Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.25366	Rnf44	ring finger protein 44	13		105239
Human Homolog	RNF44[ring finger protein 44]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 86 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CAGAGTTATA (2) CATATTTTTT GACTGTGTCG TATGTATTTG TGTCTCTATG 9.7 0.0097 Cb medulloblastoma CAGAGTTATA (2) GACTGTGTCC TATGTATTTG TGTCTCTATG 20.8 0.0208 P8 GC+1d culture CATATTTTTT GACTGTGTCG TATGTATTTG TGTCTCTATG 11.3 0.0113 P8 GC+SHH+1d culture AAAGCTCCAC CAGAGTTATA (2) TATGTATTTG TGTCTCTATG 10.6 0.0106 3T3 fibroblasts TGTCTCTATG 3.5 0.0035 E15 cortex GACTGTGTCC TATGTATTTG 9.8 0.0098 P1 cortex TATGTATTTG TGTCTCTATG 9 0.009 Hypothalamus AAAGCTCCAC CATATTTTTT GACTGTGTCC GACTGTGTCG TATGTATTTG TGTCTCTATG 19.8 0.0198 E12.5 retina AAAGCTCCAC GACTGTGTCC GACTGTGTCG TATGTATGTG (2) TATGTATTTG TGTCTCTATG 20.8 0.0208 E14.5 retina CAGAGTTATA (2) CATATTTTTT GACTGTGTCC TATGTATGTG (2) TATGTATTTG TGTCTCTATG 25.4 0.0254 E16.5 retina CAGAGTTATA (2) GACTGTGTCC TATGTATGTG (2) TATGTATTTG TGTCTCTATG 21.7 0.0217 E18.5 retina CAGAGTTATA (2) CATATTTTTT GACTGTGTCC TATGTATTTG TGTCTCTATG 21.8 0.0218 P0.5 retina AAAGCTCCAC CAGAGTTATA (2) CATATTTTTT GACTGTGTCC TATGTATGTG (2) TGTCTCTATG 15.8 0.0158 P2.5 retina CAGAGTTATA (2) CATATTTTTT GACTGTGTCC GACTGTGTCG TATGTATTTG TGTCTCTATG 24.7 0.0247 P4.5 retina AAAGCTCCAC CAGAGTTATA (2) GACTGTGTCC TATGTATTTG TGTCTCTATG 19.8 0.0198 P6.5 retina AAAGCTCCAC CAGAGTTATA (2) CATATTTTTT GACTGTGTCC TGTCTCTATG 15 0.015 P10.5 crx- retina CAGAGTTATA (2) TATGTATGTG (2) TATGTATTTG TGTCTCTATG 18.6 0.0186 P10.5 crx+ retina AAAGCTCCAC CAGAGTTATA (2) TATGTATTTG TGTCTCTATG 21.1 0.0211 Adult retinal AAAGCTCCAC TATGTATGTG (2) TATGTATTTG TGTCTCTATG 7.6 0.0076 ONL CAGAGTTATA (2) TATGTATTTG 5.7 0.0057