Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.25366 Rnf44ring finger protein 44 13    105239 
 Human Homolog RNF44[ring finger protein 44]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 86 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAGAGTTATA (3)3.30.0033
P8 Cb GCCATATTTTTT1.60.0016
P8 Cb GCGACTGTGTCG (5)1.60.0016
P8 Cb GCTATGTATTTG (2)1.60.0016
P8 Cb GCTGTCTCTATG (3)1.60.0016
Cb medulloblastomaCAGAGTTATA (3)13.90.0139
Cb medulloblastomaGACTGTGTCC (3)2.30.0023
Cb medulloblastomaTATGTATTTG (2)2.30.0023
Cb medulloblastomaTGTCTCTATG (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTATGTATTTG (2)5.70.0057
P8 GC+1d cultureTGTCTCTATG (3)3.40.0034
P8 GC+1d cultureCATATTTTTT1.10.0011
P8 GC+1d cultureGACTGTGTCG (5)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTGTCTCTATG (3)4.70.0047
P8 GC+SHH+1d cultureTATGTATTTG (2)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureAAAGCTCCAC (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureCAGAGTTATA (3)1.20.0012
3T3 fibroblastsTGTCTCTATG (3)3.50.0035
E15 cortexGACTGTGTCC (3)4.90.0049
E15 cortexTATGTATTTG (2)4.90.0049
P1 cortexTATGTATTTG (2)4.50.0045
P1 cortexTGTCTCTATG (3)4.50.0045
HypothalamusTGTCTCTATG (3)7.20.0072
HypothalamusGACTGTGTCC (3)3.60.0036
HypothalamusGACTGTGTCG (5)3.60.0036
HypothalamusAAAGCTCCAC (3)1.80.0018
HypothalamusCATATTTTTT1.80.0018
HypothalamusTATGTATTTG (2)1.80.0018
E12.5 retinaTGTCTCTATG (3)9.40.0094
E12.5 retinaTATGTATGTG (12)3.80.0038
E12.5 retinaAAAGCTCCAC (3)1.90.0019
E12.5 retinaGACTGTGTCC (3)1.90.0019
E12.5 retinaGACTGTGTCG (5)1.90.0019
E12.5 retinaTATGTATTTG (2)1.90.0019
E14.5 retinaTGTCTCTATG (3)12.80.0128
E14.5 retinaCAGAGTTATA (3)3.60.0036
E14.5 retinaCATATTTTTT3.60.0036
E14.5 retinaGACTGTGTCC (3)1.80.0018
E14.5 retinaTATGTATGTG (12)1.80.0018
E14.5 retinaTATGTATTTG (2)1.80.0018
E16.5 retinaTGTCTCTATG (3)14.50.0145
E16.5 retinaCAGAGTTATA (3)1.80.0018
E16.5 retinaGACTGTGTCC (3)1.80.0018
E16.5 retinaTATGTATGTG (12)1.80.0018
E16.5 retinaTATGTATTTG (2)1.80.0018
E18.5 retinaTGTCTCTATG (3)9.10.0091
E18.5 retinaCAGAGTTATA (3)5.50.0055
E18.5 retinaCATATTTTTT3.60.0036
E18.5 retinaGACTGTGTCC (3)1.80.0018
E18.5 retinaTATGTATTTG (2)1.80.0018
P0.5 retinaCATATTTTTT3.90.0039
P0.5 retinaTGTCTCTATG (3)3.90.0039
P0.5 retinaAAAGCTCCAC (3)20.002
P0.5 retinaCAGAGTTATA (3)20.002
P0.5 retinaGACTGTGTCC (3)20.002
P0.5 retinaTATGTATGTG (12)20.002
P2.5 retinaTGTCTCTATG (3)12.30.0123
P2.5 retinaCATATTTTTT3.50.0035
P2.5 retinaGACTGTGTCC (3)3.50.0035
P2.5 retinaCAGAGTTATA (3)1.80.0018
P2.5 retinaGACTGTGTCG (5)1.80.0018
P2.5 retinaTATGTATTTG (2)1.80.0018
P4.5 retinaGACTGTGTCC (3)5.90.0059
P4.5 retinaTATGTATTTG (2)5.90.0059
P4.5 retinaTGTCTCTATG (3)40.004
P4.5 retinaAAAGCTCCAC (3)20.002
P4.5 retinaCAGAGTTATA (3)20.002
P6.5 retinaTGTCTCTATG (3)50.005
P6.5 retinaAAAGCTCCAC (3)3.30.0033
P6.5 retinaCATATTTTTT3.30.0033
P6.5 retinaCAGAGTTATA (3)1.70.0017
P6.5 retinaGACTGTGTCC (3)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTATGTATTTG (2)7.40.0074
P10.5 crx- retinaTGTCTCTATG (3)5.60.0056
P10.5 crx- retinaTATGTATGTG (12)3.70.0037
P10.5 crx- retinaCAGAGTTATA (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTATGTATTTG (2)7.70.0077
P10.5 crx+ retinaTGTCTCTATG (3)7.70.0077
P10.5 crx+ retinaCAGAGTTATA (3)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaAAAGCTCCAC (3)1.90.0019
Adult retinalAAAGCTCCAC (3)1.90.0019
Adult retinalTATGTATGTG (12)1.90.0019
Adult retinalTATGTATTTG (2)1.90.0019
Adult retinalTGTCTCTATG (3)1.90.0019
ONLCAGAGTTATA (3)3.80.0038
ONLTATGTATTTG (2)1.90.0019