Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.262294 AW556556expressed sequence AW556556 17    106817 
 Mm.262294 Dep1diabetic embryopathy 1 17    170624 
 Mm.262294 Qkquaking 17  17 5.9 cM  19317 
 Gene Ontology cytoplasm | locomotory behavior | muscle cell differentiation | nerve ensheathment | nucleic acid binding | nucleus | RNA binding | spermatogenesis | vasculogenesis
 Human Homolog QKI[quaking homolog, KH domain RNA binding (mouse)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 66 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACTTTTGGAA (4)
CTGTGTATGT (3)
GCTTTTACAT (3)
GTGACCTCTC (3)
TAATGAAATT (3)
TTGTTTGTAA (3)
24.40.0244
Cb medulloblastomaACTTTTGGAA (4)
TAAGATAATG (3)
TAATTTTGGA (4)
TCAAGTGAGC (3)
TTGTTTGTAA (3)
48.50.0485
P8 GC+1d cultureGTGACCTCTC (3)
TAAGATAATG (3)
TAATGAAATT (3)
TTGTTTGTAA (3)
7.90.0079
P8 GC+SHH+1d cultureGTGACCTCTC (3)
TAAGATAATG (3)
TAATGAAATT (3)
TAATTTTGGA (4)
TCAAGTGAGC (3)
TTGTTTGTAA (3)
11.80.0118
E15 cortexACTTTTGGAA (4)
TAATGAAATT (3)
14.80.0148
P1 cortexCTGTGTATGT (3)
TAATGAAATT (3)
22.70.0227
HypothalamusACTTTTGGAA (4)
CCTGCCTGCT (4)
GCTTTTACAT (3)
GTGACCTCTC (3)
TAAGATAATG (3)
TCAAGTGAGC (3)
TTGTTTGTAA (3)
28.90.0289
E12.5 retinaACTTTTGGAA (4)
GCAGAGGATG (4)
TAAGATAATG (3)
TCAAGTGAGC (3)
TTGTTTGTAA (3)
20.70.0207
E14.5 retinaGCAGAGGATG (4)
TAAGATAATG (3)
3.60.0036
E16.5 retinaTAAGATAATG (3)
TAATGAAATT (3)
3.60.0036
E18.5 retinaCCTGCCTGCT (4)
GCTTTTACAT (3)
TAAGATAATG (3)
TAATGAAATT (3)
TTGTTTGTAA (3)
14.50.0145
P0.5 retinaGCTTTTACAT (3)
GTGACCTCTC (3)
TAATGAAATT (3)
TCAAGTGAGC (3)
TTGTTTGTAA (3)
11.90.0119
P2.5 retinaACTTTTGGAA (4)
GCTTTTACAT (3)
TAAGATAATG (3)
TAATGAAATT (3)
TCAAGTGAGC (3)
TTGTTTGTAA (3)
17.80.0178
P4.5 retinaCCTGCCTGCT (4)
TTGTTTGTAA (3)
9.90.0099
P6.5 retinaTAAGATAATG (3)
TAATGAAATT (3)
TTGTTTGTAA (3)
6.70.0067
P10.5 crx- retinaACTTTTGGAA (4)
1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTAATGAAATT (3)
TTGTTTGTAA (3)
3.80.0038
ONLCTGTGTATGT (3)
1.90.0019