Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.258985 D16Bwg1543eDNA segment, Chr 16, Brigham & Women's Genetics 1543 expressed 16  16 19.6 cM  52910 
 Mm.258985 2610529H08RikRIKEN cDNA 2610529H08 gene 16    67501 
 Human Homolog C3orf6[chromosome 3 open reading frame 6]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 83 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAATAATGTA (3)
AGAGCAGCTC (4)
CATTCCACGT (2)
CCTATCCTAG
TGCTGTTAAC (3)
TTCTCATAAG (2)
21.30.0213
Cb medulloblastomaAAATAATGTA (3)
AGAGCAGCTC (4)
GCCAGAGCAC (4)
TGCTGTTAAC (3)
16.10.0161
P8 GC+1d cultureAAAAATACAG (2)
AAATAATGTA (3)
CATTCCACGT (2)
CCTATCTAGA (3)
GCCAGAGCAC (4)
GTGATATGTA (3)
TGCTGTTAAC (3)
TGGTTGAGGT (2)
TTCTCATAAG (2)
27.10.0271
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAATACAG (2)
AGAGCAGCTC (4)
CATTCCACGT (2)
CCTATCCTAG
CCTATCTAGA (3)
GTGATATGTA (3)
TGCTGTTAAC (3)
TTCTCATAAG (2)
25.80.0258
3T3 fibroblastsAAATAATGTA (3)
GCCAGAGCAC (4)
GTCATAGCTG (2)
17.50.0175
E15 cortexGTCATAGCTG (2)
TGCTGTTAAC (3)
TTCTCATAAG (2)
14.70.0147
P1 cortexTTCTCATAAG (2)
4.50.0045
HypothalamusAAATAATGTA (3)
TGCTGTTAAC (3)
7.20.0072
E12.5 retinaAAATAATGTA (3)
GTGATATGTA (3)
TTCTCATAAG (2)
TTTTTAAAAG (3)
9.50.0095
E14.5 retinaAAATAATGTA (3)
CCTATCCTAG
TGCTGTTAAC (3)
TTCTCATAAG (2)
21.80.0218
E16.5 retinaCCTATCCTAG
TGCTGTTAAC (3)
14.50.0145
E18.5 retinaCCTATCCTAG
TGCTGTTAAC (3)
12.70.0127
P0.5 retinaAAAAATACAG (2)
CCTATCCTAG
GTCATAGCTG (2)
TGCTGTTAAC (3)
TGGTTGAGGT (2)
TTCTCATAAG (2)
21.70.0217
P2.5 retinaCCTATCCTAG
CCTATCTAGA (3)
GCCAGAGCAC (4)
GTCATAGCTG (2)
TGCTGTTAAC (3)
21.20.0212
P4.5 retinaCCTATCCTAG
GTCATAGCTG (2)
TGCTGTTAAC (3)
13.90.0139
P6.5 retinaAAATAATGTA (3)
CCTATCCTAG
CCTATCTAGA (3)
GCCAGAGCAC (4)
GTCATAGCTG (2)
TGCTGTTAAC (3)
TTCTCATAAG (2)
23.30.0233
P10.5 crx- retinaCCTATCCTAG
CCTATCTAGA (3)
TGCTGTTAAC (3)
TTTTTAAAAG (3)
31.70.0317
P10.5 crx+ retinaCCTATCCTAG
GCCAGAGCAC (4)
TGCTGTTAAC (3)
TGGTTGAGGT (2)
15.30.0153
Adult retinalAAATAATGTA (3)
CCTATCCTAG
GTCATAGCTG (2)
TGCTGTTAAC (3)
14.90.0149
ONLGTCATAGCTG (2)
TTTTTAAAAG (3)
7.60.0076