Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.246863 Prpf31PRP31 pre-mRNA processing factor 31 homolog (yeast) 7    68988 
 Human Homolog PRPF31[PRP31 pre-mRNA processing factor 31 homolog (yeast)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 100 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCATATTGTAC
CTAGACACCT (2)
CTGCTGCTTC (2)
GGAAGATGCT (2)
GGTGTGGCTG (3)
78.30.0783
Cb medulloblastomaCTAGACACCT (2)
GACCCAGCTC (3)
GGAAGATGCT (2)
110.90.1109
P8 GC+1d cultureCATATTGTAC
CTAGACACCT (2)
CTGCTGCTTC (2)
CTGTGCTCCT
GGAAGATGCT (2)
101.50.1015
P8 GC+SHH+1d cultureCATATTGTAC
CTAGACACCT (2)
CTGCTGCTTC (2)
GACCCAGCTC (3)
GGAAGATGCT (2)
TGCATCTCTG (3)
110.10.1101
3T3 fibroblastsCTGCTGCTTC (2)
GACCCAGCTC (3)
GGAACCTTGG
210.021
E15 cortexCTAGACACCT (2)
GACCCAGCTC (3)
GGAAGATGCT (2)
GGTGTGGCTG (3)
24.60.0246
P1 cortexCTAGACACCT (2)
CTGCTGCTTC (2)
GGAAGATGCT (2)
45.40.0454
HypothalamusCATATTGTAC
CTAGACACCT (2)
CTGTGCTCCT
GACCCAGCTC (3)
GGAAGATGCT (2)
TTAACTGAAG (7)
141.20.1412
E12.5 retinaCTAGACACCT (2)
CTGCTGCTTC (2)
GACCCAGCTC (3)
GGAACCTTGG
GGAAGATGCT (2)
58.30.0583
E14.5 retinaCATATTGTAC
CTAGACACCT (2)
CTGCTGCTTC (2)
GGAACCTTGG
GGAAGATGCT (2)
GGTGTGGCTG (3)
TGCATCTCTG (3)
47.20.0472
E16.5 retinaCATATTGTAC
CTAGACACCT (2)
CTGCTGCTTC (2)
GGAACCTTGG
GGAAGATGCT (2)
TTAACTGAAG (7)
34.30.0343
E18.5 retinaCATATTGTAC
CTAGACACCT (2)
CTGCTGCTTC (2)
CTGTGCTCCT
GACCCAGCTC (3)
GGAACCTTGG
GGAAGATGCT (2)
118.10.1181
P0.5 retinaCTAGACACCT (2)
CTGCTGCTTC (2)
GACCCAGCTC (3)
GGAAGATGCT (2)
70.60.0706
P2.5 retinaCTAGACACCT (2)
CTGCTGCTTC (2)
CTGTGCTCCT
GACCCAGCTC (3)
GGAACCTTGG
GGAAGATGCT (2)
GGTGTGGCTG (3)
68.80.0688
P4.5 retinaCTAGACACCT (2)
CTGCTGCTTC (2)
GGAACCTTGG
GGAAGATGCT (2)
83.20.0832
P6.5 retinaCATATTGTAC
CTAGACACCT (2)
CTGCTGCTTC (2)
GGAACCTTGG
GGAAGATGCT (2)
TGCATCTCTG (3)
63.40.0634
P10.5 crx- retinaCTAGACACCT (2)
CTGCTGCTTC (2)
GACCCAGCTC (3)
GGAAGATGCT (2)
50.20.0502
P10.5 crx+ retinaCTAGACACCT (2)
CTGCTGCTTC (2)
CTGTGCTCCT
GGAAGATGCT (2)
82.60.0826
Adult retinalCTAGACACCT (2)
CTGCTGCTTC (2)
GACCCAGCTC (3)
GAGAGCAGAA (3)
GGAAGATGCT (2)
520.052
ONLCTAGACACCT (2)
GACCCAGCTC (3)
GGAACCTTGG
GGAAGATGCT (2)
TGCATCTCTG (3)
TTAACTGAAG (7)
24.90.0249