaCTGCTGCTTC (4)10.60.0106
P2.5 retinaGACCCAGCTC (3)3.50.0035
P2.5 retinaCTGTGCTCCT (4)1.80.0018
P2.5 retinaGGAACCTTGG (5)1.80.0018
P2.5 retinaGGTGTGGCTG (5)1.80.0018
P4.5 retinaGGAAGATGCT (3)71.30.0713
P4.5 retinaCTAGACACCT (3)5.90.0059
P4.5 retinaCTGCTGCTTC (4)40.004
P4.5 retinaGGAACCTTGG (5)20.002
P6.5 retinaGGAAGATGCT (3)36.70.0367
P6.5 retinaCTAGACACCT (3)100.01
P6.5 retinaCTGCTGCTTC (4)100.01
P6.5 retinaGGAACCTTGG (5)3.30.0033
P6.5 retinaCATATTGTAC (2)1.70.0017
P6.5 retinaTGCATCTCTG (4)1.70.0017
P10.5 crx- retinaGGAAGATGCT (3)37.20.0372
P10.5 crx- retinaCTAGACACCT (3)7.40.0074
P10.5 crx- retinaCTGCTGCTTC (4)3.70.0037
P10.5 crx- retinaGACCCAGCTC (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGGAAGATGCT (3)65.40.0654
P10.5 crx+ retinaCTAGACACCT (3)9.60.0096
P10.5 crx+ retinaCTGCTGCTTC (4)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaCTGTGCTCCT (4)3.80.0038
Adult retinalGGAAGATGCT (3)27.80.0278
Adult retinalCTAGACACCT (3)9.30.0093
Adult retinalCTGCTGCTTC (4)7.40.0074
Adult retinalGAGAGCAGAA (8)5.60.0056
Adult retinalGACCCAGCTC (3)1.90.0019
ONLGGAAGATGCT (3)9.60.0096
ONLCTAGACACCT (3)7.70.0077
ONLGACCCAGCTC (3)1.90.0019
ONLGGAACCTTGG (5)1.90.0019
ONLTGCATCTCTG (4)1.90.0019
ONLTTAACTGAAG (9)1.90.0019