Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.25366	Rnf44	ring finger protein 44	13		105239
Human Homolog	RNF44[ring finger protein 44]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 86 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CAGAGTTATA (3) 3.3 0.0033 P8 Cb GC CATATTTTTT 1.6 0.0016 P8 Cb GC GACTGTGTCG (5) 1.6 0.0016 P8 Cb GC TATGTATTTG (2) 1.6 0.0016 P8 Cb GC TGTCTCTATG (3) 1.6 0.0016 Cb medulloblastoma CAGAGTTATA (3) 13.9 0.0139 Cb medulloblastoma GACTGTGTCC (3) 2.3 0.0023 Cb medulloblastoma TATGTATTTG (2) 2.3 0.0023 Cb medulloblastoma TGTCTCTATG (3) 2.3 0.0023 P8 GC+1d culture TATGTATTTG (2) 5.7 0.0057 P8 GC+1d culture TGTCTCTATG (3) 3.4 0.0034 P8 GC+1d culture CATATTTTTT 1.1 0.0011 P8 GC+1d culture GACTGTGTCG (5) 1.1 0.0011 P8 GC+SHH+1d culture TGTCTCTATG (3) 4.7 0.0047 P8 GC+SHH+1d culture TATGTATTTG (2) 3.5 0.0035 P8 GC+SHH+1d culture AAAGCTCCAC (3) 1.2 0.0012 P8 GC+SHH+1d culture CAGAGTTATA (3) 1.2 0.0012 3T3 fibroblasts TGTCTCTATG (3) 3.5 0.0035 E15 cortex GACTGTGTCC (3) 4.9 0.0049 E15 cortex TATGTATTTG (2) 4.9 0.0049 P1 cortex TATGTATTTG (2) 4.5 0.0045 P1 cortex TGTCTCTATG (3) 4.5 0.0045 Hypothalamus TGTCTCTATG (3) 7.2 0.0072 Hypothalamus GACTGTGTCC (3) 3.6 0.0036 Hypothalamus GACTGTGTCG (5) 3.6 0.0036 Hypothalamus AAAGCTCCAC (3) 1.8 0.0018 Hypothalamus CATATTTTTT 1.8 0.0018 Hypothalamus TATGTATTTG (2) 1.8 0.0018 E12.5 retina TGTCTCTATG (3) 9.4 0.0094 E12.5 retina TATGTATGTG (12) 3.8 0.0038 E12.5 retina AAAGCTCCAC (3) 1.9 0.0019 E12.5 retina GACTGTGTCC (3) 1.9 0.0019 E12.5 retina GACTGTGTCG (5) 1.9 0.0019 E12.5 retina TATGTATTTG (2) 1.9 0.0019 E14.5 retina TGTCTCTATG (3) 12.8 0.0128 E14.5 retina CAGAGTTATA (3) 3.6 0.0036 E14.5 retina CATATTTTTT 3.6 0.0036 E14.5 retina GACTGTGTCC (3) 1.8 0.0018 E14.5 retina TATGTATGTG (12) 1.8 0.0018 E14.5 retina TATGTATTTG (2) 1.8 0.0018 E16.5 retina TGTCTCTATG (3) 14.5 0.0145 E16.5 retina CAGAGTTATA (3) 1.8 0.0018 E16.5 retina GACTGTGTCC (3) 1.8 0.0018 E16.5 retina TATGTATGTG (12) 1.8 0.0018 E16.5 retina TATGTATTTG (2) 1.8 0.0018 E18.5 retina TGTCTCTATG (3) 9.1 0.0091 E18.5 retina CAGAGTTATA (3) 5.5 0.0055 E18.5 retina CATATTTTTT 3.6 0.0036 E18.5 retina GACTGTGTCC (3) 1.8 0.0018 E18.5 retina TATGTATTTG (2) 1.8 0.0018 P0.5 retina CATATTTTTT 3.9 0.0039 P0.5 retina TGTCTCTATG (3) 3.9 0.0039 P0.5 retina AAAGCTCCAC (3) 2 0.002 P0.5 retina CAGAGTTATA (3) 2 0.002 P0.5 retina GACTGTGTCC (3) 2 0.002 P0.5 retina TATGTATGTG (12) 2 0.002 P2.5 retina TGTCTCTATG (3) 12.3 0.0123 P2.5 retina CATATTTTTT 3.5 0.0035 P2.5 retina GACTGTGTCC (3) 3.5 0.0035 P2.5 retina CAGAGTTATA (3) 1.8 0.0018 P2.5 retina GACTGTGTCG (5) 1.8 0.0018 P2.5 retina TATGTATTTG (2) 1.8 0.0018 P4.5 retina GACTGTGTCC (3) 5.9 0.0059 P4.5 retina TATGTATTTG (2) 5.9 0.0059 P4.5 retina TGTCTCTATG (3) 4 0.004 P4.5 retina AAAGCTCCAC (3) 2 0.002 P4.5 retina CAGAGTTATA (3) 2 0.002 P6.5 retina TGTCTCTATG (3) 5 0.005 P6.5 retina AAAGCTCCAC (3) 3.3 0.0033 P6.5 retina CATATTTTTT 3.3 0.0033 P6.5 retina CAGAGTTATA (3) 1.7 0.0017 P6.5 retina GACTGTGTCC (3) 1.7 0.0017 P10.5 crx- retina TATGTATTTG (2) 7.4 0.0074 P10.5 crx- retina TGTCTCTATG (3) 5.6 0.0056 P10.5 crx- retina TATGTATGTG (12) 3.7 0.0037 P10.5 crx- retina CAGAGTTATA (3) 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina TATGTATTTG (2) 7.7 0.0077 P10.5 crx+ retina TGTCTCTATG (3) 7.7 0.0077 P10.5 crx+ retina CAGAGTTATA (3) 3.8 0.0038 P10.5 crx+ retina AAAGCTCCAC (3) 1.9 0.0019 Adult retinal AAAGCTCCAC (3) 1.9 0.0019 Adult retinal TATGTATGTG (12) 1.9 0.0019 Adult retinal TATGTATTTG (2) 1.9 0.0019 Adult retinal TGTCTCTATG (3) 1.9 0.0019 ONL CAGAGTTATA (3) 3.8 0.0038 ONL TATGTATTTG (2) 1.9 0.0019